spacer
spacer
EBIDatabasesDatabase BrowsingDbfetch

EBI Dbfetch

ID   EAL63607; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; INV; 1683 BP.
XX
PA   AAFI02000103.1
XX
DE   Dictyostelium discoideum AX4 hypothetical protein
XX
KW   WGS.
XX
OS   Dictyostelium discoideum AX4
OC   Eukaryota; Amoebozoa; Mycetozoa; Dictyosteliida; Dictyostelium.
OX   NCBI_TaxID=352472;
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..1683
FT                   /organism="Dictyostelium discoideum AX4"
FT                   /chromosome="5"
FT                   /strain="AX4"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT   CDS             join(AAFI02000103.1:20288..20605,
FT                   AAFI02000103.1:20697..22061)
FT                   /codon_start=1
FT                   /gene="nagC"
FT                   /locus_tag="DDB_G0287597"
FT                   /old_locus_tag="DDBDRAFT_0187537"
FT                   /old_locus_tag="DDBDRAFT_0304520"
FT                   /old_locus_tag="DDB_0187537"
FT                   /old_locus_tag="DDB_0304520"
FT                   /product="hypothetical protein"
FT                   /note="glycoside hydrolase family 20 protein"
FT                   /db_xref="GOA:Q54K55"
FT                   /db_xref="InterPro:IPR015882"
FT                   /db_xref="UniProtKB/Swiss-Prot:Q54K55"
FT                   /protein_id="EAL63607.1"
FT                   /translation="MIILKRNIVFLLIIIIVLGIFIATSIEIKNYKLSLNQNKNEISKN
FT                   PPIWPAPFYGQFGNNSILISKEFNFTIISDSTLLLNKTLSKYYNLIFTQDNLINSSSNT
FT                   LNKLNINLKSKNEILKFGFDESYKLIIKNNENSKLEGNTVYGIMRGLETFYQLIKYNFS
FT                   DNSYFIENCLPLIINDKPRFPHRGVMLDTSRHFYSVDTILKVIESLSYNKFNTLHWHII
FT                   DSQSFPLSSKSYPNLINGAWSKSEIYSYHDIKRIIKYGKENGIRIQLEIDMPGHAKSWS
FT                   VGYPDLLPHGWNDSTTTIKCPDYDVPLDPSSPLSLPISFGLLSEFSGTDYGYNPNYDDK
FT                   SNNLFNLTVDDLFHVGGDEIEYQCWNNSKRIKDWMNENNLKTFQDVAKQFQLKIIKQLL
FT                   KIGKIPVLWEDTFQLFYKDLPKDVIVEIYHDQSTAINATNNGYKIISSIARYWYLEYSY
FT                   SNWIRAYNFEPTLNISKSNIHLVLGGEGAIWSESIDSSNLFQKLYPTSSAIAERLWSPI
FT                   YYTNLLNAKSRLQSFRCSLLKRGINSAPLNNSSPLSAFSCYNS"
XX
SQ   Sequence 1683 BP; 641 A; 202 C; 217 G; 623 T; 0 other; 2988088717 CRC32;
     atgataattt taaaaaggaa tatagttttt ttacttataa taattattgt tttaggtata        60
     tttatagcaa catcaattga aattaaaaat tataaattat cactaaatca aaataaaaat       120
     gaaatttcaa aaaatccacc aatttggcca gcaccgttct atggtcaatt tggtaataat       180
     tcaatattaa tttcaaaaga atttaatttt acaataatat ctgattcaac attattatta       240
     aataaaactt tatcaaaata ttataattta atatttactc aagataattt aattaattca       300
     tcatcaaata ctttaaataa attaaatatt aatttaaaat ctaaaaatga aatattaaaa       360
     tttggatttg atgaaagtta taaattaatt attaaaaata atgaaaattc aaaattagaa       420
     ggtaatacag tatatggtat aatgagagga ttagaaacat tttatcaatt aattaaatat       480
     aattttagtg ataattcata ttttattgaa aattgtttac cattaattat aaacgataaa       540
     ccaagattcc cacatcgtgg tgtgatgttg gatactagta gacattttta ttcggttgat       600
     accattttaa aagttattga atcattaagt tataataaat tcaatacttt acattggcat       660
     ataattgatt ctcaatcatt tccattatca agtaaatcat atccaaattt aattaatggt       720
     gcatggtcaa aaagtgaaat ttattcgtat catgatatta aaagaattat taagtatggt       780
     aaagagaatg gaattagaat tcaattagaa attgatatgc ctggtcatgc taaaagttgg       840
     agtgtgggct acccggattt actgcctcat ggttggaatg attcgacaac aacgatcaaa       900
     tgtccggact atgacgtgcc gttagaccct tcctcgccac tatcactacc aatctcattt       960
     ggattattat cagaattctc tggcacagat tatggctata atccaaatta tgatgataaa      1020
     tctaataatt tatttaatct tacagttgat gatttatttc atgttggtgg cgatgaaatt      1080
     gaatatcaat gttggaataa ttcaaagagg attaaagact ggatgaatga aaataatcta      1140
     aagacttttc aagatgttgc aaaacaattt caattgaaaa tcattaaaca attattaaaa      1200
     attggtaaaa ttccagtatt gtgggaagac acttttcaat tgttttataa agatttacca      1260
     aaagatgtta ttgtggaaat ttatcatgat caatcaaccg ctatcaatgc aactaataat      1320
     ggttataaaa taatctcatc gattgctaga tattggtatt tagaatactc ttattcaaat      1380
     tggattcgtg cttataattt tgaaccaact ttaaatattt caaaatcaaa tattcatttg      1440
     gttttaggtg gtgaaggtgc aatatggagt gaatcaattg actcaagtaa tttatttcaa      1500
     aaattatatc caacttcttc tgctattgct gaacgtcttt ggagtccaat ttattatact      1560
     aatttattaa atgctaaatc acgtttacaa tcatttcgtt gttcattatt aaaaagaggt      1620
     attaattctg ctcctttaaa taattcttca ccattatctg ctttttcatg ttataattct      1680
     taa                                                                    1683
//
spacer
spacer