Dbfetch
ID CT990558; SV 4; linear; genomic DNA; STD; PLN; 141443 BP. XX AC CT990558; XX DT 03-JUN-2006 (Rel. 88, Created) DT 19-DEC-2014 (Rel. 123, Last updated, Version 11) XX DE S.lycopersicum DNA sequence from clone LE_HBa-308B7 on chromosome 4 XX KW HTG. XX OS Solanum lycopersicum (tomato) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; OC asterids; lamiids; Solanales; Solanaceae; Solanoideae; Solaneae; Solanum; OC Lycopersicon. XX RN [1] RP 1-141443 RA Beasley H.; RT ; RL Submitted (11-APR-2007) to the INSDC. RL Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. RL E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: RL clonerequest@sanger.ac.uk XX DR MD5; 770111702b4146a141cbcfc37e078807. XX CC -------------- Genome Center CC Center: Wellcome Trust Sanger Institute CC Center code: SC CC Web site: http://www.sanger.ac.uk CC Contact: vega@sanger.ac.uk CC -------------- CC CC This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions CC were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or CC covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was CC made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; CC all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was CC confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone CC being a YAC. CC CC The following abbreviations are used to associate primary accession CC numbers given in the feature table with their source databases: CC Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP; CC Information on the WORMPEP database can be found at CC http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep CC CC LE_HBa-308B7 is from a Lycopersicon esculentum library CC VECTOR: pBeloBAC11-HindIII CC CC TOMGEN XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..141443 FT /organism="Solanum lycopersicum" FT /chromosome="4" FT /cultivar="Heinz 1706" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="LE_HBa" FT /clone="LE_HBa-308B7" FT /db_xref="taxon:4081" XX SQ Sequence 141443 BP; 47646 A; 22715 C; 23613 G; 47469 T; 0 other; aagctttttc tttctctgct tgctctatct ctcacatttg atcatttatc atcagcatca 60 taagtacttg ttcttagacc tttatttgtt gtttcgatcc ttttcaacaa ctgttagcaa 120 attgtcgcgt aaaactatat gtgctattcc aactttcagc ttgaactttg attgttttac 180 caatcttgag ctcaacaaca tcactagtga tcaataggac atgatattat tccctagtca 240 tcattcgaag tttcgctggt gcgtatgtta agagagtgat gcctcacgga gtttaaatcc 300 tgatttcgcc tctgattata ataatctgtg ttttaaaggg gtttttttga acgagctagc 360 catcatgaaa caccatgaga atttacatgg caagctcaag tctttagaga tttatgccaa 420 gtactgtgtg ctccaagcag gcctactcaa atgcttggtg ggctcactaa attttctttt 480 gttgggctaa atgagtaact ttacatatag caaacataaa aattatatat aaaaataaca 540 cactatacac atttaaggtt atatatattg agttataaac atatatttta aaaataaatt 600 acttatagca gattattatc gagttatagc atatcaatta aaattatatt taattaaaaa 660 taaactataa gtaattattt aaatactaat taatatgttt aaatattttt tttatttttt 720 acaattaact ttttattttt atttttaaat aaaataaaaa ggaaaaaaat gtttatttaa 780 attggtaagt agcactaatt atggtatttg aattgatttt aattaataat ggataattaa 840 caaattaaca tatattaagg aattcaaaaa gtatttggga tattgcacaa ttaccctctc 900 aacttatacc cgaaatctca gagacgcact tatactattc ttaggtccta ttatctccct 960 gaacttattt tattaataat tttctacccc ttttcggcct acgtggcact agattgtggg 1020 cccaacggtg gttgactttt ttttttcaag ttagtgccat gtaggtcgaa aaggggtaga 1080 aaattactta taaaataagt ttagggtggc aataggacct tagtatagta taagtgtgtc 1140 tctgtgattt caggcatagg ttgagggggt acttgtgcat tttcttaaag tatttaaatc 1200 attcagtttc cttaaaatgc ttaaattagt ttaaatcaaa ttaaaacatg atttttttct 1260 ttatcacttt ttaaagcttt taatataaat aataaattat tattaattaa atttactaat 1320 taaatttctc attatatagt tgtcttttaa aaaagaaaat ctaaataata gggatttgat 1380 tttacttaat ttcctattat acggttgccc aataactatc cacccccatc tcaaccaata 1440 catatacaga catcttcccc caatacactc catctctccc caacacgcga agatattttg 1500 atcttcccta aatcccgcct cactcattat ctcttcccaa cacgcaaaga ttttttgttc 1560 ttacccaaat cccgcctcac tcatcttccc cattatccct ctcagatcag ttcatcccaa 1620 aatccaaaca tccctctcag atcagttccc cattaagttc atatagaatg tctaggaaag 1680 gtagtgaaac ccaagtaaaa gtaaaagatt ggtcgatgag tctgatgact ttcatgttat 1740 ttcattcgat atattgtcac aaactcaaac gcagaaatca aagggaaaag agaagtgtag 1800 ttcagttaat tcaaaaatga atagaaaaac aaaatcaaag aggcaagaag aggaaaggaa 1860 aagaaattag aacatcgtca gaatccgaat ctgactttgc tgaggattaa aaaatataaa 1920 atcaaaaaaa ataaaaggca ttgaaattga tcgatcaaca agaaagtttt caaaaaaaaa 1980 aagcatcaga gatacaagct acaaataacc cccaaaaagt taataaagtc actaaaaaga 2040 ttatttcaaa tttggattac aatatgttgt gttagtatat ttaatttttg attttatttg 2100 ttaatagtat actacatgaa atttgtatga tttatgtatg agttgagttt ttagtattat 2160 acattataat tatatatgaa tattgaatga tttagtgttg tatgttttgt atatgatata 2220 atttgaatat atcagtatat gatttgatac ataataaatg tattaatttt gtatgatttt 2280 gtgtatgaaa tagttggtca ttatcgatac aggatgtctg cattatgtaa ttacctttgt 2340 atcatatatg tatgaaatga tattcttatc cagtaaaata tatgtgtatg aatgatgtat 2400 taatgttgtg tatcctataa ttttgacttt tataacaagt attgcaacta tatattttat 2460 tttttgattt tgatgtatga attgacgtat tcatactaaa tgatattagt ttgtagttta 2520 aaagttacaa attaattttt tttaaaaaat tgaatatgta ttaatattgt atgaattgtg 2580 tatgaactga ggcatatagt ttttataatt ttcgtatgaa ttgaattaat gtcatcaaat 2640 atgtattaat attgtatgaa tttcgtatat aatttgtatg atttgtgtat gaattaattg 2700 aatgtcaatt taatatagca ttgtatatat gaatttttct atggaatttt atagtatata 2760 aaaagcaata atttagtttt caaattttat aggagaagaa ggttcaaacg catttatctt 2820 cctgtatcaa catgattgtg ttcgctgatt tgttgacctt cctcggtcaa gataagtttc 2880 agcaattttt acaagaaact ccatttggat ttctttatga tttacataac ataaaaatcc 2940 aatgtcaaga gttgcgtcat actttctttc ttaaatctga acatggcagg gatgacatgt 3000 tcattatcaa tgtaaatgat acagagttat attttgactt aaaagagttg attgttgtaa 3060 tcggtctaaa atctggatca atttttgatt ttgtttctga tctatctgtt ccaaatagat 3120 taattgcaga aaatttcaga gactttgaca aagtccccaa gtcaaaattt taccacaaat 3180 ttaaattgaa aaacttttgg gaagaagatg accgtttata atcagtttat ataattcata 3240 cacacttcat acacatttaa tatatcattc actgtcctac aaattactcc aattaaacaa 3300 acacaataca atttcaatac aaaattaata caaaaacata tattctaatt tcaatagaaa 3360 ctagaatatt attttttaaa aaaaggactt tcataaacaa ttgatacacg tttcgtatac 3420 ttttcataca ctaataatac aaacttcaga cttcaaatat gctatacgta acataactgt 3480 ttcattcaaa aaaaaaaata tacaaactgt atttcagata atacagttaa aaaataaatc 3540 aaacactgtt ctacacgtaa aaaaacatta aattaattaa aactaacaat tcataattaa 3600 aagaaataaa tcataattaa aaatcaacct gatgaatgtc acttttcacc atatttaatt 3660 aatattgaca taatgttctc catcatatca aatcaaattg ttgcaaacgt caaaatttat 3720 caggttacta aaaaaacgaa ctgaaatatg caaatatcgt gaaattttgg gggaaaatga 3780 cttctacgtt gatgcaaatc ggaaaataat tgtgaaattt cggaaaaaaa gatgaattgc 3840 aatgatgatg caaataggtt tcaaaatgcc aatctgaaaa taatctgcaa atctgaaaat 3900 aatcattaaa atctgataaa tttttttaaa gaattaaatc aaaaaaataa tatcatttaa 3960 actaactaga gatatttaag gttgtgatgc taatctgaaa acttttgata tccctaaaaa 4020 cgtgttaatc taatattaaa ttttacttaa aatcccttaa aacgtgctag tatacagttt 4080 taaaatgtgc taactacatt taatgtaatt aataaagtat ttcattttcc attattagtt 4140 tgtcggtgtg ttaattaggt atattaatta tccattatta gtttatccct tttttttatt 4200 aattgttaat atcaactttt ttttaataaa ttataattaa cattatattt attaataaaa 4260 tgttatagat tgagatatta aatgctatac actgaaattc aaattctaat gctataactt 4320 gaaaatatta ctatataaaa tgttatatac ctaatttaca caaattatat ttgtatgtta 4380 tagttaggga tgtactaaac aaaaccgaaa atcgaatcaa actgcaaatc gagttaaatt 4440 gggaaaaaaa actcaattat atttggattg gttgtgtttc aactaaaaaa taccaactca 4500 agaccaaacc aacccgacat tatatataat tttaaatttt ttttttatac gcaacatact 4560 ttctttgata taattttaaa tgtctcttat actttttcat agtttttatc tttttaatat 4620 aattatttca tgtttggaag ttagaaattc tcaatgatct aataagattg tagtctatac 4680 gtgttggtaa ttataataaa gttttaatga aaatcaaatt aatgctaatg caaaaagaaa 4740 atcaattcaa cactaagaat gttagtaata ttgaatattt gtttttagtt ttacatagat 4800 ttagacaatt aaaatacatg atctaacttt actttctttt aatatttagt catgtaacta 4860 atacttacta aacttatttt agcatgattt agtactttag attatgatca atttcattat 4920 gactaattaa tttgaaatat ttgttttacg caattttatt attataaaat tgataactag 4980 gtttgttacg gttttgcaac catattttaa gttttttttt tttaaaaaaa aaaaggaaag 5040 tcaaagtatt actgtttgaa cttttcctta atttatattt ttttagagca aaaatttgga 5100 acgaagaccc ttttctttaa ataatcgttt acacaatttt gtttatggct atgcttttaa 5160 ttatttattt attttaatta tgtaggtcaa cgggtcataa taattaggga tgtatatgat 5220 tgggttgact tgaatttttc aaatatcaaa tcaaattatt tgtgtcatat ttttatttta 5280 taaatcaaat caaatcaata aagcttgagt tcttttcaac atcggatttt ttcaaacttt 5340 taggattttt cgtaaagtat tcgtacaaac atataattta cttgtatttc aaatatttct 5400 ttaattctat caaaatataa ctatctaagg tgtttcttaa gaaaataaca caaaatatga 5460 tatgattaat gacaataaaa tattcaacca aaagataata atgaaatcga gtaaaaataa 5520 atagtgcaaa ttaacaagtc ataatgaaat ttatcatatt ttacagatac taagtttaat 5580 aagtattagt tacatgacta aatattaaaa gaaagtaaaa ttagatcatg tattttaatt 5640 gtctaaatct atctatgtaa aactaaaaaa caaatattta atattattgt cattcttact 5700 gttgaaatga ttttttattt atattagtat taatttaatt ttaatttaag ctttatttta 5760 gttaccgaca tatgtggagt ataatcttca ttgactcatt caaaatttta agtttcaaac 5820 ttaaaataat atattaatag ataaaaacta tgaaaaagta taagaaatat ttataaatca 5880 tattaaagta aatattttta tatataaaat attttttttt aattatatat caggtcggtt 5940 tggtttggtc tcggattaat tattattaat taaaaccaaa ccaatccaaa tatagtcgaa 6000 tttttttcaa taccaaacca agtcaaacca aatcactact caaatttttt ttccatttga 6060 ctcagtttac aatttaattc gattttgatc atatcattta ataatattat gcttttcata 6120 atataatttt atatatcgtc tactttatca atatattata atttgtatat ataaacttta 6180 gttaattgat tttgaatccc attttaacta aaccaccata tttacatatt caatctagag 6240 agtctgttcc caataagaat ttttctcaaa gcaacatcgt agcaaaaatg tgacagtaaa 6300 acagttagat gtaagtccaa agcaaataaa agaagaaaaa ttatggaaca tgctgtaatg 6360 aattatattt gtatccattg agaacttgta ttttcatttc aattatattt gtatccataa 6420 tgaatctagt tgtatttgaa atacaatttg aaaataaaat acgtaaaaaa gataatatat 6480 atatataata tgcaaaaata aatttaaaaa atacaaaata aattataaaa tacaattctc 6540 tctcctttct ctctcgatct gatctggccc cgctcgtctt ttccttctta atatgtattt 6600 attaatttga tataaattaa tttgtatttt ttcttttcta taaaattcat gaaaaatatt 6660 ttatttttct tcctcccaga tctcgctcat ctctttttga tattattcat aattaagcaa 6720 actataacta tagaatgcat aaaacttatg gttttttgaa agcttcctaa taaagaaatc 6780 aattattcca cgtatttgta tattcgttca cttttaattg ttattgtatt ttttaaaaaa 6840 ttaaattata aaaattttaa ttaacatttt aatgacattt tttcatcata ttaatatgca 6900 aaaaaaatta taacttgtag tgcttttcat atagttttta attatttaaa atttttactt 6960 aaaaaattag attaatatta tctaaattaa ttttaaaatt aacaaatatc aatggacgat 7020 ggatgacgta gatagattcc ttttttaccc cttttgtgtc cgcaagaccc caaggcattg 7080 aattatttgt ttgtttttat ttattttgtt ttttctttat tttctagagg aagatcttaa 7140 tatataaata agtataattt gacttgaatc aaaataaatt tgattttttt tattcaattt 7200 ggttatatca atacaaaaaa acataattaa aattaaatta gtaatttaaa aaataaaaat 7260 aaaataatat atataaaagg ataagtatta aatatatttt ctaatataaa tcacaagtaa 7320 aatttaaaac acaaaattta aaaatatatt aattatagat gttgaagtat aaaatataaa 7380 ttaaatcata atgaaagaca ataacctaaa aatgacaaaa ataattaact tcaacttagt 7440 tctaaaccta aatatttaat ttatatatca tccataacaa aaacgaacaa cataaattat 7500 aaaaatctaa aaaaaacaaa aaagaaaaag aaaaaaccct atctaaatta atattcgatt 7560 gattttgtcg tttcaatcca actaacgcac gccctttgaa taaaactcaa tccttttggt 7620 acaagcattt ttccctttaa tttaataggc ttataaattt ttttaaaaga actattccct 7680 tggtttcaaa aagattaacc tagtttaact tgaaacggag tttaagaaaa gaaaaaatac 7740 tttttaatct tgcatttcta aattaaagtt atatcaaatg tattaaaatg ttctttaatc 7800 ttgtggtctt aaacatgtca ctttgaaagt aaaaattaaa gtgttgccaa aaaaagaaaa 7860 gaatcattct ttttttaaat aaaaaaaaat tattattaat ataaaataat ttaaccttta 7920 ataagtttta tataatctga attagtcaaa ttcagtacaa gagtatcggt attttggtca 7980 aacctaccga tgaaaggcaa aaagcaacac gcaacaccaa gtaaaatgct atttttcttc 8040 ttcttcttga gctaagcata tattaaaagg ggatgaatga tttaaaatac atgtagttca 8100 ttattaactt acaaaaaaaa aaaatggcaa atttgttcat taagcaagca caacaatatt 8160 caaagggtag gccaagttac cctcaagaat tattcaattt cattgcttct aaaacacctt 8220 ctcatgatct tgtttgggat gttggtactg gtagtggcca ggctgctcaa tctgtaagtc 8280 tctatttctc cacggtcaat caaaaatttc gttaagaata ttttttttta actacggaaa 8340 gtaatatcta acctatcctt attcaaagtg ggttaagatc ggaaaaatta taccgtatag 8400 attgatacta tcaattatac ttgcatgttt aatctcatta gtgaatattc tgactctgtc 8460 ctgaattata taatttgagt gttcattgac tgatttttca tgctgtagaa tcatattttt 8520 tttcctttta taaatgaatg actttgttta atttggttga atggttggtc taaagttatg 8580 gtaaatatat aatgttcatt ttcaggtctt aaacacctta aataaaaaat taaaattaaa 8640 atattgctaa aaatgaattg atctttgtga aacaaatcaa aaaaattaaa ttatttcttt 8700 ttaaacgaag tgaatcttat tataattgca taggaaacag tagtcctctg tttatttaga 8760 tagtccatct ggaaaaacaa gaaatctagt attccgtttc actttatata acatgatttt 8820 catattaatt ttttctaaat agaatgtcat ccttctatat tagtataata tataaatgtg 8880 ctccttaatt tatctcattc cacatttatg ttttttttta tctttagttt gtcttatttt 8940 atatttatgc tctttaattt taggtatgca taagcagata cttaaattta tataaacttg 9000 aacaagtaga cacatgagtc ttacgtagga caacacatgt aggagatcat ataggacaaa 9060 aaataacagg taagatgtca tgcgggacat gtgtgtctac ttgttcaact ttatacaaat 9120 ttaagtgtct atttatgcac acccaaagtt gaagaacata aacataattt gaagccaagt 9180 taaaggacat atttatgtat tatgtcttct atatttaaaa catctattca tttttggccg 9240 gcataacgta aatttcatca tatgtcaaac tccaccgcat aaattgaaac agtccttagt 9300 gttcataaac ttgtttcttt tatcctaact tcctccaaaa atgttgtgtt cctcagttag 9360 ctaagcttta caagaatgtg atagctacag acacaagtcc aaagcagctt gaatttgcag 9420 caaaggttcc aaatgttcaa tacatatgta cctctcctaa gttgtcaaaa tccgaaatcg 9480 aaacaaaaat 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cagtgtgaaa catgtatgca aggaatcata aaacaactac aaaggtgtga 10380 tcactaacag gggtgacttg aaagtgttaa aataaaagac atgcgtctta gacccccaaa 10440 tttaaggggt ttcacttttt ataataatag gttataagtt attatctttt aataaatatt 10500 gagtactatt gtagaaaagt aaaaaaaaaa attatgaaaa atgaaggaat tattagaaga 10560 catttgacat atttggagta cttatatgaa aaattattta aaataagaat gatgcataca 10620 agggaattgt tgaatgatgc atacaagggg aagacaataa ttgcacagag caatacacac 10680 atgggaattg cttttatcct tccccatgat cagcatattc tataaaaggg aacacaataa 10740 tttcaaatct ttatcattca gagagttgaa aaagagagag actaaaaata aatggtagaa 10800 tagtatttta agcaggcact aatgtattca aaggttaggc caagttactt tgagttatat 10860 ggccagatat tgaattacct caactaattt tcatatattt acttctttat atctttgaat 10920 cctcttaatg aaaaaaatct ggttcttcca cttgacagat gaacaccatt gatggatttt 10980 tttttttatg tatacaaatc caaatgttag tacttgtacg catatattaa atttggaaca 11040 tttaatttcg atactgaaaa aaaaatttaa tttcgattaa ttcctcttgc cgaacaagaa 11100 tttaaatgga gtgacaagaa tagtgtacta aatacctaca agctcttcat ttgaactaag 11160 gttgagaagg gaggaacccc aggggttgag gaaaaagttc aaatagcatg ttggtaacag 11220 aacaagatat ggtaagttag ctaggctgct tgctgcagac tcatttaatt gtacatagga 11280 tagatttaca tagttgcatc accagacaca gcgataagta acatgtgtct cgatgatttc 11340 actgctgtac gtgaccttca ctacctgccc cttctcaagt ccatagtacc gagcaattgc 11400 atccttctga gacatccgtg gcagctggaa aacatcaata caataacaat actcagacaa 11460 aatgaactgc attgataatg tttgaagaaa agagtggtac attgaagtgc atatatagcc 11520 ttgtgaacta tggatttctg ctggagagag tgatcagcaa caataccatt gataagcata 11580 agatgaacgc ggaaacctgt ctctacaagt aaggtcctac atattgattc tgataagtag 11640 tgtgagagag atagggcaag taatgcttcc cattcatcaa atttaaaaag gcagcaatct 11700 ataagtacct aaactaaaag ttttagaaca gcatttaagt catttcaccc tcacagtaaa 11760 gggataatga caaacataaa gcattttttt aaacagtaat ccagagaagt caccaacact 11820 ggtctacaac attaaattac caagataagt attagaaggc tcctgttatt aacctccttc 11880 aagacaacac tatatgcaaa agagttctag gtattggctc aaaatgccat agtatctgga 11940 atccagccaa actgtaacaa cctctcagtg tctgaaccat cccgcgaggg 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