Dbfetch
ID CU019603; SV 9; linear; genomic DNA; STD; PLN; 107844 BP. XX AC CU019603; XX DT 04-JUL-2006 (Rel. 88, Created) DT 20-OCT-2006 (Rel. 89, Last updated, Version 10) XX DE M.truncatula DNA sequence from clone MTH2-139F11 on chromosome 3 XX KW HTG. XX OS Medicago truncatula (barrel medic) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; OC rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; 50 kb inversion clade; OC NPAAA clade; Hologalegina; IRL clade; Trifolieae; Medicago. XX RN [1] RP 1-107844 RA Johnson C.; RT ; RL Submitted (20-OCT-2006) to the INSDC. RL Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. RL E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: RL clonerequest@sanger.ac.uk XX DR MD5; ec1e915f21bbd47fe40f8c9da0742259. DR RFAM; RF00073; mir-156. XX CC -------------- Genome Center CC Center: Wellcome Trust Sanger Institute CC Center code: SC CC Web site: http://www.sanger.ac.uk CC Contact: vega@sanger.ac.uk CC -------------- CC CC This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions CC were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or CC covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was CC made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; CC all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was CC confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone CC being a YAC. CC CC The following abbreviations are used to associate primary accession CC numbers given in the feature table with their source databases: CC Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP; CC Information on the WORMPEP database can be found at CC http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep CC CC MTH2-139F11 is from the MtH2 Medicago truncatula BAC library (MT_ABb) CC VECTOR: pBeloBAC11 XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..107844 FT /organism="Medicago truncatula" FT /chromosome="3" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="MtH2 Medicago truncatula BACs" FT /clone="MTH2-139F11" FT /db_xref="taxon:3880" XX SQ Sequence 107844 BP; 36907 A; 18354 C; 16849 G; 35734 T; 0 other; aagcttatga tagtcttgaa tgacatttta ttcaaaatac tcttaatttt atgggcttcc 60 cccctaaact cattaacact atcatgcaat gcatcaattc tgttactttt tctatactta 120 tcaatggaca tccaactgat ccttttcaac ctcagagagg cataagataa ggggaccctc 180 tgtcacccta cattttcatt atttgtgctg aaatcctatc tggtttgatt gaaaaggatc 240 agaaaaatgg tctcatcact ggcgtgtcta ttgctactaa tgctccaact atttcccatt 300 tattgtatgt tgatgatagt attctttttt gtaaagctaa acttgaggaa gccaatgcta 360 tcatgaggac tctacaggtc taccaagcag cctctggcca aaaggtcaac atggacaaat 420 ctgagattat atttagtcct aatatctcta tggattccaa aaaggaattt caagctaatc 480 tccctatcaa aattagcaat aacattcaga agtatttggg gatgccaacc caccttggca 540 tgtctaaaga gcaagatttt caatttctaa tggatagagt ttggaacaag ttgaagggtt 600 ggaaggaaaa aagcctctct tttgaaggca gaggaatcct tataagagca gtggcacaag 660 caatatctac ctatatcatg agttgttttc tccttcctaa gggtctttgt gacaagattg 720 agaaggctgt ttgtgccttc tggtggggaa gcactgacaa taagaggaag attcactgga 780 ccaaaaaaga aaacctattt aaatcaaaat tagaaggggg aatgggattc aatatattga 840 gagacttcaa cttagctatg ttggctaaac aagactggag gtttcatact gaacctaatt 900 ctctcatttc tagatgctat aaagccaagt actaccccca ttgcaatgtt cttcaggcta 960 ctattggcaa taacccaagc tatgcttgga ggagcatttt taatgcatta tggatcatca 1020 aaaaaggatc ttgttggagg attggcaatg gtcaagaggt aaatatttgg gaggacaatt 1080 agattccctc caatattggt ttcaaaccta tttcttcaaa tagtggctct acttcagtta 1140 gattggtcaa ggacctgatc atggttaata gctcaacctg gaactctgag cttcttaata 1200 accaattcct tggaattgac actgaagcca ttgaacagat tcccattatt gacattttcc 1260 atagggacac tcttatgtgg atgtttgaga aaactggcag ctacacggtc aagagtggtt 1320 acacagctat tcagatttgg aaaaatggtt ctcagaactc tccaagttca agctctgaaa 1380 acactaaatt atggaagaaa atctggaatc tacacactat tcctagacat aaaactattt 1440 tatggagaat tctgaataac tccattcctc tcagaagtga actaggtaaa agaggagtgt 1500 tgtgctcccc actgtgccct agatgtgaaa ctaagattga gacaacagac catattttta 1560 tgcactgccc taatatctcc aaaatttggt ttaggtctaa tcttaacctt aaaactttgg 1620 atctacccat accaagtttc agagactggc ttatgcattc cattctcacg ctcaaagaag 1680 atacgataat acagatagcc tctataactt ataacatttg gcaagctcgt aatcagagca 1740 tatatgaaca catgtataaa cctgaagcag acataataca gagatcagat cgttgcgttt 1800 ctgactttct ccaagctcag ctcagcgaca cggtggataa tctgaatcat gacatcagct 1860 attccaatgc tcctcaccaa agcgttgctc gtcgtcaatg gcaaccacct ccgctgggaa 1920 tttttaaagg caacagcgat gctaaccttc aacaaactgg ctggtggggc ttaggtgcta 1980 tcatcataaa tgatttgggt cttgttatgg cagctgcaac ctggcgctta aaaggttcag 2040 aagaggtcat cacagcagaa gccttcacta tgcttcaaat gcttcgcctt gcccgagact 2100 gtggtttcag acatatggaa tttgattcgg acaatgaaaa aatagtccat ctagttcaaa 2160 atgagaagaa agagaatata tcataccttg ggttgatttt atctgaaatc agggtcctca 2220 aatcttgttt tgacacatgt catattaagt atatctctag gtcttgtaat ttggtggctc 2280 acaatatagc ccaacttgcc cattctagcc tagacacaat atggttagag gaggttcctt 2340 tagatgttca agaggtgtat tatcatgatc ttttgattaa ataaattcag tcttttattg 2400 aaaaaaaaat gatataagtt tttttttata tagatattag tattcatatg tattgggtat 2460 agccaatggt ggccttgagc acggttgata taagatatat atatatatat atatatatat 2520 atatatatat atatatatat atatatatat atatattata aaattgtata ttaatagttg 2580 gatagattgt aatttttaat actagtgcgt ttggaaaaat gtcttttgtt ttatgtattt 2640 gtacaaaaag aaaaaacaaa agaagaaaat tcaaaagaat ctatgaaaaa gagatcaata 2700 aataattatt atttttgatc ttcatggtct aatttcaata tggtaaatga agtaatttat 2760 aatttaattt gtacataaaa taatagaaca ttacaaaatt tatgtgatca tttatataaa 2820 aaaaatcaac tatttgatag ataaaatata cataacatat aaatgtaaca aatgttaaaa 2880 tttacgaccg ttttgtattt ctaatatata taatattcat tctcacacga aatgcatgat 2940 cctaatagtc atatttaata cattaaaaat gagagaaata tgaatcattt gtataatata 3000 ttggtggatc gtgtatgtag ttgagagcgt tgtgtgcgat taaaatacaa ctcacacaat 3060 catatgcgat gcagaaataa agaataaaat atatattact tgtaagatat ataggtggtt 3120 catgcattta gctaaccgtg ttgtctgtga ttgaaataca tgaatccaaa agtcatgctt 3180 aattcatgag atgtgagaaa cttaattgtt tgtgatttat gtaatattta ttttttaatt 3240 taaaattaat gatatattaa cttgctttga tattttcttt aattaacaat gcatacattc 3300 actaaggtat ggtaaaaaaa aaaatacttt cttaattgaa tcaagcaagt tgtgaatcaa 3360 ttcacaacaa aattcaatat tttaatggtt ggtttcttaa caatatttaa gttgtttaat 3420 atttctactg ttctatatca acaaaaaaaa aataattgtt tatcgaacgg aactttatct 3480 tatttagttg gaaaaaataa attggtggtc atgacttgtg ttgtttgttg cgatatttct 3540 tatatttatc tgtattttac aaagttgaag tgtttttctt tagaataatg ctacttataa 3600 cgaattatat tttcatgaca catcgagtca tgtttaatcc accaacacaa ttttgttgac 3660 ttttctatct atctacgact tccaaataaa ttctagcaag gattgttttt cattggttga 3720 attcattttc atgatgagtt tgtagaaatt tacttcgctt tatataacaa ttttttatta 3780 ggaattttca tcctttatta taaaagttag atttggttgg ctaccatatt tgtcctaacc 3840 cctaacattt ttccctccta aacatgtact aattgctaat ataatctcac ccgtttaaac 3900 tctattttca cacttgatca cacccgttga ttcaaactct aaaaatgttc tctcatataa 3960 cttagttaat gcaattgaag acgtattaaa tgctaatcaa gtcggtcaac aaccccctac 4020 actaattgct aatctaatat cacccgttca aactctattt tcacacttga tcatacccgt 4080 tgattcaaac tctgaaaatg ttccctcata taacttagtt aatgcaattg aagacgtaat 4140 aaatgctaat taaatcggtc aacaacccct tgcactaatt gctaatataa tctcacccgt 4200 tcaaacttta ttttcacact tgatcacact cgttgattca aaccctcagt tgtagatatc 4260 atatagaagc gaacatgttt gccctaattc accctaattt gccctaatcc ctagcatttt 4320 tctctcctaa acatatattt attgctaatc taatctcacc cgttgattca aactcctcat 4380 tttctctcat ataacttagt taatgccaat tgaaaacaaa taacatactt ttagtgcaat 4440 tgaagacgta gttaatgcta atcaagtcag tcaacaaccc cctacgtctc agccgtagat 4500 cccataacaa caccctatga gattctaact acccaatcgt catcctctat gtacacatat 4560 aactatgatt caaactctcc attccactca atgtatacac gggcgttgac accctccttt 4620 gtttgcagtt tacatacaac tataacaaat tctatcaacg tatcatcaaa cctctaacgg 4680 ctgaacatga tgttgaaacc atgttggtgt tgcattcctt gaaaggttag taatctgttt 4740 atgttggatg cttattctgc gtgttcattc ggacttgaaa ataacttttt tcttcttcat 4800 gtttttacag ctccattgga tccaattatg atcaaaattg tccatgcgaa ggttgagtct 4860 gtcaaacaaa attgagattg gttgcgtgta atttgcattt gtgcaatttt ggtcatgttg 4920 gcattttgca tctgttcaaa ttgcaacttt attcaatgtt gctggattgt ttttattttg 4980 gttacaagta cttttagtta tcatctaatg cctttatgtt gattgttttg taatccaaac 5040 taagtatttt atcaatcctc atgatttcgt ttgtgttata atcgatttac aattgttgct 5100 acagatccag ttttcattgt tacaagctgc aatagcaaat accgtattat aagttagttt 5160 ggtaagggat gatgttaaaa agaaaaggca ttcctttaga tttcatcaaa tacactactg 5220 aattttgact tagtgtgata taaagccaat caatctcact tttcatctct atcatataat 5280 tataagggtt ggaacttgat acaatacttt taaggattag aactttatac agttacagat 5340 gcatagtgtg gaaacaagca tatataaaca aatggatatt cgattgatct attaatcacc 5400 aactaatatg agaagcatat aaaatacata attagaacaa agttcttctg acacttatca 5460 atggataaaa aatcatttgc atgataattt ctaacgtgta caatactact atgcaagtag 5520 caaatgccgt cacaccaatg aaatagtgca aagtagattt aaattgacag tttattatga 5580 cattaattct tattgaccaa attcttattg cctaagtgac ttttacgttt acttatgaga 5640 tgcagaatga gtattaatgt actacctccg tcccttatta taggaccctt ttagaaaaaa 5700 tatttgtctc tttttataag acccttttga tattttcaag tgtattaatt atttctttac 5760 aaaattacca ttatttactc taaatatttt tttgaaaagc aataaattct tttttccttt 5820 gataaaagaa caacaataag tttatgtggg aactaccatt ataatgatat tcatgctcta 5880 attcaaaatt agaatcatct cttgattgag gctggcaact gatttatgtt atcatcgtga 5940 tcataaggat taaaatagat gtttaaatct atgttaggtg gttcatggct tcctataatt 6000 tttcatattc agttttctat aagtatatat actcttgttt catgttcctt gtgcttaaaa 6060 atatggcgtc agaaatttgc aaataagtaa ttcctaaaat tttaagtttg gagccttcaa 6120 aatttaaatt ttgggaagaa aaaaaaagag tgatttcaaa tttttgtgga aaaaaaagaa 6180 agttttttct atattcacgt tccaattttt gtgccatggt tattcacgtt ccaatttttg 6240 tgccatgact ttaatttggt gcattattca agtagtagtg ggtagttaat ataggaaaat 6300 aatgaactgt gatttcaatt attagaaggg caaacatgga aaaaatatca tttatcaaca 6360 aatttaatac aataatcaac tttcttaaaa cccgtgtttt ttctaaaagg gccctataat 6420 aagggacgga ggtagtaatt aataaacgtg atggaattga caacgtcaca attaatagga 6480 gacaatcaga attattagca ttaatatcaa aatgttagtc ttctaagttg tgcatctgat 6540 atggatatag aataaagaag agtgttctcc gtgtaaaatg tcgtttaccg tgaaatattt 6600 cgtaacgtat gatgataaat gtaaaacgtt aacaataact agactatgac cttatcgatt 6660 tgttatcatt attttaaatt agggctaact taaactttgt catgctactt ttattggtta 6720 ctatacattc attatgctat aacttcttcg tttatatttc attcggtatc gcacggatca 6780 aaagtctagt ttatataata acacttctgt tttcaatatt ttgaccgatt ttctttttct 6840 tttcaaattg agatgtcatt attttgttga cctaagacac gaaatatctc aaggccggca 6900 tcgaatatag ccatacagat aacaaaatca tgcaagtgtg aatttacttc gggttttcca 6960 catccagaat tattattctt ccagaaatgg cagtggcaag tgctgctgcg aaattaggat 7020 ctcttgtcaa agaagtagcc atttgctgaa ctaataactg ctggatagat gacttatggg 7080 aatcatcaac taccaattgt cttggctgga ccaagtcaag ctttgaagct tgagctgtac 7140 gccaattaat tggtgaggac gaggatgctg gaactaaatt atatgtaggg gttgtttcac 7200 tttggtttga actagtgagt gacatttcag gttggtgatg tgcatggttg tgctctcctt 7260 cgtatgtggt cactaataca ttttggtctt ctacacttct ttgcacctaa taattaacat 7320 aaatgggatt tcattcaatt agtcttactt cacgatgcat aaaggtcaat gtatattcca 7380 tcgatgtcaa cataagcaac acaaaaaaaa taatataaca ttttcttttg tgtaaaaaat 7440 aaacacaata ataaaattaa aaatagaaat taaattaaat gatgtgagta aattatttct 7500 cttttatatt ttatcattta tgcatgtgta tccaaataaa atttacttag ggtgtacata 7560 cgaaagagtt gctcgtttaa tatggactcg gtctagaggt agataatatg atttttagta 7620 aattctaatg atttttttta ttctctattt ttattgttat aatattcatt tctaattaaa 7680 aatcgtgaat actcacctct ggactatttt tttagaggtc cataagacgc atttttttta 7740 catgttagtt caaccaacaa gaatttgagt ttgaaattta agaaaggaag ttcaaatctg 7800 aaagacatct aaaatgatga ttgatatcat ttttattaaa aaatctttcc tttctcattt 7860 ttttatataa gcacatttca ctattccatt ctatgcttgt aagaaaaaac aactactttc 7920 ttcaaaaaaa aaaaaaaaaa ctactttcat tctatttagt ttgttttttt ttggtacagc 7980 attctattta gtttaataac gcaattctta gaacctcaca gttaatttta gtggcccacc 8040 ctgacatttt tttctggctc caccactgaa ggaagttgta agtttttgat agatcgaatc 8100 atcacaaaag tggggtcagg gaccaaaacc caaacgagac atatttgcaa ggatcaaaga 8160 caacaatttt ttttacaggg actaaaacca aaacgaggca tatttacagg gaccaaaacc 8220 atattttagc cttataacaa tattatcagg caagcaagac tcttttactc tagagactga 8280 agtttgatat tttttttttg tggtggtcag ggtttgaatc tcacagtttg tatatattat 8340 acattgtccc taccaactaa gctaaactca cgaggacaga gaccgaagtt tgattgagta 8400 tgcacttatc atccaatcat ttaacatata acatttttta tacttagtta ttttttttca 8460 ataaatttaa attttgaatt aattttttct acaagctacc gctacttagg cccagtttgg 8520 ataaacagat tatatagatg cttatgacat tagggcttat aacattagag ctcacatcat 8580 aagctcttat acttgataaa ctatttatgg ttggatatgt acactaaaaa gtacttacat 8640 aaattgaagt gtttgaatct gacattacat aaacaattat cgaaattttt gaatattttt 8700 aatttaacaa aaaaaatcga accacaaaaa tcaaagataa aagacaagtt aagtttgttt 8760 tatttattca gtttcatttt gttacgtaac aaaaaaataa taaaaatctt ccttaaaaaa 8820 aaaaaatctt agttatgtgt gttactttgg taacataagt atatagcaat tttgttactc 8880 atgcaccgcc aaagataact aatattataa ttaaaatata tgtttgtttc taaaaacaaa 8940 aacaaaaaaa ttaaaatata tgttttgaaa aagtggatcc agagagaatc gaaggaggtt 9000 acataaattc ataagctcct tgttaagccg gaggataagc taaaaattta gacttattaa 9060 aatatgacat aaacagctta tgaaactatg ataaactatt tttatttatt tacccaaact 9120 tttaaaaaag cttatggaag tagataaacc catataaact ctaaataagc caatccaaac 9180 atgaccttaa ttaactcgta cccagctaaa agtgtataaa gaattctcca ttttttttta 9240 aggggggaat tttccttatt tggttgacaa tgtttaattt caagaatcat tttaaaactt 9300 gttgtcctaa attccacgaa acattttgat gacttactat ttttttattt tttttgttaa 9360 cttaattaag agattgggac tactacttct attaattaaa tgggaatttc tatggtacac 9420 tcacaatttt gagtgtactg gtactcttgt ttcataaaat atataaatta aagaccactt 9480 taatgaaata aaaaggtatt tgtcaatatt tatattttag aaaacatcat ttcataagaa 9540 aaaccatcat ttcattgttt ataaggatca tattacaaaa tttacatttt gtcataaaaa 9600 ataatcaata ttcattgtta tgagtaataa aaattcttaa aaattaaatt ttatttcgtc 9660 gaaacttttg gtttataaaa tttaattatc ttagttgtca atgatagaaa ataattattt 9720 ttcttcaaaa aaacaactca tttattatta attttacgac ttggtgtacc gatacattca 9780 aatttattgg gtgtaccata gaatttgcct aattaaatac gttcttctta aaaaaataaa 9840 aataaatacc ttcttcttca cagggcagcc aggagcaaag gaacacttga agtaagccct 9900 aggagagggg ttatctctag tgactttctg accatatttt ctccactgat atccatcctt 9960 cacatacttc aatacccaaa aaacaaattc aacatctcag ttagtatata ctagccaaaa 10020 actattatct ttattatata gttccaaaaa ttatattaaa acaacaaatc tgtatgatta 10080 aatttgaaat tgtagaactt actaagccgg tattggatgc atctgtttgc acaagaacct 10140 tggaaacttt tggcgagatt atgttgttgt gtttgaatgt ctcctcctca gtagtaatgg 10200 tgctgctctc agcaatggca tagccaaacc gattgaaaca attttcaacg ctctcggcct 10260 ttctcttccg cgatattggt gatactaatt cattttcaaa atttgtttga ctgaattgac 10320 tcaaatgctt ttgcaaagca 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gttcgtgaga aaattttgag gaaatgagat gagtctttac tcttttattt 11220 gagtaattat ttatacacat tttaatttct tttgctcaac caaacacaaa ttttaaaatt 11280 gatctatttc ctcccttttc tcttccttcc ccattaaaaa tcctcgtcca ttttgttaag 11340 aacatgtctt ttcaacattg actataatat atttttttag tgtgaatata cggagatcga 11400 ccactttata taaaatcatt tctatgtaga acctatatta attttactaa ataaaataga 11460 gatttttttt gggagataaa taaaatagag tttaaaaaga gagtatttct aatacaatta 11520 gttaaacaaa tatccttaaa ttcaactctc tctaaacttt tagtatacta tctataaatt 11580 agaaaagaaa tactccctcc atcccttaat aagtgaccta gttgatccaa ttacgcatac 11640 caatgcgtaa ttttgagttt aaatatcttg aataatatat tggaaaaaat tatgaaaatt 11700 tgatattttg aaaatactca ttgagacgaa tctaacgaca tcttatatga tattatttat 11760 ctttgtatat tagtagaaaa atatggtcaa agtaagttag gtaaaaattg cacattttca 11820 aacagatcat ttattgcggg acggagggag tacctcttat gaaaaagaat atccaattgt 11880 cagtctcatc ctttgtgacg aagaaaaggg caagttgatg agtgtttccc attgaccgct 11940 atatctcgtc gacttcgtga tggtttgcat taataagtag tagttgcgta gatttcttcc 12000 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