Dbfetch
ID CU468256; SV 3; linear; genomic DNA; STD; PLN; 70401 BP. XX AC CU468256; XX DT 10-SEP-2007 (Rel. 93, Created) DT 03-MAR-2009 (Rel. 100, Last updated, Version 5) XX DE S.lycopersicum DNA sequence from clone LE_HBa-66O12 on chromosome 4 XX KW HTG. XX OS Solanum lycopersicum (tomato) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; OC asterids; lamiids; Solanales; Solanaceae; Solanoideae; Solaneae; Solanum; OC Lycopersicon. XX RN [1] RP 1-70401 RA Glithero R.; RT ; RL Submitted (02-MAR-2009) to the INSDC. RL Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. RL E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: Geneservice RL (http://www.geneservice.co.uk/) and BACPAC Resources RL (http://bacpac.chori.org/ XX DR MD5; 37bddf85ba15dd2a540583b982494895. DR RFAM; RF00005; tRNA. DR RFAM; RF00030; RNase_MRP. XX CC Genome Center CC Center: Wellcome Trust Sanger Institute CC Center code: SC CC Web site: http://www.sanger.ac.uk CC Contact: vega@sanger.ac.uk CC CC This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions CC were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or CC covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was CC made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; CC all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was CC confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone CC being a YAC. CC CC numbers given in the feature table with their source databases: CC Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP; CC http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep CC CC LE_HBa-66O12 is from a Lycopersicon esculentum library CC VECTOR: pBeloBAC11-HindIII CC CC TOMGEN XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..70401 FT /organism="Solanum lycopersicum" FT /chromosome="4" FT /cultivar="Heinz 1706" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="LE_HBa" FT /clone="LE_HBa-66O12" FT /db_xref="taxon:4081" FT misc_feature 1 FT /note="clone sp6 end: LE_HBa-66O12" FT misc_feature 68402 FT /note="clone sp6 end: SL_MboI-39E17" XX SQ Sequence 70401 BP; 24085 A; 11573 C; 11150 G; 23593 T; 0 other; aagcttcaaa gggcatggac atacatatga acattgttca attgaaccca accaccattc 60 aataaataat gacttcgatt gatactagca tgttcctttt taattgttat aggttggtat 120 tttaactaat atttatatta atataaaaaa attaaaattt atagtacttt tggaatagtt 180 ttggatatct aagtttttta tttgaaatat gaaattaatg taatatagtg taactttaaa 240 attagttaca ttgactttta aaaaatgtaa tatgataatt aaaagtggac agagagcgta 300 ataaataagt aatttagaaa atgtactaca acactaatat atttagactt caatgtaata 360 tcagatgtgg gatctaaaaa gtgtgatgca taaaaaaaaa ttgagaatct attattactc 420 taattactat ggggaaatta agtgtataag aaaacatata ctagttagtt agttaacata 480 gttataatat ttcataatta taattctcga tctatttttt ggctataatt acgtggcttg 540 gctttttaat tttgtataat tcacacgttt ttatactgca aaatttgcat aatataattt 600 atattacttt tgtataattc ggaatttgta taactgttaa cacttcttat attaataatt 660 atataaaaat tttgttttga atttatgcaa aaaaataact gaatcataga aatgtatttg 720 cgaattatat aaacgtgtga attatacaaa tctatgaatt gtacaaacaa aacaatttaa 780 gttgtattac aactcgtaaa tatgcaaatt ataagtatag aacatattaa attatttata 840 ttgattattt gcggaagttc cctgttaata tttgggaata cctataatag tcttctgttt 900 acaaactttt gaattttttt ccatgggaat tttgcccaaa atacatctct aacttctaaa 960 atattcttac tttagattta aaaaaatgaa aaagaaaaat ctttcaattg aattaatatt 1020 attcaaagtt caaacgccta ttattgaact cgaaatgctt gcaactaaag agagtaaaaa 1080 aacactggtg aagtcaattt tccaaaaaga ggatttatta tgaaatttta ctttatttta 1140 aagcaccgac cagcagaata aattctcaaa ttttagctct tttatatagt cttacttatt 1200 ttattatata tattatgtct acgtccccaa aaaaaaaaat ccaccggtaa aaaaatagta 1260 ctagtaataa aaccttttgt cttctttttc agattattat tttttctttt tgtaattgtt 1320 tttcttctgt gaaccaaaca atagtaaaag taaaaaaaag aaagatttga ttcttagatt 1380 tctatcattg tttcttagta tcaatatctt atatcttgtt gtttatgttt ggtgttattg 1440 tttttctttt aacgtaaata atttctctaa taatttcttt aacgtaaaat attggaatat 1500 gcatgaaacg tgaggaaaaa aattgaattc tttttgcacc aatcggatcg taaacaacct 1560 ctttaagata ttggaatttg catggaaatg tgagggaaaa gatattggaa aaaggaattt 1620 tgtactaacc gataattgta aacaaacttt tattttatct tatttttttg tcgtaaaata 1680 ttgaaaaata tatatacatg aaatatgaga ggaaaatcag gatcgtaaaa tattggaata 1740 tgcatgaaat gcgatggaaa aaacaggaaa aaaacttgca ccagccggga atcgaacccg 1800 ggtctgtacc gtggcagggt actattctac cactagacca ctggtgcctc atgcaaaatc 1860 cttctagaag atttattata tctaaattca tctttcttct attttttggt ataacaatga 1920 aagatttttt ccgtttgacc atcaagtatt cgatatccac tatacagttg gaagtgcacc 1980 ggattagaga tacgaagtac ctcgactata tctttttcat ttagactcga gatatatatc 2040 taattaaagt gaatgaatct tatctatatc attatatatt tcttcgtgcc atcacaggat 2100 accaagttga aactacatga gaactatatc gaataaggtt acccattagt aactatctgt 2160 cacgactttg taaatattta tggagtattg ttaaccaatc accaaaaatt cataagtttt 2220 gaagcgcttg atatgaattt ttgaagcgct tgatttagat tgtgtgcaga ggcggatcca 2280 cacggctcag taagggtgca catacaccca ttgattaaaa aaaaaatcat gtatatatat 2340 gtatatttat cttaaaaaac tagcaaaatg taggatatac ttaacaagga aatatccttg 2400 tacaattggt gtaagctagt gatgtcactc gaaaagacct aggttcgagc gcatgcagct 2460 attatctatt tcatattctc ttattttgag tttaacttaa agcttatatt ggtgtaccta 2520 aagtcgtcaa aacctgagct gattgtgtga gttttttact cttcctacac attaattaat 2580 tacttaccaa accttggaca tccacatttt aaaatggtta aaaagtagaa gaaagaaaaa 2640 ctcttcttta aaatgtatat gtaaattatg agtcttatta cttatgtgct aagtttgaaa 2700 gatcaaaagc acctctcaac ttttttattc ttccaatgac cttgcttgcc ataaagcttt 2760 tgttcgtact atttgtctat tcatcatcaa gaaggcacca ataaaagacc agaggaaaag 2820 ttccttgttt cctttgtctt ttctctaact tctcgctcgc aaaaatcgta aaatgtataa 2880 gaatagtatt aaagtttggt gtattatttt ataaatatgt tgagattagt tgtactatga 2940 ctatcttttg ttcattattt tgtttgatgt attgtgggta tacagttcat cttttactca 3000 tgcttattca tatataatta attaataggt gacaacgtat tgctaatatc atgatttgtt 3060 atgtattgct tcttcaattt tttttagttg tcatgttatt cgatgtttta tattaaaaac 3120 ttagatattt aaaaaatact ataaaattac aactataaaa tttgattttt tatttatcaa 3180 tatgataaaa agatatttcg taaaatatta atcaaagttc ttattatttg actctaaaaa 3240 gaaaaacaca acaacttaaa agaaacgaag gaaggagtta taacttaaac tgtaaatcct 3300 ataataaaag aggaatatat ttaggggtgt acaaaattga accgagaatc gaaccaaact 3360 ataaatcgag tcaaactgga aaaaaaaacg actagtaatt tggtgttgaa aaaaaattcg 3420 actatattta tgctgggttg gtttcaacta aaaaaatcaa cccgagacca aaccaacccg 3480 atattatata tataatttta aaattttatt ttatacgtaa aaatacctat tttgatataa 3540 tctttacata tctcttatac tttttcatag tttttatctt ttaatatatt tatttcatgt 3600 ttggaagtta gaattcttaa tgatctaata aagattatag ttcataatac atgttggtaa 3660 ttataataaa gtttaaataa aaatcaaatt aatataatgc aaaaaaaaat caattcaaca 3720 ctaagaatga aaataatatt gaatatttgt tttttagttt tacatagagt tagacaatta 3780 aaatacatga ttcaatttta ctttctttta atatttagtc atgtaactaa tacttgctaa 3840 acttatttta gcataattta gtactttaaa ttatgatcaa tttcattatg acttattgat 3900 ttgcaatatc tttaacacga ttttattatt attattatta ttttggatca ttaattatat 3960 aatatttttt gttatttttt tgagaaataa cttagacagt tgcattttga taggactaaa 4020 gaaatatttg atgtacaaat aaattatacg tttgtatgaa tactttatcg aaaaatccaa 4080 aaaaacccga aaaaactcaa agttgaaaaa tccgaatttt atttatttgg tttggtttat 4140 aaattcaaaa atccgaccca aataattttg tttgatattt aaaaaattcg aaccaacccg 4200 atcatgtaca cccctaaata cattcattgg aaaataaagc ctatacaggt tgtaggtttt 4260 ttataagctt ttacaatcaa atcttaaagt aatattctca gccactttaa ggtacaataa 4320 tttgtcttac tattgaagag actaagcaac atcctttact ttttactaca taattttata 4380 tcccatggaa tcaaattcac ctgaaggagt cttttggtat atgcagatta agttatatta 4440 aatcggatat aataaggtga aaatctatga catcaagctt gagataaaat ttatataatg 4500 tttgattggc catttatatc gtcaactaaa tgtataaata ccatcttaag tttagtcttg 4560 agatatctca tttgtactcg cattggagta catgagctaa ttcggcctca cttcaggcaa 4620 tgctttcata ctcaaagctc gaactcgata catctgagat taagagagca gtcccatgta 4680 actgcacgac atagacactc aacttcatca actatagtag aaaaaaaaaa agaaaattat 4740 gcccctttta agttctttat atacttgagc ttcaccacaa acattttcac ctctcaaaga 4800 aaccttaaga accatttttt cctacttact agagtatcaa gaaagtatgg cttaccaaaa 4860 catcaatggt tgcatttctg attcaattga aattcttgat ccaaaacctc ttgcagtagt 4920 agcttctggt gttgttcatc ctcctattgt tgcatctttc aatgatagaa ttcgtccact 4980 tctcgactgt atagacaagc tccgccatct caacatcatg caagaaggta tccagctccc 5040 aacgatcgta gtagtcggag atcaatcttc tggaaagtcc agtgttcttg aatcccttgc 5100 tgggatcagt cttcctagag gacaaggcat ttgcaccagg gtccctcttg ttatgaggct 5160 gcagaatgat ccaaacatca cagcaccaag tcttcagttg gagtacaata acaagtcact 5220 ccctgttgat gaaattggca ttgcagatgc tatcattctt gctactgatg agattgctgg 5280 acatggtaaa ggtatatcta actacccttt aacactagta gttaagaaaa atggtgtccc 5340 tgatttgacc atggtggatt tacctggtat tactagagtt gctgtacaag gtcaacctga 5400 agacatttat gagcaaattt acgatattat tatgaaatat attgtccctg aggaaagcat 5460 aatcttgaat gttttgtcag ctactgttga tttccctact tgcgagtcta ttagaatgtc 5520 tcagaaagtg gacaagacag gggaaaggac tctggctgtt gtgacaaaag ctgataaagc 5580 ccctgaaggg ctgcttgaaa aggttaccgc ggatgaagtg aatatagggc ttggctatgt 5640 ttgtgtgagg aatagaattg ggaatgagtc ttatgaagaa gcaaggagtg atgaggaaag 5700 gcttttttca actcatccac ttctgtcgaa gattgataaa tcgatggtta gtgttcctgt 5760 tttggcacaa aagctggtgc gtattcaagc aagcatcatt tcaaaatgct tgcctgaaat 5820 tgtgaggaag atcaatgata gacttgctgc caatcttgct gaactcaaca ggcttcctca 5880 acacctaact tctgtagcgg aagcactaac ggcatttatg cgcattctga gttcatcaaa 5940 ggattcattg aagaaaattc tattaagtgg ggagtttgat gagtatccta atgaaaaaga 6000 aatgcactct gcagctagaa ttgttgaaat gcttaaccaa tactctaatg agctgcatac 6060 caagaatttt gagaaagtgg atgaattctt gatggaagag atcatggttt tacaggaatc 6120 aaaagggatt ggattgccaa acttccttcc tcgaggtgtt ttcctcaatg ttttgcagag 6180 aaaagtgaag gaaattgctg cctctccaga ggattttgtg gggaaactgt ggaattactt 6240 agagcgagtt gtaatcatag ttttaatgca tcattgtgag aactatccgc agcttcagtc 6300 ttctactaga agagcagccc aaaacttgat tgccaagaaa aagaatgaat cagttgattg 6360 ggtaagggaa atcatcggga tggaaaagct gactgattac acttgtaatc ctgactattt 6420 aactacttat agtaagttca tggctcaaca aaacacgttc atggagatta tgaatgatca 6480 tgggaagtac tccatgataa accttgaagg ggtaggagta atcgacgttg gtcatttgag 6540 gaagcatcta gatgtggtgc aacaggcttt cgatttgaag atgagaatga tggcctactg 6600 gaaaattgtg ctaatgaggc tggtggattc tatggcctta cacataatgt tcagcatacg 6660 aaacatgatt aacaaggaga tggaaaacga gatcatacag gatctgatgg caccacatgg 6720 tggtggaatt gaaagaatgc ttgacgagtc acctttggtt gctgagaaac gcaataggct 6780 caaaaagagt gtcaagcttc tcaaggagtc caaagaggtg gtggccaata tcatggacag 6840 gatttcactt cacgatgata atgaaaggga ctaaggttaa tatgtgatac taatgagcag 6900 ggcactctat ttccattcag ccaatgttcc taatatcctg tttatctcct aatatcaaac 6960 taccaagtac tatgttttgg ttttacaata tatctttgcc cctgcttgta tgtaattttc 7020 gtatttcttg ctattagcta aatgcaaatc aagtttattt gtacgaactt aatacttttt 7080 tgtttctgtt ttctgaaggg ttcttttaca tatttaccaa tatccacccc tttcaccctt 7140 tcctatagaa aatggagcta ttttttgtga aagtttttaa cgaggacaat aaaccgaagt 7200 tctaagaaca atgaaactta gtcactagtg ttgttattga aggaaaagca acaagaaaaa 7260 caaaaagaat ccagaagtcc aaaaattttg gttgtttcag aagcaccagg aagatcaaat 7320 caaacagaat gtaccgatgg aatggaagac atttgcaaaa gggattacat aaaaaaatga 7380 tgaagaatta ctcagtaaac tacccaaaga tcccttgagc aaaattctag gcaaataaaa 7440 catctcaatg aaaagtaaga ataatgatca taattactac ttctaatgca taaaaggatg 7500 tatgaagtaa aatatatatg aaactccaaa gcaaatattg accaaaaatc attgacaaaa 7560 gaaaaccaag actgtccaaa acacccaact tcactaaaat ttcaagaatt ctaatttata 7620 caactttttc aagaatacta taactaagca gtaatgcttc ttagacaatc aaagtcaata 7680 ttgataatca aaatcaaaga caggagctga taatggctca agcaagttgc tcgtcccctc 7740 gtgcatgtca atattctgca actctagttc ccctgcatcc acttgtaatc cctcacatga 7800 gctttggtct tgttcaccaa caatattcaa tttcccttta gggcgacttt tcttcttctt 7860 aatagcacat agaacaaaat ctctgcaatc cttgtcaaat ttgtcaagta tatgcggaga 7920 gaggtcgtac tccttcatca accagtgacc atgttcctgt ttataccctt tcttcttata 7980 acacatgctc ttcttggatc caatcactgc tctttcgaac aggtttgctt ttgtcttcct 8040 gtttccaact gccaccctta tttcccacat tacgacttgc ttttcttctt gagatttgta 8100 atgaagaagc gatactgact acaatcatcc tcattacaag aggatactcc ttggttcttg 8160 ttcaccgtaa gtatccacat gaaaagtgat gaatccatca attttccacc aatgaatctc 8220 aataagaaag tgagagcttc ttcatcagta ggactgaatc ggaaaccctc ttccaaattc 8280 tccattatac actaatctca aattctcttt ctgttttttt tttctttctc aaattgtaga 8340 aaagaagaaa acagagttgg gattttatac agagaagcga agttgtaagt aaaattttta 8400 tggaaacttt ctacacgttt tctattaaca gaaaaaacat atttggaaac ttttgttgta 8460 atattttatg gaaattttta taccaaaaaa aagtgaaaga atttggaaag tttttttttt 8520 cttttttttg gaaggttgag aactccagtt ttaagtttat tattttgaaa ataataattt 8580 ttagtatatg gtgttagtga caaaaaaata atgaaatatc atttagaaaa caaaacatag 8640 ttaatcatag ttttgttcaa tgtgattctt tcaaaattca tgcttttcaa aattaaaatt 8700 gtttataatc attgtgtact ttttttttaa ttgatactac tgtctaagct atctgtcata 8760 tgttttaatt attttaattt cagattttga gtaataaaat tactgataca ataacttatc 8820 aaatgtaatt cacaccttat gagggtgatg cgtacatagt tttatcctaa tcttgtaaag 8880 gtagatatgt tgttaccaat agatcgccgg ctcaagtaaa acatgtcgaa atcagtgaat 8940 aaaaggaaat accatagtga cagaactcat taggacagtg gagaaaagaa cagtagcaat 9000 aacaaataat acaatagtca aaacaatgaa aacacaaagt aatagtatga ttgaagaata 9060 aaagaatgca tgaacatcaa tgatgatact aatatcgaaa actagaccat gatcaactat 9120 ttactaacct tctattctaa tccacaattt ctatattctc ctatacattg tcatgtcctc 9180 gattcgtaag ttgcatgtca tatcatgttt aattacgtct cctcaatact tctcctaaga 9240 tacactacaa ccaacttttg tcactcatca ccatccttaa ttgtgcattt cctcttcaca 9300 tatacaaacc atctcaatct catcttgttc tccacagagg ttactcacac cttgtctcca 9360 atatctatgt tgctaatctt ctctcttggt attttcacac atctatctca acattttcaa 9420 tctatgttac ttgcatcttt tgtttgaatg tgagagttct tgaccatcaa cactccactc 9480 tatacaacac atctaagttt ttgtaacaca tttttatcat acaatacatt agacgtgagc 9540 attcatttta tccgctctgc tcccacacaa tgtacaatat catcatcgtt aatgcttaaa 9600 tacttttacc gtggtagaat tctattttgt acatattttt cttgttttta tggataccat 9660 acgatcaata ataacaaaat attatttccc tacaaaataa ttatcacatt tcttttacag 9720 agacatgtac attagaagtt tattatttaa cacaacttat tacaaagata taaatgatga 9780 aagagtccaa ttatgaaatc aaaaccaaat caaccacaaa gcttcttcct caattgaccc 9840 tctccgatgc tctctgttcg agacgttact tcataccctt tttctgccct aataaaaagt 9900 cacaaaaatt aaacattgta atgtgtacag aattgttaag aagcaatgaa aacttgaaat 9960 tagtaaaatt ccatgaacaa aagacggata caatcactcg cacaaatgaa aggaaattcc 10020 aaatcttgtt caactttaaa ctagaacaag gatgtatatt tgtcgtacta caaattgttg 10080 ctgtcgctgc agagctaaca ggaagtaata tcttcttcat ttgattgttc acaaggacaa 10140 acaaacaaaa tctatgtcat aacgaggaga acacacttaa acagatgggg cacaaacttg 10200 cctgttgcgg ctgctgaaaa gaacaaggta gacgggatct tgagatgaaa gattgaaaag 10260 ctgaagagct atataggcac atgtgctgat gctgaggaaa tcaacacaaa gcacgaatta 10320 gatataatta tggtccaaaa 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acctgccaga acaaattata agtattatcc ataaagctgc actcagccaa 11220 cttgattcct tataagcaac ccaaacctga aaaaacagtg caactcatct aagataaata 11280 atcacatgaa aagtcctaac tgatgatttt gacacctaat gcagcaactg gctctagcca 11340 tatatcgaat tttacaaact ttggacttcc taaagcaaag gtagataaat agaggggaat 11400 ttcccaaaaa aaaattattt taaaaaaagg cagatgaaca gtgaaaagct taccgagaga 11460 gccacaacac caacatagaa atcaatcact gttgctatca cccacctgca cataaattga 11520 cttcttaaat tgcatgtcaa agtaagactt ataccaagca gaaaattata atcggctgat 11580 gtaagaggat gcatatgtat tacttctgca caaactcatg aagtttgttt tccagaacaa 11640 cttctaaaca aatttgcaaa tgatagaccg cagccccttg gacaaagaag aagacaattt 11700 tctagggttg cacgacatca accagagtag agagaggaaa tgctgataag tttcatgaat 11760 ctaggcccta agaatgacct gtacatagtg aatccattta gaggaagaaa gagcttattt 11820 tagttagact ttgcaaacca aagaagagga taattaatac aaaaattccg attgaaattt 11880 agcatcagag aaatagagtt cgaaatacca tagataccat attatccgac atatgtcaca 11940 ctgaaggtag tatcatgtta catagggaaa agttataaag ctcaccatag atcagtctaa 12000 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