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EBI Dbfetch

ID   CU468283; SV 5; linear; genomic DNA; STD; PLN; 51668 BP.
XX
AC   CU468283;
XX
DT   11-SEP-2007 (Rel. 93, Created)
DT   03-MAR-2009 (Rel. 100, Last updated, Version 6)
XX
DE   S.lycopersicum DNA sequence from clone SL_MboI-14G22 on chromosome 4
XX
KW   HTG.
XX
OS   Solanum lycopersicum (tomato)
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae;
OC   asterids; lamiids; Solanales; Solanaceae; Solanoideae; Solaneae; Solanum;
OC   Lycopersicon.
XX
RN   [1]
RP   1-51668
RA   Beasley H.;
RT   ;
RL   Submitted (02-MAR-2009) to the INSDC.
RL   Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK.
RL   E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: Geneservice
RL   (http://www.geneservice.co.uk/) and BACPAC Resources
RL   (http://bacpac.chori.org/
XX
DR   MD5; eb1e32dd641a9ee0e07f9096fde24e05.
DR   RFAM; RF00300; snoZ221_snoR21b.
DR   RFAM; RF01424; snoR118.
XX
CC   Genome Center
CC   Center: Wellcome Trust Sanger Institute
CC   Center code: SC
CC   Web site: http://www.sanger.ac.uk
CC   Contact: vega@sanger.ac.uk
CC   
CC   This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions
CC   were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or
CC   covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was
CC   made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats;
CC   all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was
CC   confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone
CC   being a YAC.
CC   
CC   numbers given in the feature table with their source databases:
CC   Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP;
CC   http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep
CC   
CC   SL_MboI-14G22 is from the Lycopersicon esculentum (tomato) BAC library
CC   SL_MboI
CC   VECTOR: pECBAC1_MboI
CC   
CC   TOMGEN
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..51668
FT                   /organism="Solanum lycopersicum"
FT                   /chromosome="4"
FT                   /cultivar="Heinz 1706"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /clone_lib="SL_MboI"
FT                   /clone="SL_MboI-14G22"
FT                   /db_xref="taxon:4081"
FT   misc_feature    1
FT                   /note="clone t7 end: SL_MboI-14G22"
FT   misc_feature    15966..16290
FT                   /note="Single clone region"
FT   misc_feature    49669
FT                   /note="overlapping clone t7 end: LE_HBa-132O11"
XX
SQ   Sequence 51668 BP; 18201 A; 8401 C; 7618 G; 17448 T; 0 other;
     gatctcaaaa attcatttga agttggactt ctttaacaag tcaaaacaga agaccaaaat        60
     tcgacggagt tagccttggg tggatctcaa aaactacgac aatctagttt gcaactggga       120
     tagaattttt gagatgatct caaaaattcc accaatgtca tttgttactt attgaggtaa       180
     attgggaaaa attttgagaa tgggcctcaa aattccagaa tgagcaacct cagagttaac       240
     agcgcaagtt atgagagttc ttatatattg tagactggta caaattttga ggagggtcct       300
     aaaaaaaatt ccatcaaata tctcatataa aggacaggcg agcgtgtaag ccaactgcaa       360
     gaaggagcat ggagacaaga ccaacacaga tcagtccttc aaactaagaa tttttctttg       420
     gatgcaagaa cattgaagtc acaaaatggc tatacaaagt tatcatgaat gacaaaggga       480
     gtcacttgca cccatcgtgg actcatcagc gaaacctaga aaatcttcaa tctcatttta       540
     tctctattgc tttatattgc ctcaagtgat aaacaagttc ctttttatct tgcaggaata       600
     ttgaggccga acactgatag attcttccaa gttgcaagaa acaaggtgca ggaggattac       660
     tagttatcag tcatgatcaa agttaccgtt ggactcatca tagcctaatc tggataagcc       720
     aagtgactca atctagttcc tcaattttac ttttattcat tacttcatca tcgatactaa       780
     tgtttggtgt cgagctttgc aggtgatagt atgggtaaag ccagagtcgt atattgaagc       840
     gacatcattt tgaagatggt caaagtgaca ctaacttaga agtgttgcaa gagattttgc       900
     cgaattcatc acatcagaaa gatgatggtg accgatatct ccttgacagt caaaattatc       960
     gaattgttac aagttttcga taaatgatta aaaatgactg caacaaactc aaattctgtt      1020
     gagtttgtca aggaagtgtc tttttttttc atgtgaatga attaagtcat tcacctcgat      1080
     aattctttct tttaaagaac agaatcatag tcgcgacgtg cataaacgtc gatttagtat      1140
     gtttgtcacg tagtaatttc ggcgtacttt gcttcttgaa tatgtcagag tcataattct      1200
     tatttgttgg gtatccaccc cataagtgga ttatgtgttt tgatcggcca atcaaagact      1260
     ttagcatatg gtttgttggg tgatccaccc cataagtggt tcgtatatat gtttttccat      1320
     ttcaggttta tatttttgaa tcatatggaa tattatcgag cacccacctc gttacagttg      1380
     gaatattatc gagccatcca cctcgttaca gttggaatat tatcgagcca tccacctcgt      1440
     tacagttgga atattatcga gtcatccacc tcgttatagt tggaatatta tcgagccatc      1500
     cacctcgtta cagttggaat attatcgagc atccacctcg ttgcagttgg aatattatcg      1560
     agcatccacc tcgttacagt tggaatatta tcgagccgtc cacctcgtta cagttagaat      1620
     attatcgagc catccacctc gttacagttg gaatattatc gagccatcca cctcattata      1680
     gttggaatat tatcgagcca tccacctcgt tacagttgga atattatcga acatccacct      1740
     cgttgcagtt ggaatattat cgagcatcca cctcgttaca gttggaatat tatcgagccg      1800
     tccacctcat tacagttgga atattatcga gccatccacc tcgttacagt tggaatatta      1860
     tcgagcatcc acctcgttac agttggaata ttatcgagca tccacctcgt tacagttgga      1920
     atattatcga gccgtccacc tcgttacagt tgcaatatta tcgagccgtc cacctcgtta      1980
     cagttggaat attatcgagc catccacctg attacagttg gaatattatc gagccgtcca      2040
     cctcgttaca gttggaatat tatcgagcca tccacctcgt tacagttgga atattatcga      2100
     gcatccacct cgttacagtt ggaatattat cgagccgtcc acctcgttac agttggaata      2160
     ttatcgagca tccaccttgt tacagttgga atattatcga gcatccacct cgttacagtt      2220
     ggaatattat cgagccatcc acctcgttac agttggaata ttatcgagca tccacctcgt      2280
     tacagttgga taattattga gctagctagc tcgttacgga gatgactccg aagaggagaa      2340
     aactatccca aaatcaaggg ttttcccaga agcaagaggc attatgtcac ttatgtcaaa      2400
     gacttgggaa cgtggtttgt ttatttcaag caattcccaa caatgtgaaa ttcaggaaag      2460
     gtgtctagcc agattcaaag gcgaatcaaa caggaatctc agcgaagatt tcacgatttc      2520
     cataaaggac gctatttgca ttacattatc aaggcaagat aattattgtc aatcaagaca      2580
     gcgcattacc ccagaagaga tagttatttt gttgttatcg atcaactcga tatattatct      2640
     ggaggtcgtc ttgccgttat tactaacaca gacgatataa atatccatgc atcgcggaga      2700
     atcatgcatt ggggaaatca tgcatagcga gaaatcatgc attgcagaaa gtcatgcatc      2760
     gcgaaaaatc atgcattgcg agtttggaat ttatgcacga cgagaagatt tcatgcctcg      2820
     tcaaatttat atatcgcgag aaggctttat acctcactgg aatttatgca cgacgagaag      2880
     atttcatgcc tcgtcaaatt tgtataccgc aagaaggctt tatacctcgt tggaattagc      2940
     gcatcacgag aagatttcat gcctcgtcaa aatttatgca tcacgagaag aatccatgcc      3000
     tcattgagtt ttgcacatca cgagaggatt tcattcctcg ctgaaagtta tgcatcatga      3060
     gaagattcat atctcgcgga aatttacgta tcgcgggaag atattcatgc cccgcaagag      3120
     gacatacacg gataaagaaa gggaaactgt gtatcccaag agcaacattt atccgtcgac      3180
     ctcaactaca tcttttattt tgataaaaaa taagcatcaa gaagagcatc gaagatgacg      3240
     acaaaagaga catcaatatc gcatcaatat ttactttttt atttcgacgt caagtataga      3300
     gtacattgaa gattatattg caaaacacaa ggcataagct ttatttgttg gacgccagac      3360
     cgatcgagtc gacgtcgatt tgaggagaac aatgaagtgt cgacacggta aaaagacact      3420
     gtctcccatc ctaattgcat ttttaaactg acgagtttta tctcagtctt tgtcgagagc      3480
     atccaaaagg atgaattctc caaaaaacca caggtgcgga tgacatcaat aaggatgcag      3540
     cacaacgtgg aacctttctt agcagcgaac tgggacacag tccagagagg aatgtcaaac      3600
     tcttagggcg cgagcagagg agcgacttcc accacaatcg aaccaccctt tcgaagcatg      3660
     cgggtttttc tttagttctg tcagtttcag tctcgcatcc gaaagtttcg atttatcgga      3720
     ggaaagtttc caatctgagt gacaaatgcg ccaagagctt tggaaattat gtccgtgtaa      3780
     gttctcaatt acgggtgtga agcgcgccac attaatgtct aaagaggtta caagcctcct      3840
     tttcatactc gttaatttgt cacttgtcca gaaccaaagg ttatctagca taatagattt      3900
     ccttttccac cgatcgagtc aaactacaca cagcctgatc ccaaaagttt aagggtatgt      3960
     aggcggattc aatgttgaaa actcggttgt attccaacat tcgctttcga attctattct      4020
     cgagcatttc tataccttca taatccggta tcgaagtgac ttttgatttt ttcaaaatca      4080
     tgcggtaaat caagcttatc gaactacaag tggcctgaat tctcatatag cctgagatat      4140
     gtaggagacc cgttttcaag ggttcagcta taattcctaa actctttgtc gaattcttcc      4200
     tttagaaagc gaatggggtc ggtcaaaatt ggcttggtca atttcatttt cctcgaattg      4260
     cttgcatcaa cccgagtaaa atgagggaca gttgttgaca cccaattttt gacccgctcc      4320
     ggtatgattt aattagcgag cttcatgagt tttccaaatc acttaaaatt gattagtttt      4380
     ataattttgc gaaaatataa cgatacaatg tttacataat tgtgtatata gctggtatat      4440
     cttgtgtata ttcgaaatca gcccatcttt taatccaggc ccaactctcc cattcccaat      4500
     caatctccca ggccgaccaa ttctgaccca acccgtttcc cccgacccga cccaacacct      4560
     aacacccaac ccaataaccc attccccctt ccttcatccc cccccttcct cacgtccttt      4620
     tcccaaaaaa cgcagaccca acgaaaaaaa agaaacccag aaatcaaatc cacaccccct      4680
     cacgctctct cacccgtctc tccccacgcg accccttccc cccacgcgtt ctcgtcttcc      4740
     ccacgcgttc tcgtctcccc acgcaagctt ccccctcgtc agtacgattc ccataaaaca      4800
     gcagtgcacc tgcgtatttg cagcagaaaa gctgcgaatc ccgtccttgt agcgtgggat      4860
     cgttccacgt agctcgcaag gacgtcgagt tgatctcgtc catccacctc gtctcacttt      4920
     ccgttgagat tttggcatca aaaaggggat attcctcagc ttgggagttt ttgaatttga      4980
     aattcaaatt tgggcggaat aaagccatct ttcaggattc cctttcggat atccgaaaaa      5040
     aatttctata taaacccctt ccttcttcaa ttttgggggt tagcgatttt gggattgaaa      5100
     tctttggttg gagatttggg ttggacgatt gagcgaaaaa attggttagc aattttggga      5160
     ttgaaaactt tggttggaga tttgggttgg gcgattttag gtcgaaaaat ctcagagaga      5220
     aaaacttagg acagttttcc ttttcgagag aaatctttgg cttattcttt tcgcttcaga      5280
     aagatagaga agaaatagga gcgcaaaagg gtagcgagca aaacttcgaa agggtcggct      5340
     aacattcttg ttattgggag ggcgttcaaa acagagtttc gcttccgtct cgataacgac      5400
     ctcgcattct cgttctggta ctgagttcgc ggtgaaagtt cgttgctcat tgctgctcgt      5460
     cctcgtctcg ttcgctgccc agaaagaggt atgattcgct ccctttccaa tttttctctc      5520
     ctctgtttgt ttggtcgcga tggttgctag ctgttgttgt tgtaaaagtg agaagttata      5580
     cccctgtttg ttggcttaat ctgcaaggtc ttgcgtaatg tttatgttgg tttttctttc      5640
     gttggttatt tgtgttctct ttgagttctt gaacgtgagg ttcactataa atttctctta      5700
     ttagttttgt ttgtttcatt tacaaaatgt cgtcttgctt ctgttttttc ccctccccaa      5760
     cgtctcatcg tagttagtct gtcgttgata tattgtgaag aattgaattt tcttgtctcc      5820
     ctatgcttat tgtttcggtc gctggtttat gttgtgattc gtatatgtgt agaggtgttg      5880
     gaatagtagt cttcgattac tactaggcat accgtctcat tttgttttct tatattttgt      5940
     ttgtgcatgg aatttttcct aaggatgtta tcggttcttt aacttggttt ttgagtcctt      6000
     gcattttgta tgtgttggct cgtatatttt ttaaataaaa aatgagtttg aaagagcatg      6060
     agggttacag tgtggagata tctaattgtc caaattttct caaagtagcg gatatgttca      6120
     gtcagtttat gaaaaaaaat ataataaaaa atatgccacg gtcatttatg tgcttaatgc      6180
     atttgccgtt ttctgccaaa cttaatttgc taaaatgtct atatagttat tcatgaatta      6240
     ctattatcct tatttctgag attgtccacg tttatctttt ttttttttgg tttgtttttg      6300
     gatataatta ttggtgtcaa ttgccttctc ttatccaatc tatttattta tatgtttatt      6360
     ttggcttaag gaattaagtt gtaatttact tagtcacatt cgtcgttttg aaatcatctt      6420
     tatgacatga tttagagata ttattctcaa atgctaattt tattttactc ctcgttgcat      6480
     ataaaatctg tcggagttcg tcgtgaactc actcacctcc ttgcaatttg agagagccat      6540
     gaaggctcga aattccttca tcgagtcaac catcaagacg aacgagcaaa gttcggaatc      6600
     aggaagattg aagaacttga agaaattgat taaaatttct ttatttcaaa tcttattttg      6660
     tcatgtcctt gtgttttatt tttcttttct cgcattttat ttcgtatgcc tagattagga      6720
     caagtggaaa aatgggtcaa aatccaaaaa acgggtgggt ccaaaactcg gtcaaggcga      6780
     acagaactcg agtttggacc caaatctctc tctccctctc tctctctctc tctctctctt      6840
     tctcttgtct cactacttgt ttatattttt attttttttg aatgccgtta gtttaggatt      6900
     agaaaactcc aaaccccatc gaacgtcttt tgttttatca aactcaaatt aaaaatttga      6960
     aactttgaaa gatagatgtt taagtttgga aatcgcttag agttaaagtt ttaacttcaa      7020
     tgaaatattc taaaaaattt ggagaattcg cacaagagtt tctaataaaa gttcaacttt      7080
     aagattgcaa aagttaaaac aaaaatagtc aaataagtta atcgtcggaa aaccgtgttt      7140
     agcggagtat cttaggtgcc ttaaaaacct tcctaagata ctaataggaa tcccgaaccc      7200
     ttaaaatgtt tcaaaacaat tttttctgtt taagttgttt tggaaatgag ttttcttgat      7260
     ttttcttaaa aaattaagtg gcgactccca aaagtcaaaa atatcttcat attaaaacaa      7320
     actcttttcg aaaatcacct tttttcgata aaacaaccac tatttcttat cgattcatat      7380
     tagtttcaac atcttttaaa tttatggata gttcattatt tccttgagtt tcaagttcat      7440
     tgattctttc atgaatatca gacttattca aattttgaac ttccatatga gattctttca      7500
     tagtgtcatc ttgacattta atctttcttt ttctaggatt ttgatcctta gaccccaatg      7560
     gtctaccacg ctttaggtgt gtttttgact cattggctat gacactaata gatggtcctt      7620
     tagggacatc aattcgaatt gggacattct ctgcaggaat atgtgattta gtaatccttt      7680
     tcaaatctgt aaatgcgtct ggcatttgat ttgcaatttt ctgcagatga ataatctttt      7740
     gtacttcttg ttcgcaagta gaagaatatg gatcaagatg agacaatgat aaatttttcc      7800
     acaaaacttc tcgtttcatt tcactattct ctccccctaa ttttgggaaa actgtctcat      7860
     caaaccgaca atctgcaaat ctagcagtaa acatgtctcc agtcaatggt tcaagatagc      7920
     gtataatgga gggtgactca aacccaacat atattcctaa ccttctttga gagcccatct      7980
     tagtgcggtt tggtggtgcc acaggcacat atacagcact ttcaaaaatt cttagatggg      8040
     atatattagg ttcttgaccc ataaccaatt gcaatggaga aaccttatga taacttgtcg      8100
     gtctgagacg aataagtgtt gcagcatgca aaattgcatg tccccacaca gaagtgggca      8160
     acttagtttt cataagcaat ggtcttgcta ttaattgcaa acgtttaatt aatgattcag      8220
     cgagaccatt ctgagtatga acatgagcaa cggagtgttc aactcttatc ccaattgcta      8280
     aacaataatc attaaatgat tgggataaaa actctgcagc attatcaaga cgaatggact      8340
     taatctgatt atcaggaaag tgtaccctta accttattat ttgtgccaat aatttttgca      8400
     aatgccaagt tacgagatga caataggcac acatgagacc atctagaaga cgcatctatt      8460
     agaaccataa aatatctaaa tgacccacta ggtgggtgaa taggtccaca aatatcccca      8520
     tgtatacgtt ccaagaacgc aggggactca atcttaactt tcattggtgg tggtctcaca      8580
     attaacttgc cttgataaca agcagtacaa gaaaattcac catttaaaag aacttttagg      8640
     tcttttagtg gatgtccatt taaatttcta taattcgtct catcattatt gacccaggat      8700
     gtcctagacg atcatgccaa agtacaaatg tattggaatc agtaaacttc ttatttacta      8760
     tacaatgtgc ctcaattgca ctaatttttg tccaatacaa gccagaagat aaagtatgga      8820
     acttttctat aacacatgtc tgcccagaga catacttggt gataccaaga tattcaagat      8880
     ttatttcatc cattgattgg atatgataac cattttcacg gatatcttta aaactcaaca      8940
     agtttctctt agattttgga gaaaacatag cattattaat gagtttagtt cccttgggca      9000
     aaattacaat ggctcttcca aagccctcaa tcatattagt actaccaaaa attgtagtaa      9060
     aatttatttt tcccatactt aaatgagaaa aatatttctt atttttgaat atcgtatgtg      9120
     ttgtacaaga atcaatcaaa caaatatctt catatttcga taatatgttc ttagaattat      9180
     ccatatcttt attaattctt caaatctaac cttcactttt gagaaattag agtctcgtgt      9240
     tgataacgtg ttataaaact attaaataag aaaaagaagc tagagagaaa agaagagaag      9300
     acttgttatt tctcttgatg aatttacaat gaagaggagc actctattta taggggaaat      9360
     ctaacttgat ccccaagtag gaggactctt taatcatatc ctaaaaagga ctccacatga      9420
     tagacattca ctatagaaat actttataac agaatcgatt atattcacat tgcacgattt      9480
     tgttattatt aagaaggtca aatatggaaa ttgaaattct tgatggcaat aggatgatga      9540
     gatgcacaat tatgttccaa aaaaaaaaca tttggaacta acacaaatta tcaatttaat      9600
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     ttacatcaag taatatccta gtgaaatgca tacaatatgt tgtatgcatc ctacttataa     21780
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     tatataacta atacatatat acgttatggt tataatttat atattgtttc atataaaata     44580
     atatataaac aactaaattc ttcgtaacta gtcaaccaca atgcataagt tgtctcataa     44640
     ttgatctcta catgcttgat taaatatgta tgagcaatac atgaagcccc cgatcatcct     44700
     cactgcaagg cccattcgga aaatagtcct accaatatag ttttctccat ataataaaaa     44760
     tttcctaatt tgacactatt taaatttaaa ataaccttac aataccatga gaggagagtg     44820
     ttgtttgcta gtaataaaat ttgtttattt tgaaattcga cactatctaa ataaaaagat     44880
     aaactacaat aaagcgagag aaaaaaagtg taatttgcaa acaaacccac taattccatg     44940
     aggcagagag cgctttgatg aagcctgcac ccactggaaa aaaaggttgt ttgcaacaat     45000
     gccatgagac ataaagcctt tcaatgaagc ctacaccctc tggggaaaag gaacaatata     45060
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