Dbfetch
ID CU639404; SV 4; linear; genomic DNA; STD; PLN; 79299 BP. XX AC CU639404; XX DT 25-JAN-2008 (Rel. 94, Created) DT 03-MAR-2009 (Rel. 100, Last updated, Version 5) XX DE S.lycopersicum DNA sequence from clone LE_HBa-120K13 on chromosome 4 XX KW HTG. XX OS Solanum lycopersicum (tomato) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; OC asterids; lamiids; Solanales; Solanaceae; Solanoideae; Solaneae; Solanum; OC Lycopersicon. XX RN [1] RP 1-79299 RA Auger K.; RT ; RL Submitted (02-MAR-2009) to the INSDC. RL Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. RL E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: Geneservice RL (http://www.geneservice.co.uk/) and BACPAC Resources RL (http://bacpac.chori.org/ XX DR MD5; c8c59c2cb4b29b573e74b3142db5edab. XX CC Genome Center CC Center: Wellcome Trust Sanger Institute CC Center code: SC CC Web site: http://www.sanger.ac.uk CC Contact: vega@sanger.ac.uk CC CC This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions CC were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or CC covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was CC made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; CC all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was CC confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone CC being a YAC. CC CC numbers given in the feature table with their source databases: CC Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP; CC http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep CC CC LE_HBa-120K13 is from a Lycopersicon esculentum library CC VECTOR: pBeloBAC11-HindIII CC CC TOMGEN XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..79299 FT /organism="Solanum lycopersicum" FT /chromosome="4" FT /cultivar="Heinz 1706" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="LE_HBa" FT /clone="LE_HBa-120K13" FT /db_xref="taxon:4081" FT misc_feature 1 FT /note="clone sp6 end: LE_HBa-120K13" FT misc_feature 77300 FT /note="clone t7 end: LE_HBa-6E18" XX SQ Sequence 79299 BP; 24275 A; 13529 C; 15242 G; 26253 T; 0 other; aagcttgtga tggtccgtcg tgtctatgag ggtccgtcct gcaggttcgt tatgaagata 60 agagaagtaa tcccagtacc catattccaa gagttgaagt gttttggaac gaagaccctc 120 gacgggctgt tgtgcctatg acggtccgtc atacttgccg tcgacggtaa tgaagagagc 180 agcagaagaa attgaataag tatgggacaa cggagtccat aacggtccgt catgaccacg 240 acgatccgtg gcgaggtctg tcgacccaac cgcattttga tagatttcca tcaaatatag 300 tccttgttta attaggtttt tattttctat taatagtttg aaaaacctcc tttttaaggt 360 tagactctta gaatgttaga ctccgttttg ttagacatca tattagtaga ctctgtattg 420 ttagagtttt gagaatcatt agactttttg tgacattgtt gattactttg agattcttgt 480 aagtgattat tggtgattaa tcaagaaaac tttcggattt taatctttct cattgaagta 540 agtacatgaa ttcttattta atatatttga atattgtgat tatgactatg agtaactaaa 600 ctccataaca agggttgtcg aaaccatagg caaataatga gataaaacct aactataata 660 acgattctag aatagcgtct tgcatgtatt aataattctt tcgcttagaa gtctttttaa 720 cggaagtcca acgttagaac ttgccttaat gctaattgcc ggaccaagga ggtagataat 780 aggaaaagaa ttatcaacat agatttagtg tatactatct aataggctaa tattgattgg 840 tatgaggtaa taacttagtc aaatatcgaa tacgatgctt aatatgaggt aaagataagg 900 gttaggatag caacatacgt agccagacca tggtgcggag tgagattttc tagatgccgg 960 accaaggatt tagaaataca taacttatca ctttgcatgc aagatactag gaaagaattg 1020 tgatagttag aattatcaag ttatgaacct gaggggaaca cgtaaaccct agttactttg 1080 attaattgat ttaaatccaa cattcaaagt tgttaagtgt ctctttcaat tcaggtagtt 1140 cttttcattc atttagaaat agaaaccccc ccttttattg ttttttcttt ccagggaagt 1200 aattgactaa acaaaagtaa taatagattg aacttaagtc tagacaattt tcctcgtggg 1260 aacgatccca acctcactag ttgggttatt taattgacac gaccgcttta cttcttattt 1320 gagaagtaag tgagcgtatc aattaattaa gtatgtcttt tgataaactt taggaggagc 1380 atgtcctata tatatatatg tgtgtgtgtg tgtgtgtgtg tatgtgtgtg tgtgtgttgt 1440 gtgttgtgtg tgtatgtgtg tatgtgtgtg tgtgtgtgtg tgttatgttg tgtaacaaga 1500 atgatcttat tctaggtact ctaaaggatc tcttaggtgt acgtgaaagg attgtatggt 1560 cggtcgtttc ataactcact caagtgagac ttagaatcac ctttggtagg aggatctcat 1620 ggttatacca tttttatatg ttatttattc tataatgtaa tatgtaatat gtaatactta 1680 gtgggtgtta tggtgatgtt acagtaaggg ttactgtaag cttattgtaa tgttaccttt 1740 atttgatata atttgaagat gaattatgtt gtgttctaaa tgtgatgttt ggtgcttaaa 1800 tgtgattctt atacttatat tgggatgttt taattaaaaa gaacatattt ctcataaatg 1860 tctgtttctc atgattatat gcattaagtc atacttagta catctgtttg tactaattca 1920 ataacttttg tctatctcta atggtgttgt tagcagctga gaggtatctt agatcaatat 1980 tgtaatctag taatcattaa agaaaagtca aagtatgtcc tcacttgatt agagggaata 2040 atcatcttta ggtctctttt attcaagtat tgtaatagac taagtgattc catatttcat 2100 attatatggg ccgtatccca aatattccta aatctaatat tggcatatct tgagacttag 2160 tattttcttt ttgattttat atgtaagatg ttttaacata ttcgtgtgaa agctttaatt 2220 ccgcactact tttcatacat gtatgcaatg aatgataaaa aaagtcttgt acaagacctc 2280 cgagaggtca aatatgttgc gtcgcactcc aagagtgcca tatattctag ggtgtgacat 2340 catgaatggg ctatagtgat gtcttgtatg tgtatacttg acgttgaagt gtgaagcttc 2400 ttagttgact atatgaacgt tatgatgtgt tatgttgatg attctataga agtgtgtagg 2460 tgacttgaaa atctacttag ttgaaccatg tgctacatga atgatattaa acatgtgata 2520 attttataat gaagtttgtc ttgttcaggt agacctatgt cccttacttg attcatgaag 2580 aatgcgaata tgaatccttg acttagtaag ctaaagaacc ttttgcatga atatacatgt 2640 atgaatggaa tatggtcttg aatatactaa agaaggtcat ttatgtgaaa ccttttaaaa 2700 agatagttat gatatcattg aagttgaaaa ttgtaattgt atccttctcg tgtgaatggg 2760 ggagttaggt ttgttgctgg aactacatga aatcatcctt aagaaagtca ttgagctatc 2820 ttaataacca ttgtaagcag tcctagtgga tcctctttgg taaggtgtag tacgatttag 2880 ttatgaacaa gatatggtac ctcttcatat gctcctttat ttaattactc tatgtgaatt 2940 aagtgtagca ccgagtgagt attcttgggg agtagctcta gttttaagat gaggatagtg 3000 tataaacaaa ccttgatatt cctacatagg ttgtgtccta attttaccgt tggtaagtag 3060 cacacccttt atcggagtag gttgactcag gattccatgc ctagttagta tggtctattg 3120 ccgttattgc ctattctaat catgtgggat acatgctagt tttggagaac ttttctgaaa 3180 gttatgtagt cgaatgggat gctatctaga cattgcacga ctaggctttg aagaatgtta 3240 ctatgtgagt tccctaggcc ttaaccatgt atgtccttaa atagtgaatg tctcataaat 3300 ggcttaacga attgagttac ttaaataagt aatatgttaa agaaaaggtt attatctaga 3360 gccgctttaa gtattgttta ggtaggcttg gagagggtgt atgggcattc ttttcatgta 3420 ttacttagat gagtcttaga gtaattctag gcagggagtt gaatgtatga aatgggaata 3480 atgttatctc aggtaatcta aaagatcact ttggtgtgtg tgaaggaatt atatgggcgg 3540 tcacttcata actcactcaa gtgagcttta gaatcacttt tggtaggagg gtgtcatggt 3600 catgtaatat gaagtgatgt taatgtatat tgattgaatg tgactatatg tgcttatggt 3660 gaattaatgt gatctcttat acttgtttta tgaagtttta ctaaaaaaga gcatgttttg 3720 tacaaatgtc tttttatcat gattttattt cattatgcca tacttagtac attctagtgt 3780 actaattcca tatattttgt ctatctataa atgtataggt ggcatttgag aagagtctca 3840 aagtgaaact ttgattattg atcattcaag caactgttgg tacgtcctca ctagattcga 3900 ggacatcttg atgtttagat atccttattg aagtattgta atagacttag ctacttttct 3960 atatgttgaa ttaaagcacc tgtctcatat tattcatttt gtctaagaag gcgactttga 4020 gagttagaca ttcattatgt ttttctataa aagagataat ctgaagtatt actattttgt 4080 gtgaaaggtt ttagtttcgc actactattc atacatctat gcaatggatg atgtcaaacg 4140 gctcttacaa gacctccgag aggtcaagta ctccatgttg caatccaaga ataccatgcc 4200 tactaaggtg tactccggtg tgtgacaaag gtatggtcat ttaggcttag ttaattcttt 4260 cctcatgaaa tatggtatga acaacaattc ctttccttct cctcattatt ctcacttatt 4320 ctcataagtc accccattat taacattcca agggatacca gacgccccat tttctctgca 4380 ctatcacaat ttcatttaaa aaatatcact cttctttcct ttttatcgtt tttgtttatg 4440 gaggggttcc gtctttctca aaacaatggg taaaggcgat ttctttgcac tttttgatta 4500 aacttctcgt ttcaccacac ccctaacata ggcttttgga ctaagttttc tattcacaca 4560 aaccatttct catgagggtt gagggtgaag ggataaaaaa aatgcttcca tttgatcaag 4620 tttcttctaa ggaaatgtta agtctcaaaa ggttttcagc agaactcaca tactcacaag 4680 gtaggccaca gcagaactca catactcaca aggtaggcca caaaagaggt ataatgtcaa 4740 attgttgcac tctttaaaat tgttgcctaa gatcatttta agagcttaca tcatttagtc 4800 aactggacaa acagggtgaa ttgtaggtat catcacacat agttcatgga aagctcatca 4860 tataaaaatt accaccaatg gcaaacaaga atccacactt ttgctagtgt gcaatgttta 4920 taagaataga ctcagtttta tgattgagta gtcacaagga gatgcaaaaa gttcacatat 4980 ttactatgaa acttaatttg gtctcattgt atccaaacat actttttttg ttcgattatg 5040 agcactatac aagtcatctg attgatcaag accgatactc aaatatgaaa gagaacaact 5100 atattcaaat aaattcaata actggtacaa tttttcaaaa agggttacga cacaatttta 5160 ggcctatagc catactaaat ttgaacaaca cttttaaagt gttgcctaaa atatttttgg 5220 ggacactttt taagtgtagc ctaagttttt tacttttagc ttcaataata ttaacaacac 5280 ttttaaagtg tactccctaa tggtataagt ttcattttat aagcattgtt aaagtatgat 5340 ataattggca ataactattt atatatatgg cgacactttt taagtgttct attttcctaa 5400 tggtagaaac acaaatcaca aatatgattt ttaaattttt accaaaatat tatattccct 5460 ccaaaaattt taactatgcc tccaattttt attaggcaaa aaagtaatta ataaaacata 5520 aatacttccg tttcccccaa atgagaaaaa aatcacgtct tgccttttct ctttaagtct 5580 gaagaacggg ccttttctct ccaagtctca agaaaatgcc tcatccctaa cattttacct 5640 aaatcaattt tggcaatagg ttggaaaaac aagattgtac atttttctcc agtacttcag 5700 cgaggaaaaa tttgacattt tctatgtcaa cactacgagg aggttgagtt ttgaagctgt 5760 tacgtttctg cttcaattta attcaaccaa aatcttttcc gtcaccaaca acttttcagg 5820 tatggatttg acatcttatc acaaatcttg acatagtttt atgtttcatc tcgttctgac 5880 aactatgtga cgcaatatgt gtgtgtgaaa gatagacaga gaatgagtaa ctgttcatgt 5940 aactagtttt tttagaaaat ttgaatgtcg agttaaattt ctttcaaatt tttgtattag 6000 ggcgctgaag ctttaatgga gagcttgtgg aaatctttcg acaaaattga gatatgacag 6060 tggcgaaagc ttgtaggaat tagggtcaaa attatgacat aaatctaaat aatccataac 6120 tggattgaat aaaattacat taatttcagt tcttggtatt agttcatgtg ttttttaaaa 6180 agttggatat tttatttagt tcaaatctgt agtttaggtg ataatttgtt tcaacatctt 6240 ctttagactt catttgtttt cattagattt atagcttatg tttgttgctt tagcattaac 6300 cagtaaccat attactcaat tgataaagtt gttgctttag caataagaac tattgcttct 6360 tacaaggttg tttctgaatg tgttttaata taaataatgg tcatggaaag tgatgatgct 6420 ttaacaaatt tcatgttatg taaagtgaat cagacaacac atttgttatt gctcctcaat 6480 cctcattagt tgcactttct gatgcattac ttatataaat ttatagttta atctcgtcct 6540 cgatgagaat ctagagtttc atgtttcagg ttgttgcctt gccaagcttt tggtttataa 6600 agaatctcat gttacatttg tatatttact tagggttaac gattaaccat acacaagccc 6660 agataaatca agagttttaa gttttttttt tatagaaaca agttaaagta atagtgtaag 6720 tacaagtaaa ctaggcattc atttgaccaa gtttgtttcg acacatgcta tgttaatgta 6780 ttagaagata gaacttgtgc atatacaaat atatacagca cttctattct agctcctccc 6840 tgtttggaat gctcttcatg caaaagaact gttgcatcag tgctcctagt tgtcaaaaaa 6900 aattgtacat catgcgttat aacttcctaa tgttactgtt gcttcattca acatttcaca 6960 catttcacta tctgaatata gattgtttgt aaacaggttt ctacaccctc ataaaatttc 7020 tgcatagaac tacattttct ggaggtatga tgaccttgga gttgaaagtt ttgatccatc 7080 cttattagtg tgtcatgaaa ttaattttag caacattaaa gcatacaaag cttgaacata 7140 tggatttgta ttaaagaagt tgttgggtac tttagcaaaa taacttccta atgtttgcta 7200 ggatttacta atattttttt gggcaacttt cacatatagc aaacaaaaaa ttcatatttg 7260 tatgctatag caaacttttc ataattgcgc tccatagcaa acataaaacg gtataatttg 7320 ctatacatat acaattgtat aattcgcttg cctaaattct ataattcgtt gacctaaatt 7380 gtataattcg ctggcctatt tcgctgcaat tgtatgattt gttttgcata cagttgaatc 7440 aaattaaaat gtatgtatat tgcataatta taagtgtatt gcaagaagat atacattttt 7500 ctcgctttat acaaaaacag aaacacaata tatatacact tctgttgtat aaagctagag 7560 aaaattgtat ttcactgcaa tagtataatt cgcaattgta taattcgttg gcctttttct 7620 ctgcaatatt tgaagtaaaa tgtttgtaaa ttgtataatt aagtgtataa cacgaagata 7680 tacatttttg catgtgcata tacaattttc tctcgcttta tacaaaacag aaacagaatt 7740 atacacttct gtgtataaag cgagagaggc gagcgagaat ggagagtggc gagcgagatt 7800 tttgggagag agacgctggc aaattttagc taatgtttgc tatggagcac tattaaatta 7860 aaccctagat attccattta atttaggtta ttagtttgct attatatata attttcccta 7920 ttttttttca taaacaagag aaagtgggta gtaagtgata attcataaga gattactcta 7980 ttcatttagt atttgaaatt actcatttgt tggccatttc atttccaggt ttctatttat 8040 catcgaataa gaaagattga agatatcaca ccctccactt gattatggta gctcagaagt 8100 tcatcgtact attgttggga gcaaaagtac ctctggagtg acgaattctt aaaagaaata 8160 gattggagtt aatcttttat gtgcaaagag ctattgtgta tatattattt agatttcatg 8220 gtaaggtttg cataaattct accctacttg gactttactt gtgggatttc actaagtatg 8280 tcgtaggttt atttagatct cgtgaaacaa ttgaatttat aacagtttcc gtattgaagg 8340 tactacgctt gattgtcttt tcctttttct tattatcaat cttgaatact tgctaaaatt 8400 gtggtcattt ttttaatttt ttataaatga tataaagaga aaaagaaagt ataatgtttt 8460 taaatttacc cagcgtccac tccctaatag cactctcttc ccacagataa acataacata 8520 cactaacaaa aacataatca taattcttat tttctttttt tataaacacc aattgagaaa 8580 aaaactttaa acattagtta tggagtcttt aacatggcta tcaacaaaag gggtttgttt 8640 ggacaagatt ttagagaaac acgatgtttt atctctgagt aaaaaataag aaattgcttt 8700 cgtggatttt ccaatttcaa gattgttcat attacctcat gttatgttca aaacaaaatt 8760 ttttaaccta ttatttgtga ctattgatgg tattcaaaat cttaatttgt gattaccttt 8820 aattataggc gtttgaaaat tttagatgca gttttagagt tccaccggtt gggattatca 8880 tttttcaact gtaatgtcaa ctcttggtat gttttttgca catgtcatat ctttgtctct 8940 cctttttctg tttaatattc atgaatgaca actcgacttc atgtgtttgc atattctttt 9000 aagtctaagt gcaagttgtt gaacaattaa caaaagatac acctttaaac aagatgagtg 9060 aagagcagtt gtgttggcta tattcaatat gctaacagct acttgagtaa aatttcagtt 9120 atgaatatat tgaagaagtt cagaaaacaa gatagtaaga gtatatgcaa aggtcttttt 9180 catatatact ttcatgtaaa tttgtgtagt tgtgtatcat taggcatgtt atggaaccac 9240 gacatctagg atcactactt tcatgtagtc acaaatattt atcacttttg ttgcaactat 9300 ctttgatgat agattctatt tgtggattga ccgtgttggt gatatcattc tagttgtata 9360 tacaattaca aattggtcaa ggactgtgtt ggaaattgca agttctttct ttttaattcc 9420 cttttcaact aatatgaaat tacaataagc caattttgat gttcatatat gtatatatga 9480 taattcttcg tgaagtttct ttatttggac aatcgcccct tctgaatttt tgttgaaatt 9540 tacatatcta gtccgaatta caccattgac ttctctaaac ttttcagtat cactgtacct 9600 cttaagcgaa aaaatttatt atatataaga cgtatatatg acgtggcaga caaaacttat 9660 acgatgctcc actcatattt tttcacgtgg ataattgatt tccacttcaa aaaattgtcc 9720 aaaccgtcct ttctatctct tcccttataa agtgtttcct ttcgcttact tcttattttt 9780 ttctttggtt tcttttttaa caattgttct aaattttaca cttttattta ctaataattt 9840 ttcattttac ttctaacatt gttatgttat atttcatttt gatattgatt atttaaaatg 9900 cttaaaatag ttatataaaa ttatttgtta atttacaaat taagatgtaa ttaattacat 9960 ttttttcatt attataataa taaattattt ttgaaagtat aaataaaatt tataaagtga 10020 aaaagaaaat taatctgcca atttgtaaaa taaatatttt atgaatgatt tcttaagaat 10080 ttggtaaaaa gaaatataga ctattaattt gttttttcat tcttctcaac aatttcatgt 10140 atccaaaaac acttagatgt ataaatactc ttcaagtaaa tgtaatggaa gagcatcaat 10200 gattttaaca aacaattaca taagttttga tactattttc ctgaaattcg aaaataaaaa 10260 gatccataaa cacccataga aatatatatt atttcaataa ttttatatga tatttcttat 10320 tcttaaatat tcaagataag tgatatttaa caaatatatt atttatctac tttaattaca 10380 catttcttaa gaaattataa ataaaactat aattttgact atacaaattt tatttatact 10440 attttaaaat attaattgtt agaataaaac aattacgtat atattaattt tataaattga 10500 aaattaaata cgaccaatac ttattacgat ataaatagat aagattgaat aaaaaattaa 10560 tattaaaaaa ataatatata tatatatata tatatatata tatatatata tatatatata 10620 tatatatata tataatcata agatttatcc acagaaacaa tataaatcat tatatttgat 10680 aataatacaa aaaacaaata ttttaaaaag aagaaacata attaattagc taagaatgca 10740 aaaaataaat attttaaaaa atagaaacaa agagtacatc aagcgtaaaa attaaaaaaa 10800 aaggtggagg ggacttaaaa caaagttgac agatgggcct ctgtgatgta cactgggcaa 10860 tcaaatgata tctcatacga gtatgagttg gtgtgccgca tgcatgataa ttttttcctt 10920 gaaagcagat taagtagatg caagaattaa ggactataca taatgaaatt tctttttagt 10980 atgactatga gagagataaa tttaagacac tacatgacaa tatagtcaat ttatttaagt 11040 aactttctca ttctatattc actaactctt aaatttcaat attctacatg acatgtttaa 11100 aataataaag ttcagatatt attttgatgc attgcatgaa tatttagtat aaaattatac 11160 aattcgaaag tctttcatat ttgttgaact ttgtgtccag acaaactatg acatgtaaaa 11220 tgaaacagag ggagtaataa actttcccct gtttcacata aagggtttta tttgcttcgt 11280 tcttgattat cttttgcgtc tttattttta catttgatct ttggagggaa gtgaaggatc 11340 tgtgcttttt ttcactttaa atattggaaa ttggactaaa taacaagtca atcctaatta 11400 atatttttca ggtttctcat tcattaattt ggttaagaga ttagttgaat ttgaatgaca 11460 tgatattgtt tcttgtgttg atatcacctc atttgttgca atagatgtaa ttctagttat 11520 actaagtgaa aactcaataa aaatcatgac caattctggc atctacttta tataaatgtg 11580 ttataagtct aatttttcta gttttgtata aattgttata atcttccacc catacttagt 11640 tctaccgttg taatattgta tgaaaattct tgattgctca ctagtgtata gattttcata 11700 atttgagtgt tatttatatg agttgactta ccatcgtaag aatcagtttt ccatgtttaa 11760 tgtatgtgtt ggtgtagatc agttcgaatg gttagttcaa ttgttcaaat aatagctttt 11820 acatgggaac aagctaagac acttcgcata catttgctga gcatgatata ctatgttgct 11880 gcaaggtgag aatgtgaaac ttttaataag tacatctatc ttgcattttc accatattta 11940 tttttcagtt tatcagtgta tttgttgctt gctttggttc ctgaccatac aaagtatatt 12000 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