Dbfetch
ID CU019604; SV 4; linear; genomic DNA; STD; PLN; 91524 BP. XX AC CU019604; XX DT 04-JUL-2006 (Rel. 88, Created) DT 31-AUG-2006 (Rel. 89, Last updated, Version 5) XX DE M.truncatula DNA sequence from clone MTH2-51H16 on chromosome 3 XX KW HTG. XX OS Medicago truncatula (barrel medic) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; OC rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; 50 kb inversion clade; OC NPAAA clade; Hologalegina; IRL clade; Trifolieae; Medicago. XX RN [1] RP 1-91524 RA Smith M.; RT ; RL Submitted (31-AUG-2006) to the INSDC. RL Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. RL E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: RL clonerequest@sanger.ac.uk XX DR MD5; 30efc6c58cb102b471aa210fa7e472af. DR RFAM; RF01917; MIR2587. XX CC -------------- Genome Center CC Center: Wellcome Trust Sanger Institute CC Center code: SC CC Web site: http://www.sanger.ac.uk CC Contact: vega@sanger.ac.uk CC -------------- CC CC This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions CC were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or CC covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was CC made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; CC all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was CC confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone CC being a YAC. CC CC The following abbreviations are used to associate primary accession CC numbers given in the feature table with their source databases: CC Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP; CC Information on the WORMPEP database can be found at CC http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep CC CC MTH2-51H16 is from the MtH2 Medicago truncatula BAC library (MT_ABb) CC VECTOR: pBeloBAC11 XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..91524 FT /organism="Medicago truncatula" FT /chromosome="3" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="MtH2 Medicago truncatula BACs" FT /clone="MTH2-51H16" FT /db_xref="taxon:3880" XX SQ Sequence 91524 BP; 31078 A; 15293 C; 14766 G; 30387 T; 0 other; agggtaaggg tacccattgg tgatttgcga ctatgttttt tgtgttttcg ttcttatcaa 60 cattcgtgtg aactcggctg agttgtttcg agtaagatac taaaggagta aatagtcaat 120 ttcccccctt aaattgtaag tttcatcaat tattctttga aattaacaaa acttcaatta 180 cctcctgaaa tttcacaacg ttagtcaatt taccccctcc gtcaaatttt tctgttagtg 240 aacatgacgt tttgcaaata cccctctgaa gttttgcact tatgtgcaaa atgcctccca 300 aacttaaaaa tttatattat ttttttctta aaaacaaaca attaatagtt aaatattaaa 360 gctaactatt aattttggag tttggaaaaa ctacatacat atatacatca aaatagggaa 420 aaatgtgtat ttttaaagtg ataataatgg ttatttttaa tagacaaatt attattttta 480 gaggtttata aacaaattaa taatcagatt taaatttata ttttctcctt caccatctta 540 atcttttaac tcctccaact ccttcaacaa tttgctcaaa ccatttaaac tacacaaccc 600 ccaatattaa tccacaaatc atcccattat tgtcacttta aaaaatacat atttttctcc 660 attttggagc ctattttgat gtgtatatgc atgtagtttt cccaaattcc aaaattaata 720 gttagtttta atatttaact attaattgtt tgtttttaag aaaaaaataa tataaatttt 780 taagtttcgg gggcattttg cacataagtg caaaacttca ggggggtatt tgcaaaacgt 840 catgttcact aacagaaaaa tttgacggag ggggtaaatt gactaacgtt gtgaaatttc 900 aggggggtaa ttgaagtttt gttaatttca tgggggtaat tgatgaaact tacaatttca 960 gagggaaaat tgactattta ctcgatagta aatcttaata ttcgaacgat tatcgagcat 1020 gtgcttactt ttcgcactcc ccgtttttgc tttgtactgt ccgaatcatt acttttcaag 1080 gggtttgtac tttagtattt tttttcttgt cagtcaggat ataatctgta ttgcatagtg 1140 gttctatttt gtgtttagat ttagaatcaa atgaattttg gaatgttcaa ataccaaaag 1200 tgtttttcat tatggctaaa aaattttaga atgaagaaag ccgaaaaatg atatgcatgc 1260 agtctagttt acaccagggt tcaataagaa cagagcattt agtagttatt tctaacagac 1320 gatcaattct tattaaatga tggtgtaagc tattttacac catctgtata actattaaac 1380 taaaaaatat ctgtttttct ctttaggatc gatccaacca gttcgtcacc agattggttt 1440 ggtttagttt ttccataaaa aattacaggt taggtaccga cccatgtata ccccattacc 1500 ctgtcccttt atttctaagt tctaacaaaa cttgaacttg gtattatttt cattttttac 1560 caacattact agcaggcatg gattcaaaag actaaaatat aaactgacaa atgcagccaa 1620 aacagatcat aagccaaata attttaaagc ctgggtacca aataaagaaa ttataaatag 1680 tttctacaat caaccatatc catattggtg gtgcatggtt atcaacattg aagaacagaa 1740 agtgagcgca gttacaagga agcctattca tgtatgtgtt cacattaaac atgctaacat 1800 tcctatagaa aattcaaatt cagcattcca cagtgtatac aatcacagat ttctatcagc 1860 accaacttgt tataacaaaa ttctctatca cggtaagcaa tatagcttca gcctctgctc 1920 gggaaaacta atgtgcttgc tggttctcgt cattacttgt atagaactag ttgcttcttg 1980 cagcaccggg taacaagctt gctaaagatg gaactccttg atttctcatt tcttcttgag 2040 cacgtttcat ttcttctgga tctgttgcac cacaatacaa tgaagttatg agcacaaatt 2100 atgcaaagag tacagcaata atgtgctgta taagactata caatacaaaa caacttccat 2160 ttagattgtt tcagaaataa tagatgccat ttcatccctc gataatatgg aacaacaata 2220 aagcatgcgc gaatagagac aatctagagt gtatctgtat gtattgcata cttctgaagg 2280 tgtggtactc aaaaatggaa aagtatactg tacaaagaag aggccatcaa accactgttc 2340 caaatttgaa ctggtaggct aagaataatt ttcaggcagg gagacagcac acataccaga 2400 cccttctcct cccccacccc atcaccaatc taacaaataa agcaaatcaa cattgtcaaa 2460 attcaagagt gtcatgattt ttcgaagtta gagatgtgag tgtgagccaa ctgggactag 2520 tgagcaacta aacaagtttt tctttataaa cccgttagtt taacaaacat gtgagaaaca 2580 atgacgaaaa aagtcataca tcttaggcac atagaagaaa atacaaacag aaaaaacaag 2640 aaaacttttg acaaaaaaaa aacaaagaaa actgacattt taaatattta aggcttaaga 2700 gtaacttttt tttttttaaa actcggtatc cgatccaaga atcgactaat ccgaggggac 2760 caatcccacc gcccacttgt gggggccccg tttaaagcca gagcaagctc tgtatggact 2820 tagcccaccg aaattggcac tagagggaat cgaacctgag acctctggag gagcaaactg 2880 caagatccca agccaaccac taggcaaacc ccaaatgggt taaggcttag agtaactgaa 2940 cattaaaatt caaaatattc aagaaaatgg gtgacaaaac aaagtttttc tcctgggcat 3000 ttagtggcca tgaacaacta agattttggc tgctatagtg atagcaacag caagcttatc 3060 tgttatagaa tttcaatagt gtctgctgga tgctctgcta ccctactatt gactagctta 3120 atcccaaagg atttcaatag cgtctgccgg attctctact tcaaactcga attaaagaaa 3180 gcacagccta tgagttgggg gacagcaaag tatttcaaat gggagccatt gataagagca 3240 catcagggta gaacaaaatt tcttggggat ggagaggaag aaagatagga tcacagaagg 3300 cacttcagac attttaactt gacttcaatt tctgatgtat gctttgaaac ataaattgct 3360 gctatgggat aagactagtc taataaaatt ctatcgaacg aactaagtaa ttgtttcatc 3420 ctttcaaagc aagtacaata tagacatgca aatgagatta attagaaaga agttcggaga 3480 tgagttttag aaggcgtacc catgttctcc attaatttgg gcataaggaa gacaacaatc 3540 agcataaatc ccatcatcag acccattgga cttttcacaa tggacatgat agagaatggc 3600 tccctaatct gtagcaaaac aatatagcag gcagatattc agataatatt ctttgaggga 3660 tttggaagga aataagagca ggaaatttgt tgtctaaacc aacctcatag tattgttcct 3720 ccttcaatgg ctctaagaca aactcactga gccccctcct attttctgtc agagctgcct 3780 gaattttgcc agggtttctg gcactaacat caactcgtac ctttttttaa tgaacacaat 3840 aatttaatac ttgagcacac atgagaaaaa aaatattagt gaaaaattat agacgtagtt 3900 tccaaattga atacccaccg gagaaaagaa atagcctttt gcagccactt caattaaatg 3960 agtccctgca ggcacattat ggctgaaagc gtagacgtta aggaacttga tcgtttctta 4020 acaatgattt accagaatca actataactt ctcgctcaaa ggcaagaaca agaagatacc 4080 aaatatagaa ttaaataggg ttaatatccc aaaaaagtca tcatgcaaat taaaaggagg 4140 ttgaaatgag gttgtaaagg atacaatgag aaatatccat caggcctcaa aaaagaaact 4200 ctttgaccac cattaagtat aactttgaca tttgaaactt ttgcaggaag gctgaattct 4260 tttgttccaa aacctgccaa aaagatacag cgataccatt atacaacgaa tatttatagc 4320 aaatccatgt attgtccgag aatagatgtg caacacgcag taagaattat ggaatacaga 4380 tgataaacta ttaagttttg acagttcaac ccctaaatca ttaacttcct cccaaccttg 4440 ctgaacttgg caaaactaac accaccagat aaatctgatc aagggacaaa gatagaaggg 4500 acactgtttc ctatataaca ctttgaaaat ggaaatacca tgaaaccaaa aatgctattt 4560 ttgtaattga aaattaaatc agaaaataaa aatagaaacc aaacaaggca taatgagcat 4620 aaaaacaaaa caaaacagtg cacaaggcac tgataatgca ttaaagcatg gttgaaacct 4680 attctaacat tccaaacatt gttttagcca aaaatcctaa atatttcatc ttaaaaatca 4740 aatataaact ggcaaaaact ttaaaccagg taactttcaa gcacagtcaa ttctggtaaa 4800 atcaaattat gaacaacttg aataatagtc caggatgcaa aaatcaatct tgtcaccaca 4860 ccaaaacatg tactatgaat ctatgatact atcctcgttt aaagattgaa gttcaatact 4920 tttgttattc taaattacta ttgaaattca aattaaacat caaacattga tcgggatata 4980 aactaataaa aaaaaaatag aggaaatcaa attcaaatga atgttataat gatgaaaggt 5040 gcgaacttac tagggatctt gactcgacca taaatagtgt acccatcgga agacctgcaa 5100 aagaagttat taaattcgtt aaaatcaagg tgaattaacc gatgcaatcg gaaaatagaa 5160 attagggttt aggggatatg aaattggtac ccaggggtag gggattgagc aaatgatgag 5220 ggtaaaattg agaagcagaa ttgaatgaat agaaaaagaa agagtgattt ggtgaaggaa 5280 gccatagatt gccaatattg ttgaaaacac actgatctgt ttgtttaatc tcaactttgt 5340 ttttgttctg cttttgcgca cgcaatatac tttcgacttt ttggttcgat ttcttgggat 5400 ataataataa taatataact agatttttct aaacagcaaa tggtcatttc ctttgtcact 5460 ttaatcactg gcgttaaata attatgttaa gtgtatcata gagactataa tgaaagtaga 5520 aaattatcac tttaattcct aaaccaaaaa tcaatattcc aaatttaaat ctcaaatctc 5580 taaatgtcat tcctaaatcc ctaaaaaaaa aaccttaata tgtgactttt ttctattgta 5640 aaaaataaaa tgtgcctttt ttctaaacat ttatgtacct tttttatgtt taatggtaaa 5700 attttgtcca cagtattaaa caatcaactg tgtaacaaaa aaaaataatg ttgatattat 5760 taatctctat ttttaatttt aaataaaaga acactatatt ttgaccaaaa ataaaaaatg 5820 ttatattaat attgtcaaat aagataataa attaaggatt tgagattttc aatttaaggg 5880 atttaggggt tacatttagg gatttaaatt ggggatattg atttttgatt cagggattaa 5940 agtgaccatt ttatacttcc actttagtct ttgtgacaca cttaatagaa taaattaacg 6000 tcagagacta aagtgataac ggaaatgcag agttagagac tttgtattta atcctgagtc 6060 agggacctat gtgacaacaa tgtgtggaat tatggactaa agtgactatt tgctcttttt 6120 ctaaatgatc atgaaggggt aaatgtttag atttaacaaa ttttatttat tttttatctc 6180 ttctttaaaa atactttata aaaaaggata atgttaacca gtgctccaag agcaatggtt 6240 aagcatccaa aacaagtaca ttttcatgaa aaaattgtgt aattattact ctatcaaaag 6300 taacatctta tatttacaag acaaaatttc tatttgtata tttcttaacc agtgccccaa 6360 ggacaatggt tagcaagacc ctataaaaaa taggtgtttc ttttgattta ggcttaattg 6420 tagtttctgt ctctaagtat cacaatcttg cgattttggc cccctataaa aataataata 6480 aatcaacctc ctaagtttac cctcttttac acttttgatc ccagaccaat tttgactaag 6540 tcaatacatg cgtggcacct cactttaagt gaatacattt agcatcaaaa ttgggtgcca 6600 catatgcatt gacccaatac atatgtggca cttcacttta agtgaataaa ttgacctaat 6660 caaaattggt atgggggcga aaagtgcaaa aaggggtaaa cctaaagggc atatttatta 6720 ttgtttttta taagaatcca aattgtaaga ttgtgatact tatgaggtca aaattgcagt 6780 taagcctttg atttaacatc aaaatggcca cacaaaaatg tttaatggag atggatgaaa 6840 aaaggataat gttataaatg ttatatgact taaatgacca atattaaaat ttaaaaaatg 6900 taaatcatta atatgataca aacgtgaaac ttaaaataat gtgtgatgca tttagcttta 6960 aatcatccat tagaaaccat ctatgtttat gcaatatatg atttttattg ttgaatgaaa 7020 gaaaaatgag cactagttta acttcgaata ttgaagtata tcgacatcat catttgtaag 7080 agaaaaaaaa atcatttgag atttttttgt atattttctt gacggtattc ttagaataag 7140 acatgctaaa attattcaaa cttaactaaa gatgagtgag gttgagtatt ttcttgatga 7200 accggataaa gacgattttc tcgcaactat gtttttgttt atatgcatca aatagatgat 7260 ataaatcacc ttcacctttt ttttatcatc tctagacaat taaatgggta tagtctctta 7320 aagcaaaagt tcaaaaaatc cacctttata atcacttcaa atagtctctt aaattggtcc 7380 atttatttta aataataata attagatcaa tccaaaaatg attttttttt atttaaaaac 7440 tatattttaa tttgtagatg ttgacaagtc tttaattttt ctaagggtta ataggtcttt 7500 accccctata atatagatca cttttgattt tctccactgt aaaattttgt tgtcagactc 7560 catcattgta aaaataattt gttttagaat attcccctag acatgctgac tgtgcatttt 7620 tcctgatgtg gcatgctgtg tcaccttttt atgatgacat gacgcgctga ctgtatattt 7680 tttttattag gtacacgtgg catttgtgat ttttttaaat aaaaaaaaaa gttcttaaaa 7740 aaaaaaaaag taataaaatt atggaaattt tatgaaaaaa tctggaaaaa ttaatataaa 7800 taaaaaatct ggtaaaatga aaaataatga aaaaattatg gaaaagatta atatatatcg 7860 aaattttcta aaaattaata tatttagaaa aaaattaaat ttccagattt tttttcaata 7920 ccggtaaaat taaaaaattt tggaaaaaaa tggaagaaat tcattttttt ttcaaaagta 7980 agaagtttta tttaaatatt ttccaaaatt tagttttttt aaatatgaat aatatttttt 8040 caaaaatttt gttttgttaa aaatgattaa tctttttaat tttttaaata tgatattctg 8100 gaattttttt ttgaaaattt caatatatat taatcttttc cacaattttt ttaaatattt 8160 ccagattttt tttataattt ttccatattt ttatttagaa aaatcacaaa tgccacgtgt 8220 acctaataaa aaagtaaaaa taaaaaaata attgagaaat tcatgtgtgc aaacaaacat 8280 aacacgtcat cctatacaaa caaccaatca gaaattttta tttaataaaa ttaaaattaa 8340 aattaaataa tagacacgtt ctatcctctt cttctctcgc ggaaccaaaa tccaagtagc 8400 atatacttcc ttccttcctt cttttcttca aaccccactc taactctgat gaattacatg 8460 atggtaatta gtgcttcttc ctcttacaat atccttgttt ctcattttct tatttaaatg 8520 caacttccca tcgattaaaa tttcaatctt ttctattgaa tttttcgtgg tacgtatatg 8580 tagattactg gtgttgggtt tttgccatca tgtaatccct tcatgaaaat tatactccaa 8640 ctcccacttt caattacagt tgtgcgcata tgtaatccct tcattaggat ttttcaattt 8700 ctttgttttc tgtctttaat ggaatacatg cacttttctt ggtttgtttg ctaaataaaa 8760 ggcaatagaa attgcattgg tatgaagaat aggttgtaca gtagaccatg tgacaaatga 8820 gtatggtttc ttaataacaa ttaggaaaga aaatttgatg tgatttttga ggatttgagg 8880 tggagggcta aagttgacat gaatgaaaag cctattaggg actttgtctt gctatttcta 8940 aattaactac tgttttgaag ttgggtctta gaattgatga ggagaagatt ggtggggatt 9000 gtgttggtat gactccaaag gaaaacgatg gtgataagga gagcaagata gattctaatg 9060 tgtttactta tttttatcct gaatagttaa gagtgtttga atttagtttt gtatgtgatg 9120 tctatattat gatgctcatc aatgaaaatg aatatatgcc aagacaagta cataacaagt 9180 atgttgtatc aaaaaactac atatcaaata tcaatagaaa gtgtaatgta atgtagttga 9240 taatgaactt acagtgctat aattgtacaa tttgctttta tttggacggt ggatcctttg 9300 ttgaaatgtt aatggaaagt gcttgctatg agggagaaat caaccatcaa tatggaagtc 9360 atatcctgag cacaagaacg atagatacaa tgaagagata aaaaaagaaa cggttgagtt 9420 ttaagaagcg ggaacaagaa ggaaagatca tgttgaaaga aaaaggtaga aaagaaaaaa 9480 aaaagctgct ccaaacatgt tgaggaaaga acgtgtctat tatttaattt aattttaatt 9540 ttattaaaca aaaaattttg attggttgtt tgtataggat gacatgttat gtttgtttgc 9600 acacaagaat ttctcaaaat aatatacaac cagcgtgcca tgtcatcaaa aaaaggtgcc 9660 acatcagcaa aaatgcacag tcagcatgcc tagggggtat tctaaaacaa aaaaaaaaat 9720 tcaatgatga aatttgacaa aaaaatttta cagggggaaa accaaaagtg acctatatta 9780 cagagagtaa atgcctatta accctttttt taatatataa taagatagta tttataatct 9840 cgaatatttt attcaatgat aaagatgtta ctattattta tatatatata tatatatata 9900 tatatatata tatatatata tatatatata tatatatata aacttttgca ttgctaaaaa 9960 ttttctataa atacttatca tataaaattt tgcccacgca aatcaacaat ctaaattcat 10020 cactagaata agtcaagacc tattttgaca acttcaatca tagaactaaa aacaaatatc 10080 agatggtggt aaaaaaatgg taaatagata aatttgagat ggactctatg gtaaaaaatg 10140 ttaaacttca ttttactctt gtggcaagaa aaggaaagga gaattgttgt tgacacattt 10200 ggtttggttg agacatacaa gtaatttact taaatgcccc tcatcagtta attgccgaag 10260 ttttagaaaa ccggctgtag ttaacttccg aggatttcct cggcagtaaa ctgcagaagc 10320 gtcttgaagc caaaacagag gtactagctt catttcctga acctgtaatg tgtttcaaac 10380 acaaaacaca acatatgtac ctgtttattt ttatttttat gcataacagt tcaaatgaca 10440 aaacaaatat tggcgcaaat gcacaactta attaaaccaa catttttttg taccattaaa 10500 caaagtaaaa tatcccatga aattaaaatt aatgtcgtca taatacaaat atataaatca 10560 atgtcatcaa aataccaaaa ctaaaaaaca agtcctaaaa aacaaactac tactactggt 10620 cctggtcatg ccggtgcctc ctcctcggcc tctggcctcg cctcctggtc aagacaggcg 10680 caatctgctc cctaagatgg ctgatggcct gaaaccactg ctaaggggtc atgctcatga 10740 cctcctcatg gcctaactgc gcatcagcgt aggcaacatc gccactaacc atgtcataag 10800 tgtcagacga gcttctcgcc taataccgct cccactgcta tgcaatgatt tgctcttcat 10860 ttgctgacct cggaagatct cctggaagag gtggcaaaat ctgagggtga gacaccctag 10920 tgtaccataa cacacagtca tctgccatcc gccatgtctg ctttcctgcc tgctcaccct 10980 aatcggccac cttaagcgtg tgagtgcgaa agtcgacgaa tgcctgcaca atctgaggcg 11040 gtgacagctc tacaacatcc gtcagatgtt tggggacggt ctggacgtct ccgtactgcc 11100 tcaaaaccct ctcgggcaaa tgacggtaga ccctacgacc acctcacata atccagccta 11160 aataccagaa aacctcctca aaattctgga tctccttgtg ctcttcgtac gaccttcagc 11220 atacgtcatc aaactatata cgatcaagca gtgaccgata cgtgaccccc actccgtacc 11280 cttctgaagc ttccacctcg ccgcaaccag atagttttcc atgtagtcag tgttgggatc 11340 aacactgtaa aagccaggaa aattcgccaa aaaccatgga tgcacaaacc aaacaaatca 11400 catttataaa ttattacgca ccaaaaaata taacaaaaaa ataaaagtta aggttcacat 11460 ttataagttt cttacagtca gcagtgtcac gcttccccca agagctttgt ctcaaggcct 11520 acacgcctca gctaactcgc cgtataggta ttcgagtgtc atccatcccc aggaataatt 11580 acgcatcccc gcgtaggcct cctccatggt cgtcagatag accaactcga tgcatttgtt 11640 gcttctatca ccaaacaaca agcatcctat aagatataag agataggact tcacgcaaaa 11700 tgtcctaacc ctttgcaact ccttcatctc ctctgcatcc tccgtatccg ccaatacgtt 11760 agccctacca aggtacctcg tatatagctc ccttagcttc gggtaactaa tgtacctgtc 11820 gtactccgta ccacaaattt tctccgcctc ctactgcgac acacccaagt gcctcatcag 11880 tagtgccgct ccctcatgtt tcggcatctt cttcccatgg ctcaacatcc gcccctcaat 11940 ctgaagatgc gttagacatg cgacatcatc caaggtcaca gtcatctccc ccaagggcac 12000 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