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EBI Dbfetch

ID   CT990558; SV 4; linear; genomic DNA; STD; PLN; 141443 BP.
XX
AC   CT990558;
XX
DT   03-JUN-2006 (Rel. 88, Created)
DT   03-MAR-2009 (Rel. 100, Last updated, Version 10)
XX
DE   S.lycopersicum DNA sequence from clone LE_HBa-308B7 on chromosome 4
XX
KW   HTG.
XX
OS   Solanum lycopersicum (tomato)
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae;
OC   asterids; lamiids; Solanales; Solanaceae; Solanoideae; Solaneae; Solanum;
OC   Lycopersicon.
XX
RN   [1]
RP   1-141443
RA   Beasley H.;
RT   ;
RL   Submitted (02-MAR-2009) to the INSDC.
RL   Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK.
RL   E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: Geneservice
RL   (http://www.geneservice.co.uk/) and BACPAC Resources
RL   (http://bacpac.chori.org/
XX
DR   MD5; 770111702b4146a141cbcfc37e078807.
XX
CC   Genome Center
CC   Center: Wellcome Trust Sanger Institute
CC   Center code: SC
CC   Web site: http://www.sanger.ac.uk
CC   Contact: vega@sanger.ac.uk
CC   
CC   This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions
CC   were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or
CC   covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was
CC   made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats;
CC   all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was
CC   confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone
CC   being a YAC.
CC   
CC   numbers given in the feature table with their source databases:
CC   Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP;
CC   http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep
CC   
CC   LE_HBa-308B7 is from a Lycopersicon esculentum library
CC   VECTOR: pBeloBAC11-HindIII
CC   
CC   TOMGEN
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..141443
FT                   /organism="Solanum lycopersicum"
FT                   /chromosome="4"
FT                   /cultivar="Heinz 1706"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /clone_lib="LE_HBa"
FT                   /clone="LE_HBa-308B7"
FT                   /db_xref="taxon:4081"
FT   misc_feature    133250..135038
FT                   /note="Single clone region. Sequence generated from a
FT                   transposon library derived from a single pUC clone"
FT   misc_feature    135956..136392
FT                   /note="Single clone region. Sequence generated from a
FT                   transposon library derived from a single pUC clone"
FT   misc_feature    139443
FT                   /note="clone t7 end: LE_HBa-308B7"
XX
SQ   Sequence 141443 BP; 47646 A; 22715 C; 23613 G; 47469 T; 0 other;
     aagctttttc tttctctgct tgctctatct ctcacatttg atcatttatc atcagcatca        60
     taagtacttg ttcttagacc tttatttgtt gtttcgatcc ttttcaacaa ctgttagcaa       120
     attgtcgcgt aaaactatat gtgctattcc aactttcagc ttgaactttg attgttttac       180
     caatcttgag ctcaacaaca tcactagtga tcaataggac atgatattat tccctagtca       240
     tcattcgaag tttcgctggt gcgtatgtta agagagtgat gcctcacgga gtttaaatcc       300
     tgatttcgcc tctgattata ataatctgtg ttttaaaggg gtttttttga acgagctagc       360
     catcatgaaa caccatgaga atttacatgg caagctcaag tctttagaga tttatgccaa       420
     gtactgtgtg ctccaagcag gcctactcaa atgcttggtg ggctcactaa attttctttt       480
     gttgggctaa atgagtaact ttacatatag caaacataaa aattatatat aaaaataaca       540
     cactatacac atttaaggtt atatatattg agttataaac atatatttta aaaataaatt       600
     acttatagca gattattatc gagttatagc atatcaatta aaattatatt taattaaaaa       660
     taaactataa gtaattattt aaatactaat taatatgttt aaatattttt tttatttttt       720
     acaattaact ttttattttt atttttaaat aaaataaaaa ggaaaaaaat gtttatttaa       780
     attggtaagt agcactaatt atggtatttg aattgatttt aattaataat ggataattaa       840
     caaattaaca tatattaagg aattcaaaaa gtatttggga tattgcacaa ttaccctctc       900
     aacttatacc cgaaatctca gagacgcact tatactattc ttaggtccta ttatctccct       960
     gaacttattt tattaataat tttctacccc ttttcggcct acgtggcact agattgtggg      1020
     cccaacggtg gttgactttt ttttttcaag ttagtgccat gtaggtcgaa aaggggtaga      1080
     aaattactta taaaataagt ttagggtggc aataggacct tagtatagta taagtgtgtc      1140
     tctgtgattt caggcatagg ttgagggggt acttgtgcat tttcttaaag tatttaaatc      1200
     attcagtttc cttaaaatgc ttaaattagt ttaaatcaaa ttaaaacatg atttttttct      1260
     ttatcacttt ttaaagcttt taatataaat aataaattat tattaattaa atttactaat      1320
     taaatttctc attatatagt tgtcttttaa aaaagaaaat ctaaataata gggatttgat      1380
     tttacttaat ttcctattat acggttgccc aataactatc cacccccatc tcaaccaata      1440
     catatacaga catcttcccc caatacactc catctctccc caacacgcga agatattttg      1500
     atcttcccta aatcccgcct cactcattat ctcttcccaa cacgcaaaga ttttttgttc      1560
     ttacccaaat cccgcctcac tcatcttccc cattatccct ctcagatcag ttcatcccaa      1620
     aatccaaaca tccctctcag atcagttccc cattaagttc atatagaatg tctaggaaag      1680
     gtagtgaaac ccaagtaaaa gtaaaagatt ggtcgatgag tctgatgact ttcatgttat      1740
     ttcattcgat atattgtcac aaactcaaac gcagaaatca aagggaaaag agaagtgtag      1800
     ttcagttaat tcaaaaatga atagaaaaac aaaatcaaag aggcaagaag aggaaaggaa      1860
     aagaaattag aacatcgtca gaatccgaat ctgactttgc tgaggattaa aaaatataaa      1920
     atcaaaaaaa ataaaaggca ttgaaattga tcgatcaaca agaaagtttt caaaaaaaaa      1980
     aagcatcaga gatacaagct acaaataacc cccaaaaagt taataaagtc actaaaaaga      2040
     ttatttcaaa tttggattac aatatgttgt gttagtatat ttaatttttg attttatttg      2100
     ttaatagtat actacatgaa atttgtatga tttatgtatg agttgagttt ttagtattat      2160
     acattataat tatatatgaa tattgaatga tttagtgttg tatgttttgt atatgatata      2220
     atttgaatat atcagtatat gatttgatac ataataaatg tattaatttt gtatgatttt      2280
     gtgtatgaaa tagttggtca ttatcgatac aggatgtctg cattatgtaa ttacctttgt      2340
     atcatatatg tatgaaatga tattcttatc cagtaaaata tatgtgtatg aatgatgtat      2400
     taatgttgtg tatcctataa ttttgacttt tataacaagt attgcaacta tatattttat      2460
     tttttgattt tgatgtatga attgacgtat tcatactaaa tgatattagt ttgtagttta      2520
     aaagttacaa attaattttt tttaaaaaat tgaatatgta ttaatattgt atgaattgtg      2580
     tatgaactga ggcatatagt ttttataatt ttcgtatgaa ttgaattaat gtcatcaaat      2640
     atgtattaat attgtatgaa tttcgtatat aatttgtatg atttgtgtat gaattaattg      2700
     aatgtcaatt taatatagca ttgtatatat gaatttttct atggaatttt atagtatata      2760
     aaaagcaata atttagtttt caaattttat aggagaagaa ggttcaaacg catttatctt      2820
     cctgtatcaa catgattgtg ttcgctgatt tgttgacctt cctcggtcaa gataagtttc      2880
     agcaattttt acaagaaact ccatttggat ttctttatga tttacataac ataaaaatcc      2940
     aatgtcaaga gttgcgtcat actttctttc ttaaatctga acatggcagg gatgacatgt      3000
     tcattatcaa tgtaaatgat acagagttat attttgactt aaaagagttg attgttgtaa      3060
     tcggtctaaa atctggatca atttttgatt ttgtttctga tctatctgtt ccaaatagat      3120
     taattgcaga aaatttcaga gactttgaca aagtccccaa gtcaaaattt taccacaaat      3180
     ttaaattgaa aaacttttgg gaagaagatg accgtttata atcagtttat ataattcata      3240
     cacacttcat acacatttaa tatatcattc actgtcctac aaattactcc aattaaacaa      3300
     acacaataca atttcaatac aaaattaata caaaaacata tattctaatt tcaatagaaa      3360
     ctagaatatt attttttaaa aaaaggactt tcataaacaa ttgatacacg tttcgtatac      3420
     ttttcataca ctaataatac aaacttcaga cttcaaatat gctatacgta acataactgt      3480
     ttcattcaaa aaaaaaaata tacaaactgt atttcagata atacagttaa aaaataaatc      3540
     aaacactgtt ctacacgtaa aaaaacatta aattaattaa aactaacaat tcataattaa      3600
     aagaaataaa tcataattaa aaatcaacct gatgaatgtc acttttcacc atatttaatt      3660
     aatattgaca taatgttctc catcatatca aatcaaattg ttgcaaacgt caaaatttat      3720
     caggttacta aaaaaacgaa ctgaaatatg caaatatcgt gaaattttgg gggaaaatga      3780
     cttctacgtt gatgcaaatc ggaaaataat tgtgaaattt cggaaaaaaa gatgaattgc      3840
     aatgatgatg caaataggtt tcaaaatgcc aatctgaaaa taatctgcaa atctgaaaat      3900
     aatcattaaa atctgataaa tttttttaaa gaattaaatc aaaaaaataa tatcatttaa      3960
     actaactaga gatatttaag gttgtgatgc taatctgaaa acttttgata tccctaaaaa      4020
     cgtgttaatc taatattaaa ttttacttaa aatcccttaa aacgtgctag tatacagttt      4080
     taaaatgtgc taactacatt taatgtaatt aataaagtat ttcattttcc attattagtt      4140
     tgtcggtgtg ttaattaggt atattaatta tccattatta gtttatccct tttttttatt      4200
     aattgttaat atcaactttt ttttaataaa ttataattaa cattatattt attaataaaa      4260
     tgttatagat tgagatatta aatgctatac actgaaattc aaattctaat gctataactt      4320
     gaaaatatta ctatataaaa tgttatatac ctaatttaca caaattatat ttgtatgtta      4380
     tagttaggga tgtactaaac aaaaccgaaa atcgaatcaa actgcaaatc gagttaaatt      4440
     gggaaaaaaa actcaattat atttggattg gttgtgtttc aactaaaaaa taccaactca      4500
     agaccaaacc aacccgacat tatatataat tttaaatttt ttttttatac gcaacatact      4560
     ttctttgata taattttaaa tgtctcttat actttttcat agtttttatc tttttaatat      4620
     aattatttca tgtttggaag ttagaaattc tcaatgatct aataagattg tagtctatac      4680
     gtgttggtaa ttataataaa gttttaatga aaatcaaatt aatgctaatg caaaaagaaa      4740
     atcaattcaa cactaagaat gttagtaata ttgaatattt gtttttagtt ttacatagat      4800
     ttagacaatt aaaatacatg atctaacttt actttctttt aatatttagt catgtaacta      4860
     atacttacta aacttatttt agcatgattt agtactttag attatgatca atttcattat      4920
     gactaattaa tttgaaatat ttgttttacg caattttatt attataaaat tgataactag      4980
     gtttgttacg gttttgcaac catattttaa gttttttttt tttaaaaaaa aaaaggaaag      5040
     tcaaagtatt actgtttgaa cttttcctta atttatattt ttttagagca aaaatttgga      5100
     acgaagaccc ttttctttaa ataatcgttt acacaatttt gtttatggct atgcttttaa      5160
     ttatttattt attttaatta tgtaggtcaa cgggtcataa taattaggga tgtatatgat      5220
     tgggttgact tgaatttttc aaatatcaaa tcaaattatt tgtgtcatat ttttatttta      5280
     taaatcaaat caaatcaata aagcttgagt tcttttcaac atcggatttt ttcaaacttt      5340
     taggattttt cgtaaagtat tcgtacaaac atataattta cttgtatttc aaatatttct      5400
     ttaattctat caaaatataa ctatctaagg tgtttcttaa gaaaataaca caaaatatga      5460
     tatgattaat gacaataaaa tattcaacca aaagataata atgaaatcga gtaaaaataa      5520
     atagtgcaaa ttaacaagtc ataatgaaat ttatcatatt ttacagatac taagtttaat      5580
     aagtattagt tacatgacta aatattaaaa gaaagtaaaa ttagatcatg tattttaatt      5640
     gtctaaatct atctatgtaa aactaaaaaa caaatattta atattattgt cattcttact      5700
     gttgaaatga ttttttattt atattagtat taatttaatt ttaatttaag ctttatttta      5760
     gttaccgaca tatgtggagt ataatcttca ttgactcatt caaaatttta agtttcaaac      5820
     ttaaaataat atattaatag ataaaaacta tgaaaaagta taagaaatat ttataaatca      5880
     tattaaagta aatattttta tatataaaat attttttttt aattatatat caggtcggtt      5940
     tggtttggtc tcggattaat tattattaat taaaaccaaa ccaatccaaa tatagtcgaa      6000
     tttttttcaa taccaaacca agtcaaacca aatcactact caaatttttt ttccatttga      6060
     ctcagtttac aatttaattc gattttgatc atatcattta ataatattat gcttttcata      6120
     atataatttt atatatcgtc tactttatca atatattata atttgtatat ataaacttta      6180
     gttaattgat tttgaatccc attttaacta aaccaccata tttacatatt caatctagag      6240
     agtctgttcc caataagaat ttttctcaaa gcaacatcgt agcaaaaatg tgacagtaaa      6300
     acagttagat gtaagtccaa agcaaataaa agaagaaaaa ttatggaaca tgctgtaatg      6360
     aattatattt gtatccattg agaacttgta ttttcatttc aattatattt gtatccataa      6420
     tgaatctagt tgtatttgaa atacaatttg aaaataaaat acgtaaaaaa gataatatat      6480
     atatataata tgcaaaaata aatttaaaaa atacaaaata aattataaaa tacaattctc      6540
     tctcctttct ctctcgatct gatctggccc cgctcgtctt ttccttctta atatgtattt      6600
     attaatttga tataaattaa tttgtatttt ttcttttcta taaaattcat gaaaaatatt      6660
     ttatttttct tcctcccaga tctcgctcat ctctttttga tattattcat aattaagcaa      6720
     actataacta tagaatgcat aaaacttatg gttttttgaa agcttcctaa taaagaaatc      6780
     aattattcca cgtatttgta tattcgttca cttttaattg ttattgtatt ttttaaaaaa      6840
     ttaaattata aaaattttaa ttaacatttt aatgacattt tttcatcata ttaatatgca      6900
     aaaaaaatta taacttgtag tgcttttcat atagttttta attatttaaa atttttactt      6960
     aaaaaattag attaatatta tctaaattaa ttttaaaatt aacaaatatc aatggacgat      7020
     ggatgacgta gatagattcc ttttttaccc cttttgtgtc cgcaagaccc caaggcattg      7080
     aattatttgt ttgtttttat ttattttgtt ttttctttat tttctagagg aagatcttaa      7140
     tatataaata agtataattt gacttgaatc aaaataaatt tgattttttt tattcaattt      7200
     ggttatatca atacaaaaaa acataattaa aattaaatta gtaatttaaa aaataaaaat      7260
     aaaataatat atataaaagg ataagtatta aatatatttt ctaatataaa tcacaagtaa      7320
     aatttaaaac acaaaattta aaaatatatt aattatagat gttgaagtat aaaatataaa      7380
     ttaaatcata atgaaagaca ataacctaaa aatgacaaaa ataattaact tcaacttagt      7440
     tctaaaccta aatatttaat ttatatatca tccataacaa aaacgaacaa cataaattat      7500
     aaaaatctaa aaaaaacaaa aaagaaaaag aaaaaaccct atctaaatta atattcgatt      7560
     gattttgtcg tttcaatcca actaacgcac gccctttgaa taaaactcaa tccttttggt      7620
     acaagcattt ttccctttaa tttaataggc ttataaattt ttttaaaaga actattccct      7680
     tggtttcaaa aagattaacc tagtttaact tgaaacggag tttaagaaaa gaaaaaatac      7740
     tttttaatct tgcatttcta aattaaagtt atatcaaatg tattaaaatg ttctttaatc      7800
     ttgtggtctt aaacatgtca ctttgaaagt aaaaattaaa gtgttgccaa aaaaagaaaa      7860
     gaatcattct ttttttaaat aaaaaaaaat tattattaat ataaaataat ttaaccttta      7920
     ataagtttta tataatctga attagtcaaa ttcagtacaa gagtatcggt attttggtca      7980
     aacctaccga tgaaaggcaa aaagcaacac gcaacaccaa gtaaaatgct atttttcttc      8040
     ttcttcttga gctaagcata tattaaaagg ggatgaatga tttaaaatac atgtagttca      8100
     ttattaactt acaaaaaaaa aaaatggcaa atttgttcat taagcaagca caacaatatt      8160
     caaagggtag gccaagttac cctcaagaat tattcaattt cattgcttct aaaacacctt      8220
     ctcatgatct tgtttgggat gttggtactg gtagtggcca ggctgctcaa tctgtaagtc      8280
     tctatttctc cacggtcaat caaaaatttc gttaagaata ttttttttta actacggaaa      8340
     gtaatatcta acctatcctt attcaaagtg ggttaagatc ggaaaaatta taccgtatag      8400
     attgatacta tcaattatac ttgcatgttt aatctcatta gtgaatattc tgactctgtc      8460
     ctgaattata taatttgagt gttcattgac tgatttttca tgctgtagaa tcatattttt      8520
     tttcctttta taaatgaatg actttgttta atttggttga atggttggtc taaagttatg      8580
     gtaaatatat aatgttcatt ttcaggtctt aaacacctta aataaaaaat taaaattaaa      8640
     atattgctaa aaatgaattg atctttgtga aacaaatcaa aaaaattaaa ttatttcttt      8700
     ttaaacgaag tgaatcttat tataattgca taggaaacag tagtcctctg tttatttaga      8760
     tagtccatct ggaaaaacaa gaaatctagt attccgtttc actttatata acatgatttt      8820
     catattaatt ttttctaaat agaatgtcat ccttctatat tagtataata tataaatgtg      8880
     ctccttaatt tatctcattc cacatttatg ttttttttta tctttagttt gtcttatttt      8940
     atatttatgc tctttaattt taggtatgca taagcagata cttaaattta tataaacttg      9000
     aacaagtaga cacatgagtc ttacgtagga caacacatgt aggagatcat ataggacaaa      9060
     aaataacagg taagatgtca tgcgggacat gtgtgtctac ttgttcaact ttatacaaat      9120
     ttaagtgtct atttatgcac acccaaagtt gaagaacata aacataattt gaagccaagt      9180
     taaaggacat atttatgtat tatgtcttct atatttaaaa catctattca tttttggccg      9240
     gcataacgta aatttcatca tatgtcaaac tccaccgcat aaattgaaac agtccttagt      9300
     gttcataaac ttgtttcttt tatcctaact tcctccaaaa atgttgtgtt cctcagttag      9360
     ctaagcttta caagaatgtg atagctacag acacaagtcc aaagcagctt gaatttgcag      9420
     caaaggttcc aaatgttcaa tacatatgta cctctcctaa gttgtcaaaa tccgaaatcg      9480
     aaacaaaaat aggatcagaa tcaagtgtag atttagtaac aattgcacaa gcaatgcatt      9540
     ggtttgatct accaactttt tatgaacatg ttaaatggtt actcaagaaa ccaaatggtg      9600
     ttatagcatc atggtgttac actacaccta aaataaacaa ctcagtagat gcaatatttg      9660
     ataaatttta cacaagtgat gctggacctt attgggaatc accaagaaaa ttggtcgatg      9720
     aaaagtatga aactattgat tttccatttg aggctataga tggatgtgat cataatggac      9780
     catttgagtt caagattgag aaagttatgg acttggattc ttgttttaca tacttgaagt      9840
     catggtcagc ttatcaaact gcaaaagaaa agggtgttga gttgttaagt gaagatgttg      9900
     ttgaaaaatt tacaagtgct tggaatgaag atgggaagag tgagaaaaaa gtgatttatc      9960
     ctatttactt gaggattgga aaagttggaa atttggattg aaagtgtaaa gcaaatacaa     10020
     ttagttatgt gcacttgatc atctatttat tttgtatgtt atttctctta gttgttattg     10080
     ttatgtatct tttaataata ataaagtatc taagtactaa ttaatacatc tatttgcata     10140
     atgcatttac aaaataacta ctcttcccct tgtatgcatc attcaacaac aacaacatat     10200
     gcagttccac aaaatggagt atggagagat ggagaggata gagtgtaact atatttatta     10260
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     taatacctta aaaggtaaga attgagtaaa attgattcaa tcataaattt aatcattgaa     55980
     taacttcttt caaaatcata atttcataac atattcataa aaacacttat attaaagcat     56040
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     gtatattttg gaagtagtat tgagcaccga tatggagact cgagttcata ctaactcaag     56340
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     ttgcatctta agttattgct ttatcattga gtatcatgag ttgagtattt aaagttcagt     56700
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     tttcaatata atcttgtaat ttttctctta caattttaag gagattcaat aatggctaca     58560
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     tcaataaaaa atgatgaatt tcttacatat ttttcaactg acctctaaaa aaatatattt     67500
     tttgaagtca ttatatataa tattaataca acttaatgta aaaataaatt tattttatga     67560
     attttttttt taatatcaaa cttaactaga aaaataaaca ttaaaaaaat tatgcgatgc     67620
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