EBI Dbfetch

ID   AJ011856; SV 1; circular; genomic DNA; STD; FUN; 85779 BP.
XX
AC   AJ011856;
XX
PR   Project:13838;
XX
DT   15-JAN-1999 (Rel. 58, Created)
DT   30-JUN-2009 (Rel. 101, Last updated, Version 8)
XX
DE   Saccharomyces cerevisiae complete mitochondrial genome
XX
KW   complete genome.
XX
OS   Saccharomyces cerevisiae (baker's yeast)
OC   Eukaryota; Fungi; Dikarya; Ascomycota; Saccharomycotina; Saccharomycetes;
OC   Saccharomycetales; Saccharomycetaceae; Saccharomyces.
OG   Mitochondrion
XX
RN   [1]
RX   DOI; 10.1016/S0014-5793(98)01467-7
RX   PUBMED; 9872396.
RA   Foury F., Roganti T., Lecrenier N., Purnelle B.;
RT   "The complete sequence of the mitochondrial genome of Saccharomyces
RT   cerevisiae";
RL   FEBS Lett. 440(3):325-331(1998).
XX
RN   [2]
RP   1-85779
RA   MIPS;
RT   ;
RL   Submitted (16-DEC-1998) to the EMBL/GenBank/DDBJ databases.
RL   Data collected by MIPS on behalf of the European yeast mitochondrial genome
RL   sequencing project. MIPS at the Max-Planck-Institut fuer Biochemie, Am
RL   Klopferspitz 18a D-82152 Martinsried, Germany; E-mail:
RL   Mewes@mips.biochem.mpg.de
XX
DR   GR; AJ011856_GR.
DR   RFAM; RF00029; Intron_gpII.
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..85779
FT                   /organism="Saccharomyces cerevisiae"
FT                   /organelle="mitochondrion"
FT                   /strain="FY1679, isogenic derivative of S288C"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /db_xref="taxon:4932"
FT   rRNA            1..11
FT                   /note="9S ribosomal RNA"
FT   tRNA            731..802
FT                   /gene="tP(TGG)Q - systematic name"
FT                   /note="tRNA-Pro - common name"
FT                   /note="anticodon gene: TGG"
FT   CDS             3952..4338
FT                   /transl_table=3
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FT                   /protein_id="CAA09821.1"
FT                   /translation="MYYIMFLYNMLLIIILIFYSIVGVPIIIFNNNYYWDPDIFLFIIY
FT                   YFIKFIIIFNLYLYYMINYIVYTPSGSPPGRGTYILLYNMLYSYNMFIDYVMKFITCVT
FT                   YMYLMFWLLSPTPSPYYVSEVPVS"
FT   rep_origin      complement(4012..4312)
FT                   /note="ori1"
FT   CDS             4254..4415
FT                   /transl_table=3
FT                   /note="ORF Q0017"
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FT                   /protein_id="CAA09822.1"
FT                   /translation="MCATYMFNITVIITHPTPTLRTRGPGFVRNRDLYIYKYKSNLINN
FT                   LNNMTYIL"
FT   rRNA            6546..8194
FT                   /note="15S ribosomal RNA"
FT   tRNA            9374..9447
FT                   /gene="tW(TCA)Q - systematic name"
FT                   /note="tRNA-Trp1 - common name"
FT                   /note="anticodon gene: TCA"
FT   CDS             11667..11957
FT                   /transl_table=3
FT                   /note="ORF Q0032"
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FT                   LYKSYFIFIFIWTNNNYNNNYWYVTMLMNTYLYYNMNIHFLTINKKFLYSL"
FT   rep_origin      complement(12510..12780)
FT                   /note="ori8"
FT   CDS             join(13818..13986,16435..16470,18954..18991,20508..20984,
FT                   21995..22246,23612..23746,25318..25342,26229..26701)
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="COX1"
FT                   /note="ORF Q0045"
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FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:P00401"
FT                   /protein_id="CAA09824.1"
FT                   /translation="MVQRWLYSTNAKDIAVLYFMLAIFSGMAGTAMSLIIRLELAAPGS
FT                   QYLHGNSQLFNVLVVGHAVLMIFFLVMPALIGGFGNYLLPLMIGATDTAFPRINNIAFW
FT                   VLPMGLVCLVTSTLVESGAGTGWTVYPPLSSIQAHSGPSVDLAIFALHLTSISSLLGAI
FT                   NFIVTTLNMRTNGMTMHKLPLFVWSIFITAFLLLLSLPVLSAGITMLLLDRNFNTSFFE
FT                   VSGGGDPILYEHLFWFFGHPEVYILIIPGFGIISHVVSTYSKKPVFGEISMVYAMASIG
FT                   LLGFLVWSHHMYIVGLDADTRAYFTSATMIIAIPTGIKIFSWLATIHGGSIRLATPMLY
FT                   AIAFLFLFTMGGLTGVALANASLDVAFHDTYYVVGHFHYVLSMGAIFSLFAGYYYWSPQ
FT                   ILGLNYNEKLAQIQFWLIFIGANVIFFPMHFLGINGMPRRIPDYPDAFAGWNYVASIGS
FT                   FIATLSLFLFIYILYDQLVNGLNNKVNNKSVIYNKAPDFVESNTIFNLNTVKSSSIEFL
FT                   LTSPPAVHSFNTPAVQS"
FT   CDS             13818..16322
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="SCAI1"
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FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:P03875"
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FT                   QYLHGNSQLFNGAPTSAYISLMRTALVLWIINRYLKHMTNSVGANFTGTMACHKTPMIS
FT                   VGGVKCYMVRLTNFLQVFIRITISSYHLDMVKQVWLFYVEVIRLWFIVLDSTGSVKKMK
FT                   DTNNTKGNTKSEGSTERGNSGVDRGMVVPNTQMKMRFLNQVRYYSVNNNLKMGKDTNIE
FT                   LSKDTSTSDLLEFEKLVMDNMNEENMNNNLLSIMKNVDMLMLAYNRIKSKPGNMTPGTT
FT                   LETLDGMNMMYLNKLSNELGTGKFKFKPMRMVNIPKPKGGMRPLSVGNPRDKIVQEVMR
FT                   MILDTIFDKKMSTHSHGFRKNMSCQTAIWEVRNMFGGSNWFIEVDLKKCFDTISHDLII
FT                   KELKRYISDKGFIDLVYKLLRAGYIDEKGTYHKPMLGLPQGSLISPILCNIVMTLVDNW
FT                   LEDYINLYNKGKVKKQHPTYKKLSRMIAKAKMFSTRLKLHKERAKGPTFIYNDPNFKRM
FT                   KYVRYADDILIGVLGSKNDCKMIKRDLNNFLNSLGLTMNEEKTLITCATETPARFLGYN
FT                   ISITPLKRMPTVTKTIRGKTIRSRNTTRPIINAPIRDIINKLATNGYCKHNKNGRMGVP
FT                   TRVGRWTYEEPRTIINNYKALGRGILNYYKLATNYKRLRERIYYVLYYSCVLTLASKYR
FT                   LKTMSKTIKKFGYNLNIIENDKLIANFPRNTFDNIKKIENHGMFMYMSEAKVTDPFEYI
FT                   DSIKYMLPTAKANFNKPCSICNSTIDVEMHHVKQLHRGMLKATKDYITGRMITMNRKQI
FT                   PLCKQCHIKTHKNKFKNMGPGM"
FT   intron          13987..16434
FT                   /note="COX1 intron 1 (ai1)"
FT                   /note="group II intron"
FT   CDS             join(13818..13986,16435..18830)
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="SCAI2"
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FT                   /translation="MVQRWLYSTNAKDIAVLYFMLAIFSGMAGTAMSLIIRLELAAPGS
FT                   QYLHGNSQLFNVLVVGHAVLMIFCAPFRLIYHCIEVLIDKHISVYSINENFTVSFWFWL
FT                   LVVTYMVFRYVNHMAYPVGANSTGTMACHKSAGVKQPAQGKNCPMARLTNSCKECLGFS
FT                   LTPSHLGIVIHAYVLEEEVHELTKNESLALSKSWHLEGCTSSNGKLRNTGLSERGNPGD
FT                   NGVFMVPKFNLNKVRYFSTLSKLNARKEDSLAYLTKINTTDFSELNKLMENNHNKTETI
FT                   NTRILKLMSDIRMLLIAYNKIKSKKGNMSKGSNNITLDGINISYLNKLSKDINTNMFKF
FT                   SPVRRVEIPKTSGGFRPLSVGNPREKIVQESMRMMLEIIYNNSFSYYSHGFRPNLSCLT
FT                   AIIQCKNYMQYCNWFIKVDLNKCFDTIPHNMLINVLNERIKDKGFMDLLYKLLRAGYVD
FT                   KNNNYHNTTLGIPQGSVVSPILCNIFLDKLDKYLENKFENEFNTGNMSNRGRNPIYNSL
FT                   SSKIYRCKLLSEKLKLIRLRDHYQRNMGSDKSFKRAYFVRYADDIIIGVMGSHNDCKNI
FT                   LNDINNFLKENLGMSINMDKSVIKHSKEGVSFLGYDVKVTPWEKRPYRMIKKGDNFIRV
FT                   RHHTSLVVNAPIRSIVMKLNKHGYCSHGILGKPRGVGRLIHEEMKTILMHYLAVGRGIM
FT                   NYYRLATNFTTLRGRITYILFYSCCLTLARKFKLNTVKKVILKFGKVLVDPHSKVSFSI
FT                   DDFKIRHKMNMTDSNYTPDEILDRYKYMLPRSLSLFSGICQICGSKHDLEVHHVRTLNN
FT                   AANKIKDDYLLGRMIKMNRKQITICKTCHFKVHQGKYNGPGL"
FT   intron          16471..18953
FT                   /note="COX1 intron 2 (ai2)"
FT                   /note="group II intron"
FT   CDS             join(13818..13986,18954..19996)
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="I-SCEIII"
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FT                   QYLHGNSQLFNVLVMPALIGGFGNQKRYESNNNNNQVMENKEYNLKLNYDKLGPYLAGL
FT                   IEGDGTITVQNSSSMKKSKYRPLIVVVFKLEDLELANYLCNLTKCGKVYKKINRNYVLW
FT                   TIHDLKGVYTLLNIINGYMRTPKYEAFVRGAEFMNNYINSTTITHNKLKNMDNIKIKPL
FT                   DTSDIGSNAWLAGMTDADGNFSINLMNGKNRSSRAMPYYCLELRQNYQKNSNNNNINFS
FT                   YFYIMSAIATYFNVNLYSRERNLNLLVSTNNTYKTYYSYKVMVANTYKNIKVMEYFNKY
FT                   SLLSSKHLDFLDWSKLVILINNEGQSMKTNGSWELGMNLRKDYNKTRTTFTWSHLKNTY
FT                   LENK"
FT   intron          18992..20507
FT                   /note="COX1 intron 3 (ai3)"
FT                   /note="group I intron"
FT   CDS             join(13818..13986,18954..18991,20508..21935)
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="I-SCEII"
FT                   /note="ORF Q0065"
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FT                   /protein_id="CAA09828.1"
FT                   /translation="MVQRWLYSTNAKDIAVLYFMLAIFSGMAGTAMSLIIRLELAAPGS
FT                   QYLHGNSQLFNVLVMPALIGGFGNYLLPLMIGATDTAFPRINNIAFWVLPMGLVCLVTS
FT                   TLVESGAGTGWTVYPPLSSIQAHSGPSVDLAIFALHLTSISSLLGAINFIVTTLNMRTN
FT                   GMTMHKLPLFVWSIFITAFLLLLSLPVLSAGITMLLLDRNFNTSFFEVSGGGDPILYEH
FT                   LFWFFGQTVATIIMLMMYNDMHFSKCWKLLKKWITNIMSTLFKALFVKMFMSYNNQQDK
FT                   MMNNTMLKKDNIKRSSETTRKMLNNSMNKKFNQWLAGLIDGDGYFGIVSKKYVSLEITV
FT                   ALEDEMALKEIQNKFGGSIKLRSGVKAIRYRLTNKTGMIKLINAVNGNIRNTKRLVQFN
FT                   KVCILLGIDFIYPIKLTKDNSWFVGFFDADGTINYSFKNNHPQLTISVTNKYLQDVQEY
FT                   KNILGGNIYFDKSQNGYYKWSIQSKDMVLNFINDYIKMNPSRTTKMNKLYLSKEFYNLK
FT                   ELKAYNKSSDSMQYKAWLNFENKWKNK"
FT   exon            18954..18991
FT   intron          20985..21994
FT                   /note="group I intron (not self-splicing in vitro)"
FT                   /note="COX1 intron 4 (ai4)"
FT   CDS             22247..23167
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="SCAI5alpha"
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FT                   /translation="MNPFSKDKNKNKNKKLIRNYQKMNNNNMMKTYLNNNNMIMMNMYK
FT                   GNLYDIYPRSNRNYIQPNNINKELVVYGYNLESCVGMPTYTNIVKHMVGIPNNILYIMT
FT                   GILLTDGWIDYTSKKDLDKKTIMEINCRFRLKQSMIHSEYLMYVFMLLSHYCMSYPKMK
FT                   IAKVKGKSYNQLEFYTRSLPCFTILRYMFYNGRVKIVPNNLYDLLNYESLAHMIMCDGS
FT                   FVKGGGLYLNLQSFTTKELIFIMNILKIKFNLNCTLHKSRNKYTIYMRVESVKRLFPMI
FT                   YKYILPSMRYKFDIMLWQKKYNMIN"
FT   CDS             join(13818..13986,16435..16470,18954..18991,20508..20984,
FT                   21995..23167)
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="SCAI5alpha"
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FT                   /translation="MVQRWLYSTNAKDIAVLYFMLAIFSGMAGTAMSLIIRLELAAPGS
FT                   QYLHGNSQLFNVLVVGHAVLMIFFLVMPALIGGFGNYLLPLMIGATDTAFPRINNIAFW
FT                   VLPMGLVCLVTSTLVESGAGTGWTVYPPLSSIQAHSGPSVDLAIFALHLTSISSLLGAI
FT                   NFIVTTLNMRTNGMTMHKLPLFVWSIFITAFLLLLSLPVLSAGITMLLLDRNFNTSFFE
FT                   VSGGGDPILYEHLFWFFGHPEVYILIIPGFGIISHVVSTYSKKPVFGEISMVYAMASIG
FT                   LLGFLVWSHHMYIVGLDADTRAYFTSATMIIAIPTGIKIFSWLMNPFSKDKNKNKNKKL
FT                   IRNYQKMNNNNMMKTYLNNNNMIMMNMYKGNLYDIYPRSNRNYIQPNNINKELVVYGYN
FT                   LESCVGMPTYTNIVKHMVGIPNNILYIMTGILLTDGWIDYTSKKDLDKKTIMEINCRFR
FT                   LKQSMIHSEYLMYVFMLLSHYCMSYPKMKIAKVKGKSYNQLEFYTRSLPCFTILRYMFY
FT                   NGRVKIVPNNLYDLLNYESLAHMIMCDGSFVKGGGLYLNLQSFTTKELIFIMNILKIKF
FT                   NLNCTLHKSRNKYTIYMRVESVKRLFPMIYKYILPSMRYKFDIMLWQKKYNMIN"
FT   exon            16435..16470
FT   exon            20508..20984
FT   intron          22247..23611
FT                   /note="COX1 intron 5_alpha (ai5-alpha)"
FT                   /note="group I intron"
FT   intron          23747..25317
FT                   /note="COX1 intron 5-beta (ai5-beta)"
FT                   /note="group I intron"
FT   CDS             join(24156..24870,24906..25255)
FT                   /transl_table=3
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FT                   DIKNLYESIMNNYINILNKYTININKDNINKLKFLDNYTEEEKGYYLSGLFEGDGNIYT
FT                   RCFSITFSLEDVLLANYLCTYFKIGHITAKYNFNKELTAVKWNIMKKKEQEVFMNYING
FT                   KLLTYKRYDQYFKYNFNNRLNIKLLKPKEFDLTLNPWLTGFNDADGYFYTGFQKHKNSQ
FT                   WLKFHLELSQKDSYILDIIKKYFKTGGILKRDYKSGATAYIYKAQSSKAMKPFIEYFNN
FT                   YQPLSTRRYKQYLLLNIAYLLKLNKLHMLTNSLLMLKELMLLQSVKNMSLEMKNELNNR
FT                   VKIIINKTHYNNIE"
FT   intron          25343..26228
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FT                   /note="group II intron"
FT   CDS             27666..27812
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FT                   VLLVITSLYTLTNNNNKIIGSRWLISQEAIYDTIMNMTKGQIGGKNWGLYFPMIFTLFM
FT                   FIFIANLISMIPYSFALSAHLVFIISLSIVIWLGNTILGLYKHGWVFFSLFVPAGTPLP
FT                   LVPLLVIIETLSYFARAISLGLRLGSNILAGHLLMVILAGLTFNFMLINLFTLVFGFVP
FT                   LAMILAIMMLEFAIGIIQGYVWAILTASYLKDAVYLH"
FT   rep_origin      30220..30594
FT                   /note="ori7"
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FT                   /transl_table=3
FT                   /note="ORF Q0092"
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FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:Q35811"
FT                   /protein_id="CAA09833.1"
FT                   /translation="MFMMNNNMFIMFMIMYNVMRVNITRCSRVMFTTFYMITNKYIYIF
FT                   M"
FT   rep_origin      32231..32501
FT                   /note="ori2"
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FT                   /gene="tE(TTC)Q - systematic name"
FT                   /note="tRNA-Glu - common name"
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FT                   42508..42558,43297..43647)
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="CYTB"
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FT                   SYRSPRVTLWNVGVIIFILTIATAFLGYCCVYGQMSHWGATVITNLFSAIPFVGNDIVS
FT                   WLWGGFSVSNPTIQRFFALHYLVPFIIAAMVIMHLMALHIHGSSNPLGITGNLDRIPMH
FT                   SYFIFKDLVTVFLFMLILALFVFYSPNTLGHPDNYIPGNPLVTPASIVPEWYLLPFYAI
FT                   LRSIPDKLLGVITMFAAILVLLVLPFTDRSVVRGNTFKVLSKFFFFIFVFNFVLLGQIG
FT                   ACHVEVPYVLMGQIATFIYFAYFLIIVPVISTIENVLFYIGRVNK"
FT   CDS             join(36540..36954,37723..38579)
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="SCBI2"
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FT                   /translation="MAFRKSNVYLSLVNSYIIDSPQPSSINYWWNMGSLLGLCLVIQIV
FT                   TGIFMAMHYSSNIELAFSSVEHIMRDVHNGYILRYLHANGASFFFMVMFMHMAKGLYYG
FT                   SYRSPRVTLWNVGVIIFILTIATAFLGYCCVYGQMSHWGNMNIASNMFNMMKTIYMMML
FT                   MLLIYIFYTIMMRQMMKTKEYTMLIKSMDYINKNKYMINLNMTNKKDMNNNIGPLNMNI
FT                   LSIIYGSMLGDGHAEKRKGGKGTRIVFQQEYCNINYLYYLHSLLANLGYCNTNLPLIKT
FT                   RLGKKGKIRQYLKFNTWTYDSFNMIYSEWYIKNMSGKGNIKVIPKSLDNYLTPLALAIW
FT                   IMDDGCKLGKGLKFTTNCFSYKDVQYLTYLLHNKYNIKSTITKGNKENTQFVIYVWKES
FT                   MPILTKIVSPYIIPSMKYKLGNYL"
FT   intron          36955..37722
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FT                   /note="no expressed ORF within bI1"
FT   intron          37737..39140
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FT                   /translation="MAFRKSNVYLSLVNSYIIDSPQPSSINYWWNMGSLLGLCLVIQIV
FT                   TGIFMAMHYSSNIELAFSSVEHIMRDVHNGYILRYLHANGASFFFMVMFMHMAKGLYYG
FT                   SYRSPRVTLWNVGVIIFILTIATAFLGYCCVYGQMSHWGATVITNLFSAIPFVGNDIVS
FT                   WLWGGFNMEDPYYSNMMLNKSVLCWNIFIWMMNYYIIQLIIYNNMIWNKNNMVKMFIMR
FT                   RKLAVINMYMYMKLIIQRTYSYYMNNTIIYDKNHKLNTDNPIYAYIGGLFEGDGWITIS
FT                   KKGKYLLYELGIEMHIRDIQLLYKIKNILGIGKVTIKKLKMKDGTIKEMCKFNVRNKNH
FT                   LKNIIIPIFDKYPMLTNKHYDYLYFKDNLLKDIKYYNDLSYYLRPIKPFNTTEDILNKN
FT                   YFSSWLIGFFEAESCFSIYKPMNKKMKTASFEVSQNNSMEVMLAIKSYLKITQNIYTDK
FT                   FNNSRMTTKSINGIKNVVMFINNNPIKLLGYKKLQYLLFLKDLRTITKYNNYFKIPPKY
FT                   "
FT   intron          39218..40840
FT                   /note="CYTB intron 3 (bi3)"
FT                   /note="group I intron"
FT   CDS             join(36540..36954,37723..37736,39141..39217,40841..42251)
FT                   /transl_table=3
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FT                   /protein_id="CAA09837.1"
FT                   /translation="MAFRKSNVYLSLVNSYIIDSPQPSSINYWWNMGSLLGLCLVIQIV
FT                   TGIFMAMHYSSNIELAFSSVEHIMRDVHNGYILRYLHANGASFFFMVMFMHMAKGLYYG
FT                   SYRSPRVTLWNVGVIIFILTIATAFLGYCCVYGQMSHWGATVITNLFSAIPFVGNDIVS
FT                   WLWGGFSVSNPTIQRFFALHYLVPFIIAAMVIMHLMALHIHGSSNPLGITGNLDRIPMH
FT                   SYFIFKDLVTVFLFMLILALFVFYSPNTLGQNMALLLITYVINILCAVCWKSLFIKYQW
FT                   KIYNKTTYYFIIQNILNTKQLNNFVLKFNWTKQYNKMNIVSDLFNPNRVKYYYKEDNQQ
FT                   VTNMNSSNTHLTSNKKNLLVDTSETTRTTKNKFNYLLNIFNMKKMNQIITKRHYSIYKD
FT                   SNIRFNQWLAGLIDGDGYFCITKNKYASCEITVELKDEKMLRQIQDKFGGSVKLRSGVK
FT                   AIRYRLQNKEGMIKLINAVNGNIRNSKRLVQFNKVCILLNIDFKEPIKLTKDNAWFMGF
FT                   FDADGTINYYYSGKLKIRPQLTISVTNKYLHDVEYYREVFGGNIYFDKAKNGYFKWSIN
FT                   NKELHNIFYTYNKSCPSKSNKGKRLFLIDKFYYLYDLLAFKAPHNTALYKAWLKFNEKW
FT                   NNN"
FT   exon            37723..37736
FT   exon            39141..39217
FT   intron          41091..42507
FT                   /note="group I intron (not self-splicing in vitro)"
FT                   /note="CYTB intron 4 (bi4)"
FT                   /note="group I intron"
FT   intron          42559..43296
FT                   /note="CYTB intron 5 (bi5)"
FT                   /note="bI5 is excised by Cbp2p under physiological
FT                   conditions"
FT                   /note="group I intron"
FT   rep_origin      45227..47927
FT                   /note="ori6"
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FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="ATP9"
FT                   /note="ORF Q0130"
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FT                   /db_xref="SGD:S000007274"
FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:P61829"
FT                   /protein_id="CAA09838.1"
FT                   /translation="MQLVLAAKYIGAGISTIGLLGAGIGIAIVFAALINGVSRNPSIKD
FT                   TVFPMAILGFALSEATGLFCLMVSFLLLFGV"
FT   tRNA            48201..48290
FT                   /gene="tS(TGA)Q2 - systematic name"
FT                   /note="tRNA-Ser - common name"
FT                   /note="anticodon gene: TGA"
FT   CDS             48901..50097
FT                   /transl_table=3
FT                   /gene="VAR1"
FT                   /note="ORF Q0140"
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FT                   /protein_id="CAA09839.1"
FT                   /translation="MKLKLLNMILSMMNKTNNNNNIIINNTLDSLMNKKLLLKNMLLDM
FT                   NNKKMNNMKRMLNNNNMNPAGANPVVHRIGPAGNINNKLQHLNNMNNWNTQIYNYNKNM
FT                   EIMNTMNDKLINKLLYKMMTLKLNNMNINKIIMSKTINQHSLNKLNIKFYYYNNDINNN
FT                   NNNNNNNYYMNMMNKLMNIMNNNMNNNLCNILSYYYKKKVTIEPIKLSYIYLNSDIFSK
FT                   YISLNDMDKYNNGILTNYQRMLNNIMPKLNDHNISMNYINNINNINNNKYNNMINLLNN
FT                   NNNINNNNNYNNNNNNYIGNINNIYNNMTIDNIPMDILMYKYLVGWSIKFKGRLSNNNG
FT                   RTSTTNLLNGTFNNKKYLWSNINNNYKLNYIPSNHNLYNNSNINKNGKYNIKVKLNFI"
FT   CDS             51052..51228
FT                   /transl_table=3
FT                   /note="ORF Q0142"
FT                   /db_xref="GOA:Q9ZZW4"
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FT                   KMYIH"
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FT                   KHQAFNKLANLFIVNNKKTIPNNLVENYLTPMSLAYWFMDDGGKWDYNKNSTNKSIVLN
FT                   TQSFTFEEVEYLVKGLRNKFQLNCYVKINKNKPIIYIDSMSYLIFYNLIKPYLIPQMMY
FT                   KLPNTISSETFLK"
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FT                   YTINSYFGGIGRHDTTKMYYFTVWRFKSFK"
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FT   tRNA            69846..69921
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FT                   YLLVILGLVSWMLYTIVMTYSKNPIAYKYIKHGQTIEVIWTIFPAVILLIIAFPSFILL
FT                   YLCDEVISPAMTIKAIGYQWYWKYEYSDFINDSGETVEFESYVIPDELLEEGQLRLLDT
FT                   DTSMVVPVDTHIRFVVTAADVIHDFAIPSLGIKVDATPGRLNQVSALIQREGVFYGACS
FT                   ELCGTGHANMPIKIEAVSLPKFLEWLNEQ"
FT   CDS             join(74495..75622,75663..75872,75904..75984)
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FT                   YIKNMNIIKRGYHTSLNNKLIIVQKDNKNNNKNNLEMDNFYKWLVGFTDGDGSFYIKLN
FT                   DKKYLRFFYGFRMHIDDKACLEKIRNMLNMPSNFEETTKTIMLVNSQKKWLYSNIVTIF
FT                   DKYPCLTIKYYSYYKWKMAMINNLNGMSYNNKDLLNIKNTINNYEVMPNLKIPYDKMND
FT                   YWILGFIEAEGSFDTSPKRNICGFNVSQHKRSINTLKAIKSYVLNNWKPIDNTPLLIKN
FT                   KLLKDWDSSIKLTKPDKNGVIKLEFNRMDFLYYVILPKLYSLKWYSRKEIDFQLWKTTM
FT                   EIYMKGLHNTTKGSNLLKLINNNINKKRYYSNYNISKNIIDDVLNMNTIYNYKLPYRMN
FT                   SDIQRLNSMNNNNTKFINVGVFVYDLNNTLIMTFTGYRPAATYFNCSKHEIAKYIKNGN
FT                   VFMNKYILKNILLD"
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FT   exon            75663..75872
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FT   intron          75873..75903
FT                   /number=2
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FT   exon            75904..75984
FT                   /number=3
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FT                   /note="tRNA-Val1 - common name"
FT                   /note="anticodon gene: TAC"
FT   CDS             79213..80022
FT                   /transl_table=3
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FT                   /protein_id="CAA09846.1"
FT                   /translation="MTHLERSRHQQHPFHMVMPSPWPIVVSFALLSLALSTALTMHGYI
FT                   GNMNMVYLALFVLLTSSILWFRDIVAEATYLGDHTMAVRKGINLGFLMFVLSEVLIFAG
FT                   LFWAYFHSAMSPDVTLGACWPPVGIEAVQPTELPLLNTIILLSSGATVTYSHHALIAGN
FT                   RNKALSGLLITFWLIVIFVTCQYIEYTNAAFTISDGVYGSVFYAGTGLHFLHMVMLAAM
FT                   LGVNYWRMRNYHLTAGHHVGYETTIIYTHVLDVIWLFLYVVFYWWGV"
FT   rep_origin      82329..82600
FT                   /note="ori5"
FT   tRNA            85035..85112
FT                   /gene="tM(CAT)Q2 - systematic name"
FT                   /note="tRNA-fMet - common name"
FT                   /note="anticodon gene: CAT"
FT   CDS             85554..85709
FT                   /transl_table=3
FT                   /note="ORF Q0297"
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FT                   /translation="MKMKTNKYMNMVRPAPPRRADPEGVRDPSTMGGGPNPFLRRSPYM
FT                   YINKKK"
FT   rRNA            85290..85779
FT                   /note="9S ribosomal RNA"
XX
SQ   Sequence 85779 BP; 36169 A; 6863 C; 7813 G; 34934 T; 0 other;
     ttcataatta attttttata tatatattat attataatat taatttatat tataaaaata        60
     atatttatta ttaaaatatt tattctcctt tcggggttcc ggctcccgtg gccgggcccc       120
     ggaattatta attaataata aattattatt aataattatt tattatttta tcattaaaat       180
     atataaataa aaaatattaa aaagataaaa aaaataatgt ttattcttta tataaattat       240
     atatatatat ataattaatt aattaattaa ttaattaata ataaaaatat aattataaat       300
     aatataaata ttattcttta ttaataaata tatatttata tattataaaa gtatcttaat       360
     taataaaaat aaacatttaa taatatgaat tatatattat tattattatt aataaaatta       420
     ttaataataa tcaatatgaa attaataaaa atcttataaa aaagtaatga atactccttt       480
     ttaaaaataa aaaggggttc ggtccccccc cttccgtata cttacgggag gggggtccct       540
     cactccttct taattaaatt atcttaatta aattatctta attaaattat cttaattaaa       600
     ttatcttaat taaattatct taattaaatt aaaaggggac tttatattta taaagtaatt       660
     atattattat tattattatt atttatttat tttattttta ttattttatt atatatatta       720
     tatattaata cagatagaag ccaaaaggtc aggcgctttc tttgggagaa agacctagtt       780
     agttcgagtc tatcctatct gataataatt taattaacca ttaaaaaaaa gtatatatat       840
     ttatcataat atattaaatt ttattacatt acaaatgaac acttttattt atatttataa       900
     aaatatgaac tccttcgggg tccgccccgc gggggcgggc cggactccat attattatta       960
     ttataattat tattataatt attattataa ttattattat aattattatt ataattaaag      1020
     agttttggat accaatatga tataatatga tataggaccg aaacccctca ttttatcatt      1080
     tatttataat attataaata aaaaaaaata ttatatatta taataaaatt aatatcataa      1140
     tatattatat tatatattat attatatata tatatatata tattctttta taaaatttat      1200
     attcttctta ttaaaattaa aaagggagcg gacttttaat tatatttaat tatagttttt      1260
     aatcattggt tgagatttca aaataaggta taatatttat attattcttt aacaaatatt      1320
     atattataaa aaaagatata atatttatat tattctttaa caaatattat attataaaaa      1380
     agatataata tttatatatt attattaata ttatttttaa gttccgaaag gagaaactta      1440
     taatttttat atcattattt attattattt ttaatttcaa ctccttttag gtatttccat      1500
     ttaactttca gcagagactt tctaattata attatatata tataaattta aatacattta      1560
     taaaaaagta tataatataa ttatattata tataataata ttattaaatg aagtattctt      1620
     tattattaat tataggatat ctggggtcca ttaataatta ttattgtaaa taataataag      1680
     gacccccccc attatctaat taataaatat ataaataatc attaataaat atattaataa      1740
     ttattaataa atatataaat aatcattaat aaatatataa ataatataat atattataaa      1800
     aatataataa taataattta ttattaaaat ataataattt attataaaaa tataataatt      1860
     tattataaaa atataataat aactcctttc ggggttcaca cctttataaa taataaataa      1920
     taaataataa ataataaata ataaatatta gtattcacta atataaaata ataattataa      1980
     aaataatcat tattaaaaat attattaatt attaaattaa atacaattaa tataatttag      2040
     ttgtttatat aattttaaat aatgtttata tcaatttaat aaaattaaat ttatagttcc      2100
     ggggcccggc cacgggagcc ggaaccccga aaggagttta tctatatatt ataataacta      2160
     tatgaattta attattaaaa ataataaaaa taaggaattt taataagaag taatatttat      2220
     tatataatat ataaaaaaaa tatatatata tatataaaaa tatatataat aagttttatt      2280
     ataatatata ttaaattaat tattatgagg ggttcggtcc ctttccgggc cccaattcat      2340
     ctcatctcat tttatttcat ttcaatatca tctaatctca tttctttata gattttacat      2400
     atatataaat ataaatataa gatattcaca tttatatata atataatata atataataga      2460
     tattcattcc tctttgatta aactaataat taataattaa taattaataa ttaataatta      2520
     ataattattc agtagaactc cttcttaaaa aggggttcgg tccccctccc attagtatag      2580
     tatagggagg ggtccctcac tccttcgggg tccgccccgc agggggcggg ccggactatt      2640
     attaaataat ttataattta ttatttatta atatatttat ataatataat ataatataat      2700
     attattcata ctttttatta atataatata atataatatt attaatactt tctcctttcg      2760
     gggttccggc tcccgtggcc gggccccgga actattaata taaagaaaag agtttcaatt      2820
     atttatttat ttatttattt tttataaaaa taagtccccg ccccggcggg gaccccgaag      2880
     gagtattaat ttaaataatt tatttaatga aattattaat tataaataaa aataataatt      2940
     tttaaagatg taatataaaa ataaatataa tataatttag gataattata taaaatattt      3000
     attatatata gtttttataa agagttttaa aagtgataat ataatatata atatttataa      3060
     gttccggggc ccggccacgg gagccggaac cccgaaagga gttatttata tatatataat      3120
     tataatctta ttaattattt atatatatat ttaatattat ttttatataa ttttatatta      3180
     aagtattata attatatatt taatattatt tttatataat tttatattat ttatttattt      3240
     atttatttat ttaaaaatat tataatcata tatttaatat tatttaatat attttatata      3300
     ttatatcttt tattgattta tatatatata gatttaataa atatatatat atatatatat      3360
     ataaatattc attatatatt tattattatt attattattt attactattt tttattatat      3420
     attaataata tatatattat tagttatggg tatcctaata gtatattatt atttttaata      3480
     ataatttatg atttatgtat aataaataag tagggaatcg gtacgaatat cgaaaggagt      3540
     tatatattat taattattta taattatttt atatattatt aattatttat aattatttta      3600
     tatatttata attattttat atagataggt tagataggat agatagtata gataggggtc      3660
     ccatttatta tttacaataa taattattaa tgggacccgg atatcttatt gttattaatt      3720
     tatatattat tcattattat taatatatat ttaatataat taaatattat attatattat      3780
     attatattat ttattaaaaa aaaatctatt acttattttt tttattaata tataaattat      3840
     ttatataatt tatcattttt atttatatat tattattttt tatatataaa ttaatatata      3900
     tatatattat atatactttt ttttttataa tatatctata tatataaata aatatattat      3960
     attatatttt tatataatat attattaatt attattttaa ttttctattc tattgtgggg      4020
     gtcccaatta ttattttcaa taataattat tattgggacc cggatatctt cttgtttatc      4080
     atttattatt ttattaaatt tattattatt tttaatttat atttatatta tataattaat      4140
     tatatcgttt atactccttc ggggtccccg ccggggcggg gactttatat tttattatat      4200
     aatatattat attcttataa tatatttatt gattatgtta taaaatttat tctatgtgtg      4260
     ctctatatat atttaatatt ctggttatta tcacccaccc cctcccccta ttacgtctcc      4320
     gaggtcccgg tttcgtaaga aaccgggact tatatattta taaatataaa tctaacttaa      4380
     ttaataattt aaataatata ctttatattt tataaataaa aataattata acctttttta      4440
     taattatata taataataat atatattatc aaataattat tatttctttt ttttctttaa      4500
     ttaattaatt aattaatatt ttataaaaat atatttctcc ttacggggtt ccggctcccg      4560
     tagccggggc ccgaaactaa ataaaatata ttattaataa tattatataa tataataata      4620
     atataataat tttatataaa tatatattta tatattaaat taaattataa ttttattatg      4680
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     ataaaaggta gtgaggatta aataaattat ataataatta taactcttaa ttataaaata      4800
     aatatatata tatatataag tatccatttc catataatct tttaataaat attaataaat      4860
     attaaaaaaa aataatatta taatatttta gtatataatt caataaaatt cattggaggg      4920
     gtaaataata ataatttact aatggcaagt tatagtctta aaggttttta ttttttttat      4980
     taaattaata aaataataat accatttata tattccatta tatatatata tttaataaaa      5040
     ataataatat catttatata ttttattata tattatatat attttatata aaataataat      5100
     aataaattta tatttttata tattattatt aaataataat aatataaata actccttcgg      5160
     ggttcggtcc ccacgggtcc ctcactcctt cttaagaata aaaaggggtt cggtccccct      5220
     cccgttagta cacgggaggg ggtctctcac tccttcttaa aaaataaaaa ggtggaagga      5280
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     atatattaaa tataataata attaatataa ttacaatata ttaatattat caaatattaa      5400
     taaatatact tttttatata atttatttat ttatttattt tttttttatt aaactaatta      5460
     taattgtaat ttcgaaaagg gggtgggagt aaacatatat aatttataat ctatatatat      5520
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     aatattaaat attaaatatt aaatattaaa tattaatttt tataggggtt atataataat      5700
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     atttataaaa atattaattt taataagtat tgaatacttt atataatata aatattaatt      5820
     acataattaa taattaaata atatttaata atattattta aatttattat ttataattat      5880
     ttatttataa aattctattt ttattattat tatttttatt ttattattaa agattaatat      5940
     aataattatt aatatattaa aaatctttta ttatattaat atttataaaa aagtatttaa      6000
     taaaaaagat gtataaattt ataaattata taatattatt aatttatata ataataatat      6060
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     atttatttat ttattataat attaataatt tatttattat tatataagta ataaataata      6480
     gttttatata ataataataa tatatatata tatatattat tatattagtt atataataag      6540
     gaaaagtaaa aaatttataa gaatatgatg ttggttcaga ttaagcgcta aataaggaca      6600
     tgacacatgc gaatcatacg tttattattg ataagataat aaatatgtgg tgtaaacgtg      6660
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     ataaaaataa tttatataat aaaaaggata tatatataat atatatttat ctatagtcaa      6780
     gccaataatg gtttaggtag taggtttatt aagagttaaa cctagccaac gatccataat      6840
     cgataatgaa agttagaacg atcacgttga ctctgaaata tagtcaatat ctataagata      6900
     cagcagtgag gaatattgga caatgatcga aagattgatc cagttactta ttaggatgat      6960
     atataaaaat attttatttt atttataaat attaaatatt tataataata ataataataa      7020
     tatatatata taaattgatt aaaaataaaa tccataaata attaaaataa tgatattaat      7080
     taccatatat atttttatat ggatatatat attaataata atattaattt tattattatt      7140
     aataatatat tttaatagtc ctgactaata tttgtgccag cagtcgcggt aacacaaaga      7200
     gggcgagcgt taatcataat ggtttaaagg atccgtagaa tgaattatat attataattt      7260
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     gttatttaat tcgataatcc acgactaacc ttaccatatt ttgaatatta taataattat      7620
     tataattatt atattacagg cgttacattg ttgtctttag ttcgtgctgc aaagttttag      7680
     attaagttca taaacgaaca aaactccata tatataattt taattatata taattttata      7740
     ttatttatta atataaagaa aggaattaag acaaatcata atgatcctta taatatgggt      7800
     aatagacgtg ctataataaa atgataataa aattatataa aatatattta attatattta      7860
     attaataata taaaacattt taatttttaa tatatttttt tattatatat taatatgaat      7920
     tataatctga aattcgatta tatgaaaaaa gaattgctag taatacgtaa attagtatgt      7980
     tacggtgaat attctaactg tttcgcacta atcactcatc acgcgttgaa acatattatt      8040
     atcttattat ttatataata ttttttaata aatattaata attattaatt tatatttatt      8100
     tatatcagaa ataatatgaa ttaatgcgaa gttgaaatac agttaccgta ggggaacctg      8160
     cggtgggctt ataaatatct taaatattct tacataaata ttaatctaaa tattaatata      8220
     aatattaata ttaatagttc cggggcccgg ccacgggagc cggaaccccg aaaggagaaa      8280
     tattaatata aatataaata ttaatataaa tataaatata aatataaata tattttaata      8340
     taatataata taatatataa tatattatat aaatataata tataaataat ataataaaat      8400
     attttaatat atatataata taatataatt attattataa tttaatataa attattatta      8460
     taatttaata taataaataa ataaataatt ataattataa ttataattat aatctcaata      8520
     tataaatgat aaattattat aaatacaaag gaaataattg atttttaaaa tatatttaat      8580
     aaaatatata atataaatta tacttttttt gttattatat aataattata ttaatatatt      8640
     taatagaatt aaactccttc ggccggacta ttattcattt tatatattaa tgataaatca      8700
     ttaattatta ttaataaatt tatttataat atttaatttt atatattatt atttataata      8760
     aaaaaaatta tattataaca atttaatttt aatttttatt tttaaattat aaaattaata      8820
     atttatttgt ttaaataaaa tttataactc cttcggggtt cggccggact attaatataa      8880
     ataaataata aatatttata ataaaataat atacatcttc tttaaataaa aaaaggggac      8940
     attataaata gtatataaat atattatatc ttttttatta ttattattaa taaataataa      9000
     taataattta tatatttata atatatttaa tagttccggg gcccggccac gggagccgga      9060
     accccgaaag gagaatgtat tataattatt acatataatt attattattc acttcttatt      9120
     aaaaataata ctctatataa tttatataat ttattttaat atatatatat ttatatataa      9180
     tataatatat atatttattt attataatca ttttttttta acttaaaata aaacttatta      9240
     taatttatat aatttataat ttttatataa aaataattat ataattttta tttatttata      9300
     taataataat attatttgtt atatattata tattatatat ataataaata aataaataat      9360
     aaataataat aataaggata tagtttaatg gtaaaacagt tgatttcaaa tcaatcatta      9420
     ggagttcgaa tctctttatc cttgataata ataataaaaa tatgtattta tttaattatt      9480
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     atataatata atataaatat tcatttatct tttttttaat attcttaatt aattaattaa      9600
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     attaataata atttattaaa aatatattat tataatatat taatatatca taattataat      9720
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     taataataat aatcaatatt aattatttat atatataaga ttaatattat ttaatatatt     13020
     atgaataatt taattaataa atctttaaat attatcataa aaatataaat taaataattt     13080
     cttatttata ataaagaata ataatatata taaatataat aaagaatgta aataatatat     13140
     atataatata atataatata aaaaatatat atatatataa atatatatat aatatataga     13200
     taataatatt tttatataat ttattttatt attaagtaat aaataataaa aaaatcaata     13260
     tattaaataa tatatttata ttagttcggt ttagttggta ttttgtaatg agtaaaaagt     13320
     aatatataat attaaataat aagtattgat ataagtaata gatataataa taatattatt     13380
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     taataatgga taaattatat ttttatcaat ataagtctaa ttacaagtgt attaaaatgg     25440
     taacataaat atgctaagct gtaatgacaa aagtatccat attcttgaca gttatattat     25500
     aaaaaaagat gaaggaactt tgactgatct aatatgctca acgaaagtga atcaaatgtt     25560
     ataaaattac ttacaccact aattgaaaac ctgtctgata ttcaattatt atttattatt     25620
     atataattat ataataataa ataaaatggt tgatgttatg tattggaaat gagcatacga     25680
     taaatcatat aaccattagt aatataattt gagagctaag ttagatattt acgtatttat     25740
     gataaaacag aataaaccct ataaattatt attattaata ataaaaaata ataataatac     25800
     caatatatat attatttaat ttattattat tatattaata aaatttaata tatattataa     25860
     ataattattg gattaagaaa tataatattt tatagaaatt ttctttatat ttagagggta     25920
     aaagattgta taaaaagcta atgccatatt gtaatgatat ggataagaat tattattcta     25980
     aagatgaaaa tctgctaact tatactatag gtgatatgcc tatctttatt tatatatata     26040
     ttattattat taataataaa aaaaaaaatt aaaaaaaaga taggaggttt atatataact     26100
     gataaatatt tattatatta ttttttttta taataaatat taaaagatat tgcgtgagcc     26160
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     tattggttca ttcattgcac tattatcatt attcttattt atctatattt tatatgatca     26520
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     atataataaa tatataataa taataaaaat attaacaata taataaaaat ttataatata     30480
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     ataatatata taaaatagaa ataataatta aatatatata taaataatta tttatataat     30720
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