 |
|
EBI DbfetchID CAA88565; SV 1; linear; genomic DNA; STD; PRO; 6537 BP. XX PA Z48636.1 XX DE Clostridium novyi alpha-toxin XX OS Clostridium novyi OC Bacteria; Firmicutes; Clostridia; Clostridiales; Clostridiaceae; OC Clostridium. OX NCBI_TaxID=1542; XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..6537 FT /organism="Clostridium novyi" FT /strain="ATCC19402" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="genomic DNA in pUC18" FT /clone="pCN47,pCN121, pCN201, pCN214, pCN312" FT CDS Z48636.1:161..6697 FT /transl_table=11 FT /product="alpha-toxin" FT /db_xref="InterPro:IPR018337" FT /db_xref="PDB:2VK9" FT /db_xref="UniProtKB/TrEMBL:Q46149" FT /protein_id="CAA88565.1" FT /translation="MLITREQLMKIASIPLKRKEPEYNLILDALENFNRDIEGTSVKEI FT YSKLSKLNELVDNYQTKYPSSGRNLALENFRDSLYSELRELIKNSRTSTIASKNLSFIW FT IGGPISDQSLEYYNMWKMFNKDYNIRLFYDKNSLLVNTLKTAIIQESSKVIIEQNQSNI FT LDGTYGHNKFYSDRMKLIYRYKRELKMLYENMKQNNSVDDIIINFLSNYFKYDIGKLNN FT QKENNNNKMIAIGATDINTENILTNKLKSYYYQELIQTNNLAAASDILRIAILKKYGGV FT YCDLDFLPGVNLSLFNDISKPNGMDSNYWEAAIFEAIANEKKLMNNYPYKYMEQVPSEI FT KERILSFVRNHDINDLILPLGDIKISQLEILLSRLKAATGKKTFSNAFIISNNDSLTLN FT NLISQLENRYEILNSIIQEKFKICETYDSYINSVSELVLETTPKNLSMDGSSFYQQIIG FT YLSSGFKPEVNSTVFFSGPNIYSSATCDTYHFIKNTFDMLSSQNQEIFEASNNLYFSKT FT HDEFKSSWLLRSNIAEKEFQKLIKTYIGRTLNYEDGLNFNKWKRVTTSELLKVIEEVNS FT TKIYENYDLNMILQIQGDDISYESAVNVFGKNPNKSILIQGVDDFANVFYFENGIVQSD FT NINNILSRFNDIKKIKLTLIGHGENVFNPKLFGGKTVNDLYTNIIKPKLQHLLEREGVI FT LKNKYLKINILGCYMFTPKVDINSTFVGKLFNKISRDLQPKGFSKNQLEISANKYAIRI FT NREGKREVLDYFGKWVSNTDLIAEQISNKYVVYWNEVENTLSARVEQLNKVAEFAKDIN FT SIIQTTNNQELKQSLVNTYADLITTLYSELLKEDIPFELDNIQIKERIILNEISRLHDF FT SNIILDFYQKNNISNNMIILFDSIIKEKDYYNVKLANKITGETSVIKTYSDSLWNFTNK FT YKKIVDDIKGIIVKDINGEFIKKADFEIEQNPSLLNSAMLMQLLIDYKPYTEILTNMNT FT SLKVQAYAQIFQLSIGAIQEATEIVTIISDALNANFNILSKLKVGSSVASVIIDGINLI FT AALTELKNVKTNFERKLIEAKVGMYSIGFILESSSLISGLLGATAVSEILGVISVPVAG FT ILVGLPSLVNNILVLGEKYNQILDYFSKFYPIVGKNPFSIQDNIIIPYDDIAITELNFK FT YNKFKYGYAKISGLKVGLVTHIGENIDHYFSAPSLDHYIELSIYPALKLNDTNLPKGNV FT VLLPSGLNKVYKPEISAIAGANSQEGNGVEVLNLIRNYYVDSNGNTKFPWKYEAPFEYS FT FSYMRVEYFDTKVNVILDNENKTLIIPVLTIDEMRNKISYEILGDGGQYNVILPVNQTN FT INIVSNKNDIWNFDVSYIVKESKIEDNKFVLDGFINNIFSTLKVSNDGFKIGKQFISIK FT NTPRAINLSFKINNNIVIVSIYLNHEKSNSITIISSDLNDIKNNFDNLLDNINYIGLGS FT ISDNTINCIVRNDEVYMEGKIFLNEKKLVFIQNELELHLYDSVNKDSQYLINNPINNVV FT KYKDGYIVEGTFLINSTENKYSLYIENNKIMLKGLYLESSVFKTIQDKIYSKEKVNDYI FT LSLIKKFFTVNIQLCPFMIVSGVDENNRYLEYMLSTNNKWIINGGYWENDFNNYKIVDF FT EKCNVIVSGSNKLNSEGDLADTIDVLDKDLENLYIDSVIIIPKVYTKKIIIHPIPNNPQ FT INIINTQSIHDKCHLIIDSVLTNNYHWESDGDDLIITNGLDINIRILQGLSFGFKYKNI FT YLKFSNYDELSLNDFLLQNYNVKGLYYINGELHYKNIPGDTFEYGWINIDSRWYFFDSI FT NLIAKKGYQEIEGERYYFNPNTGVQESGVFLTPNGLEYFTNKHASSKRWGRAINYTGWL FT TLDGNKYYFQSNSKAVTGLQKISDKYYYFNDNGQMQIKWQIINNNKYYFDGNTGEAIIG FT WFNNNKERYYFDSEGRLLTGYQVIGDKSYYFSDNINGNWEEGSGVLKSGIFKTPSGFKL FT FSSEGDKSAINYKGWLDLNGNKYYFNSDSIAVTGSYNIKGIQYYFNPKTAVLTNGWYTL FT DNNNYYVSNGHNVLGYQDIDGKGYYFDPSTGIQKAGVFPTPNGLRYFTMKPIDGQRWGQ FT CIDYTGWLHLNGNKYYFGYYNSAVTGWRVLGGKRYFFNIKTGAATTGLLTLSGKRYYFN FT EKGEQLTLV" XX SQ Sequence 6537 BP; 2682 A; 627 C; 1003 G; 2225 T; 0 other; 3162472857 CRC32; atgcttataa caagagaaca attaatgaaa attgcaagta taccattaaa acgtaaggaa 60 ccagaatata accttatttt agatgctctt gaaaatttca atagagacat tgaaggtact 120 tcagttaaag agatctattc taaacttagt aaactaaatg aattagttga taattatcaa 180 actaaatatc cgtcatctgg aagaaattta gctttggaga attttaggga tagtttgtat 240 tctgagctaa gggaacttat aaaaaattct agaacttcaa ctatcgctag taaaaattta 300 agttttattt ggataggtgg tcctatatca gaccaatctt tagaatacta taatatgtgg 360 aaaatgttta ataaagatta taatatacga ttattttatg ataagaattc attgctagta 420 aatacattaa aaacagctat aattcaagaa agctcaaaag taataattga gcagaatcaa 480 tccaatatct tggatggaac ttatggtcat aataaatttt attctgatag aatgaaatta 540 atttatagat ataaaagaga attgaaaatg ttatatgaaa atatgaagca aaacaattct 600 gttgatgata taattataaa ttttttatca aactatttta aatatgacat aggaaaattg 660 aacaaccaaa aagaaaataa taataataaa atgatagcaa ttggagctac agatattaat 720 actgaaaaca ttttaacaaa taaacttaag tcttattatt atcaagaatt aatacaaaca 780 aataatttag cagctgcatc agatatatta agaattgcta tattgaaaaa atatggtggt 840 gtatattgtg atttagattt tcttcctgga gttaatttga gtttattcaa tgatatatca 900 aagcctaatg gaatggatag taattattgg gaggcagcta tttttgaagc aatagctaat 960 gaaaaaaaac ttatgaataa ttatccatat aagtatatgg agcaagttcc atctgaaata 1020 aaagaaagaa tattatcttt tgtaagaaat catgatatta atgatttaat attaccattg 1080 ggagatatta aaatatcaca attagaaata ttattatcaa gattaaaggc tgcaactgga 1140 aaaaaaactt ttagcaatgc ttttataatt tcaaataatg attctttaac attaaataat 1200 ctcataagtc agcttgaaaa tagatatgaa atattaaata gtattataca agaaaaattt 1260 aaaatatgtg aaacttatga tagctatatt aatagtgtaa gtgaattagt acttgaaaca 1320 acccctaaaa atttatctat ggatggaagt agcttttatc agcaaataat aggttattta 1380 tcatctggat ttaaacctga agtcaattca actgtttttt tttctggacc taatatttat 1440 tccagtgcta cttgtgatac ttaccatttt attaaaaata catttgatat gttatcatca 1500 caaaatcaag agatttttga ggcttcgaat aatttatatt tttcaaaaac acatgatgaa 1560 tttaaaagta gttggctttt aagaagtaat atagctgaaa aagagtttca gaaactgata 1620 aaaacttata taggaagaac tctcaattat gaagatggtt taaattttaa taagtggaaa 1680 cgagtaacta cttctgagtt gctaaaagta atagaggaag ttaattctac taaaatatat 1740 gagaactatg atttaaatat gattttgcaa attcaaggtg atgacattag ctatgaatct 1800 gcagttaatg tttttggtaa aaatccaaat aaaagcattt taatccaagg agtagatgat 1860 tttgcaaacg tattttattt tgaaaatgga attgttcaat ctgataatat aaataatata 1920 ttatctagat ttaatgatat aaaaaaaata aaattgacat taataggaca tggagaaaat 1980 gtttttaatc ctaaattatt tggtggtaaa acagtaaatg atttatatac taatattatt 2040 aaaccaaaac ttcaacattt attagagaga gaaggagtaa tacttaagaa taaatattta 2100 aaaataaata tacttggatg ttatatgttt actccaaagg tagatattaa ttctactttt 2160 gtaggaaagt tattcaataa aattagtagg gatcttcaac caaaaggttt tagtaaaaat 2220 cagctagaaa tttctgcgaa taagtatgca ataagaataa atagagaagg taaaagagag 2280 gttctcgatt actttggtaa gtgggtttct aatactgatt taatagctga acagatatct 2340 aataaatatg tagtatattg gaatgaagta gaaaatactc tttcagctag ggtggagcag 2400 cttaataaag ttgctgaatt tgcaaaagat ataaattcta taattcagac aactaataat 2460 caagaactta aacaaagttt agttaatact tatgcagatc ttattacaac attatattca 2520 gaactgttaa aggaagacat tccatttgaa ttagataata ttcaaattaa ggaaagaata 2580 attttaaatg aaatttccag gttacatgat ttttctaata ttattcttga cttttaccaa 2640 aaaaataata tatctaataa tatgataata ttgtttgata gtataataaa agaaaaagat 2700 tactataatg ttaaattagc taataaaatt actggtgaga catcagttat taaaacatat 2760 tcagattcgt tatggaattt taccaataaa tataaaaaaa ttgtagatga tataaaagga 2820 ataattgtta aggatattaa tggtgaattt ataaaaaagg cagattttga gatagaacaa 2880 aatccatcat tattaaattc agctatgtta atgcaattat taatagatta taagccttat 2940 actgaaattt tgactaatat gaatactagt ttaaaagtac aagcatatgc acaaattttt 3000 caattatcaa taggtgcgat tcaagaggcc acagagatag ttaccataat ttcagatgct 3060 ttaaatgcga actttaatat tttatctaaa ttaaaggttg gatcatcagt agcatctgta 3120 attatagatg gaattaattt aattgcagct ttaactgaat taaaaaatgt aaaaactaat 3180 tttgaaagaa aattgataga agctaaagtt ggaatgtatt caattggatt tatactcgaa 3240 agttctagct taatttcggg actgctagga gcgacagcag tatctgagat attaggtgtt 3300 atttcagtac ctgttgcagg tatattagtt ggtcttccat cacttgtaaa taacattctt 3360 gtcttaggag aaaaatataa tcaaatatta gattacttca gtaaattcta tccaatagtt 3420 ggtaaaaatc cattttctat tcaagacaat ataataattc cttatgatga catagctatt 3480 acagaattaa atttcaaata taataagttt aaatatggat atgctaaaat aagtggtttg 3540 aaggtgggtc tggtcacaca tattggggaa aatatagatc actattttag tgcacctagt 3600 cttgatcatt atatagaatt atcaatatat ccagcattaa aattgaatga tacaaatttg 3660 ccaaaaggaa atgtagtatt acttccatca ggacttaata aggtttataa accagagatt 3720 tcagctattg caggtgcaaa tagtcaagag ggtaatggag tggaagtatt aaatttaatt 3780 cgaaattatt atgtagattc taatggaaat actaaattcc catggaaata tgaagcacct 3840 tttgaatata gtttttcata tatgagagtt gaatattttg atacaaaagt taatgtgatt 3900 ttagataatg aaaataaaac gttaataatt ccagtattga ctattgatga aatgagaaat 3960 aagatttcat atgaaatttt aggtgatggt ggacaatata atgttatttt acctgtaaat 4020 caaactaata taaatatagt atcaaataaa aatgatatat ggaattttga tgtaagttat 4080 atagtaaaag agtctaaaat agaagataat aaatttgttt tagatggatt tataaataat 4140 attttttcaa cattaaaagt atcaaatgat ggatttaaaa ttggaaagca atttatcagt 4200 ataaaaaata cacctagagc aataaatcta tcttttaaaa ttaataataa tatagttata 4260 gtaagtatat atttaaatca tgaaaaaagt aattcaataa caataattag ttctgattta 4320 aatgatatta aaaataattt cgataattta ttggataata ttaattatat aggattagga 4380 agtatttcag ataatacaat aaattgtatt gtaagaaatg atgaagtgta tatggaagga 4440 aaaatatttc taaacgaaaa aaagttagta tttatacaaa atgaattaga actacatctt 4500 tatgattcag taaataaaga tagccagtat cttataaata atcctataaa taatgtagtt 4560 aaatataaag atggatatat tgtagaagga acttttttaa taaatagtac tgaaaacaaa 4620 tacagtctgt acattgaaaa taataaaatt atgcttaaag ggctttattt agaatcatct 4680 gtttttaaaa ctatacaaga taagatatac tctaaagaaa aagtaaatga ctatatactt 4740 tctcttatta aaaaattttt tacagttaat atacaattgt gcccatttat gattgtatca 4800 ggtgtagatg aaaataatag atatttagaa tatatgttaa gcacaaataa taaatggata 4860 ataaacggtg gatattggga aaatgacttt aataattata aaatagttga ctttgaaaaa 4920 tgtaatgtta tagtttctgg ctctaacaaa ttaaactcag aaggtgatct agcagatact 4980 attgatgttt tagacaagga tttagaaaat ttgtatatag atagtgttat tataatacct 5040 aaagtttata ctaaaaaaat tattatacat cctataccaa ataatccaca aataaatatt 5100 ataaatactc agagcattca tgataaatgt cacttaataa tagattcagt tttaactaat 5160 aattatcatt gggaatctga tggagatgat ttaataatta caaatggttt agatattaat 5220 ataagaatac tgcaaggttt atcttttggg tttaaatata aaaatatata cttgaagttt 5280 agtaattatg atgagttatc tctaaatgat tttttattac aaaattataa tgtaaaagga 5340 ttatattata taaatggaga gcttcattac aaaaatatac caggtgatac ttttgaatat 5400 ggatggatta atattgattc aagatggtat ttctttgata gtattaacct tatagctaaa 5460 aaaggatatc aagagataga gggagaaagg tattatttta atcctaatac tggagttcaa 5520 gaatcaggag tgtttcttac gccaaatgga ctagaatatt ttacaaataa acatgcaagc 5580 tccaaaagat gggggcgagc tataaattat actggttggt tgactttgga tggaaataaa 5640 tactattttc aatctaatag taaagcagta acaggattac aaaaaatatc tgataaatat 5700 tattacttta atgataatgg acaaatgcaa ataaaatggc aaattataaa taacaataaa 5760 tattattttg atggaaatac aggcgaagct ataattggat ggtttaataa taataaagaa 5820 agatattatt ttgatagtga aggtagactt ttaacaggat atcaagttat aggagataaa 5880 tcatattatt tttcagataa tataaatgga aattgggaag aaggaagtgg agtgttaaaa 5940 agtggtattt tcaaaactcc ttctggattt aaactttttt catctgaagg agataaaagt 6000 gctataaatt ataaaggatg gctagattta aatggaaata aatattattt taatagtgat 6060 tcaatagcag ttacaggatc ttacaatata aagggaattc aatattattt taatcctaaa 6120 acagcagtat taacaaatgg atggtatact ttagataata ataattatta tgtttctaat 6180 ggacataatg tattaggata ccaagacata gatggaaaag gatattactt tgatcctagt 6240 acaggaattc aaaaagctgg ggtattccct actccaaatg gattaagata ttttactatg 6300 aaacctatag atggacaaag atggggtcaa tgtatagatt atactggatg gctacactta 6360 aatggaaata aatattattt tggatattac aatagtgcag taacgggttg gcgagtatta 6420 ggtggaaaaa gatatttctt taatattaaa acgggtgccg caactacagg tttattaacc 6480 ttgagtggta agagatatta ttttaatgaa aaaggagaac agttgaccct ggtataa 6537 // |
|