Dbfetch
ID CT961058; SV 16; linear; genomic DNA; STD; PLN; 127385 BP. XX AC CT961058; XX DT 01-MAY-2006 (Rel. 87, Created) DT 30-NOV-2006 (Rel. 89, Last updated, Version 15) XX DE M.truncatula DNA sequence from clone MTH2-80N17 on chromosome 3 XX KW HTG. XX OS Medicago truncatula (barrel medic) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; OC rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; 50 kb inversion clade; OC NPAAA clade; Hologalegina; IRL clade; Trifolieae; Medicago. XX RN [1] RP 1-127385 RA Kerry G.; RT ; RL Submitted (29-NOV-2006) to the INSDC. RL Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. RL E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: RL clonerequest@sanger.ac.uk XX DR MD5; 34d5a6d815eee73f56995bdf615572c4. XX CC -------------- Genome Center CC Center: Wellcome Trust Sanger Institute CC Center code: SC CC Web site: http://www.sanger.ac.uk CC Contact: vega@sanger.ac.uk CC -------------- CC CC This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions CC were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or CC covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was CC made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; CC all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was CC confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone CC being a YAC. CC CC The following abbreviations are used to associate primary accession CC numbers given in the feature table with their source databases: CC Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP; CC Information on the WORMPEP database can be found at CC http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep CC CC MTH2-80N17 is from the MtH2 Medicago truncatula BAC library (MT_ABb) CC VECTOR: pBeloBAC11 XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..127385 FT /organism="Medicago truncatula" FT /chromosome="3" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="MtH2 Medicago truncatula BACs" FT /clone="MTH2-80N17" FT /db_xref="taxon:3880" XX SQ Sequence 127385 BP; 42729 A; 21407 C; 20860 G; 42389 T; 0 other; aagcttgtta aaggatgtga atttccacgt agttattaca aatgcacaca tcctaactgt 60 gaagtgaaga aactcttcga acgctctcat gacggccaaa ttactgagat agtttacaag 120 ggaacacatg atcatcctaa acctcaacca agccgtcgat tctctggtgg aaatatgatg 180 tctgtgcaag aagaaagatc tgatagggct tctttgacta gccgagacgg taatagcaga 240 tgaatacttc tgattgattc cattctatta ttcccgagtg ccaagcaaat aatatgattt 300 tctttttctt ttaattcttg aattgtagac aaagacttta ataattatgg tcagatgtct 360 catgcagctg agcgtgacag tactccagag ctatcgccta tagcagcaaa tgatggtagt 420 ccagagggtg cagggttttt gtcaaaccag aataacgacg aggttgatga agatgatcct 480 ttctcaaaga gaaggtttga cgatttaggc caaagttcta attttatttt tgttgcttat 540 acacttgctg atcaagagat ttttattaag cagaaagatg gatcttgaca tcacaccggt 600 agttaagcct atccgggagc cacgggtcgt tgtacaaact ctgagtgagg ttgacatatt 660 ggatgatggt tatcgctggc gtaaatatgg gcagaaggtg gtaagaggca atcctaaccc 720 taggtatgtc ctcacattga tgactataca atataaacta aattgatgaa ggtcaacata 780 atgtgcttgt ttcggattat tttaaaaaaa aaaacttctc acttattggg gtatgttttg 840 aaaaattgct ttatggattc gagaataggg aaaagtgtag caatagcatc ctataacata 900 tttttgaaat ggtttttgtt ctaaactgta aatcttaagc tcatgcaaag tttttttatt 960 aaaagaatta taatattcat tcaaaggatt ctatttgtct cttttctgac tcatcagttt 1020 agaataattg caaaatcatg agttagtata aggttgatgc ctgggaaatt gatggtgtat 1080 accagtactg agttggagtt gataagtgat gatggtaggt taaaaaggaa ctaaaataac 1140 taattacatg taatggttaa ggaagcagtt tgaatgtaag aaaatcagtg ctaagaatat 1200 gcaaaggaac actgaaatag ttgcaaatca atgagttggt aaaagtttga tcctatgaaa 1260 gtggatgttg tagaccatta tagaattgac aatgacaaat gatgatggta gattaaaaag 1320 gatctaatat gattaaatac ttattggtta agggagcaat tcgaatgtta aagcatcacc 1380 gctaagaaag taagagtagg gatggcaatg gccatgggta tccactggca cagatagtag 1440 ttatccgata cccgccctgt tgataaagtt gatatatgtg cccgccccat atctgtgcag 1500 atatctacta gacaggtatt tagcagattc tgaggtatcg gcgattattt gcagttatcc 1560 tgggatatca atattatcaa aaataaaata aaaataaaaa agcatttatg taaaaataat 1620 gcattagtgt tagatgctta gatatcaaga aagtgtcgga gaatgcaatt tacttcaatg 1680 ctcagaagaa attatgtcca acaacataat gatggttatg acataggtta acagtgagtt 1740 ataagacatt ataggggaaa aggaagggca ataagatatt tagggtgtgt ttgtgagttt 1800 gtttttggag ggtgtgtttg agggataagt ctatatttga tattttaaaa aaaattaaaa 1860 taacatgata tcatatgctt gtgtatcatg ttctttcaat tttttaaaaa tatacaatta 1920 gccctccaaa gcctttccct acaaaaccct cctaaatcca acttgcaaac acacccttac 1980 tgattcgcat ggttgaaggg tttgtactga ttattatgac tgtggggcaa tatgacttat 2040 ctatgcagta aatttgtttc atctttcact gtttctcatc ccgttagtca aatattgtag 2100 ttcttcttga ggtctaatac attgaaactg aatcctagct ggagttgtct ttcttttttt 2160 tcttctggaa acctgcattc cttataagta tgtcacccac tttgcacttg aggattcccc 2220 ttcagtattc agttccattt gctgactcaa aattacgata cacagacaaa attttgactt 2280 aagaaaattt tcatttttta gcttaaaatg gttgcgatgc attttgttta cataaagctc 2340 aatattgttt gatctaattt tatattccac aaggctacaa accataaaga ttgaattggg 2400 tttttttgtc agaaatctta cttctgcttg gtgatctaat aattttgatt cgtgagatac 2460 ttttgcaaga tttttggtat tgttggtcac tattttaaag acctttgtca tgttatgcta 2520 ctttttcagc aatgcctata tatttcaaat acctcattaa atagtttgaa tgataggcaa 2580 gtaatgtgtc tagctcagaa tctcgttgaa tatgacgaga aattgctacc ttgtaattcc 2640 ctgtcataag cacggattga ctaaactatt gaagagtgag actagactac tgtctacttg 2700 aactttattc aggcactaaa ttgtttttct ttttttcata gcacaatgaa ctgtgataat 2760 ctctacccaa atatcagaat tcccagttgg ttttgaatac agattgttgt agttgacccc 2820 aattttacca ctaaggcctg tttttgatgt cattttccaa attcattggg cacttaagac 2880 gaagtagcta taaagtgaac tattctaatc taggttagtt gtagtgcagt agttgtggtg 2940 ggtgtcatct ttaaaataac agatggaatg atggatgcta tatagtgtca ctcagtgttg 3000 tcagatcaaa aatataagct gtagcaacac tgtagcgtag tggaatttaa caaaccacta 3060 atttccatga tcttctattg acaacactaa atataacaaa gggtatcaaa ttagcaagaa 3120 ccatgcatgg aatgtaaata aaatatgtat acttagactt tgatgagctt ggcagatttg 3180 tctatgatct gttttgtatt tgataaaaag aatgtggtgt tttgttgctt atttttgggt 3240 aacattgctg cttatcacag gagttattac aaatgcacaa atgccggttg cccggttaga 3300 aaacatgtgg agagggcatc tcatgatccg aaagctgtaa taacaacata cgagggtaaa 3360 cacaatcatg atgtaccaac tgcaaggcat aatagtcatg acatggcagg accatcggct 3420 gcaggtggac agacaagaat ccggcatgaa gaaagtgaca ctattagcct tgaccttgga 3480 atgggcctca gcccaaccgc cgaaaataga ccaaacagtc tagggagaat gatgcgcaat 3540 gaatatggcg acagccaaac acataacggc aattccagtt tcaagtttgt tcatagttct 3600 acaccacctc cagtatactt tggtgtacta aataacagcg caaatccata tggttctaga 3660 gaaaatccaa gtgatagttc atctttaaac cgttctgctt atccttgccc acagaacatg 3720 ggaagaataa ttatgggtcc ctaaaatcgt ttacataaca aaaataagtt aaaatgaaat 3780 tctgagtatt gttttgcttt ctttgttttg gctggtaaag cttcaaaggc aagttttctc 3840 tatgaaaatg ctgatagttc ttttatgttc ctatcgcacc gtctgagagc tgccctttga 3900 taggaactag cagtagctgt gtcctttcaa gttgactttt atatctgatt gttgtttgta 3960 taattatata tacaaattct tctgtacaaa tatgaagctg atactaaatt gcttccacaa 4020 gaacccttgt aaaatgttgt tcaactattt atatgaagta gcatttagcc tgtgcctgaa 4080 cttttggttg taattacttc aagagtactt tatattcttg gtagctgtac aaacatttat 4140 gttaatgatt gcttctgata atagtgagat tgggtagaat acatgagata acacaatgta 4200 cttgcactcg tttgattttc tcatatttta tgcatacaac ctagaacgaa caaaacaccg 4260 aatctgctag ttaaactcag atgctgtaac agtgtgatga ttcaagtttg ctgtcttacg 4320 tccttttata ctcttgacca tagttgtaac caggtttttg acaaaaagtc tgcattgccg 4380 ccaatcatgg tcacggcatc atagtttttg atgtcgtcac gatggcagag agactgtgat 4440 cgaggctgca tcaactgtgt ctgaccttga ttatttgcag tatgaaggat agtgattcaa 4500 ctgtgattgt gactgatctg aattcttagt tgtcatgttg tgaatgcata gataatcatt 4560 tgattaactt tcaagttgta aatgcaacat tgattgaatg aagcctctat tacacaataa 4620 caggtcacaa atttataatc aagtgaggca catgtgagta agtgattttg tgaagatctt 4680 gtttcaaaag aaccaatgtt gaaggacttt ttttgtggtc accaacattt aaacttttat 4740 cattaaaaaa tttccctgat tagaaatgct tccaaaagaa ttatgattaa ccacatgctc 4800 tttccaaagg catttatgat taaccacatg ataatcaaat cacataattg taccaattcg 4860 tgcaacacat gctctatcca aagacattta tgattaatca catgatagta atgattaatg 4920 aatagcttgt tgaaattgta tacaaatgct tatacagttg tatgatttct aacagatatg 4980 ctgttgatca ataaaggatg tgaaaaggat tcataactca cagtcaaata caaatgagtg 5040 gtaacaccat aattaacaca cttttcaaca cccttctttt catttgttga aagttgaata 5100 gaatacacta tattatgtaa ttctcacata aattgagtag gatctatcta aataaatttc 5160 aaccaattgg ataaaacgcg tttaaaagtg ggtgttaaat agtatactgt tgacattttt 5220 caatataaat tttcatgtga gttttcattt attgattcct tcaaaaaaaa aatattgata 5280 aaagcttttc caaatcttca tgccttgatg tcttttgtga aggacaaatc taatggagcc 5340 tagcatatag gtctgaacta attagggagc tttaaataga tctcttatca ttttttaatt 5400 ttttttttgt aatttaatcc ctgaatatgt caatataaac aagaataaat aaatttaaaa 5460 tgaggagcaa ttatgctgca tgataactgc tagagctgca gtgctgatgg ggaatacaaa 5520 gagatctaac caaccaagtt aggagaaata cagtttagct tagcatataa aaaatatcat 5580 atctaacctt atttttaatc tctggtaagg taaacatgtt ctataaaaca cactggatag 5640 acaaattctg catatataat ccatcaggcc tgttactagt atttgtgaca aagttttagg 5700 atgctctttt acaaaacagt tatttgagta taataaaaag agtaaatcta aataggatga 5760 tgatacatat agcctaacat aaaaacctgc agtaacaaaa ctgaactgtc attatatttt 5820 tcatctccaa gcacaagaag caataagatc ttgattcatc caaccaagaa acagtgcacc 5880 atctctctct tctagggtgt aatgtccacg gtagctctcg agaagattct tgattgaaga 5940 attgatgaag gagctcaatg gataaggcgt aaatccagcc atcgtgaaac gcattctcca 6000 cttactcaga agctcgtgac gttccactct ttcttcccct tcgcaagcta ctaagttcac 6060 aacttcacga gccaaacaat gttgttcgac attaatcctc tctttgtgat cccttggaag 6120 aacaacatca atcgattcat aaactgctga gtagtagttc attgtctcga ggaaacgctg 6180 caagaacgga gcgttattgg tgttgaattc ttgctcaact agagtcacca ccttaggaga 6240 catgtgttta gccaatcgca gcaacctatc acgatgatta tgaatgttca cactttcatc 6300 tggtacatgg tgtagcataa tggcaaaatt caccgccaca gcttcattag gtcgaagttc 6360 aaagtcttcg agtcgcactt cagaaggata cactctaaca gcatggaact caaagggtac 6420 atgacatgac tgcgcaagcg tcaataactt ttcccctact atatcaacgc ccccaccgcg 6480 gacattagat gaataagagt catcaatacc tgttattcta atctttggag gtcctccagg 6540 gcggcgagca agagcctgga ttagactcac ccactgagtt ccttgtccaa tctgaaaatc 6600 aattatatgg acttcatttt cctccttcat agcttccgca atggccccat ttgcagacat 6660 gtatccaaac ttaaagtacg gacatatttc ataaagtaca tgcatgtagg aaagcagttc 6720 attaccagta ggctcgctgc attttaacga tttgtagatt gtacttccag aagaggcaat 6780 ctttgaaaca agtgcctcca acatgtacgc tcccaatcgt tcaattggac tgcctgaaac 6840 ggatactatt ttgcgtaact cagttaccat ccattcaatt gtctcgatat cattctcatc 6900 cactgctttt gcacaagtat aaagcatctc tttcaaatcc cctctagata ccatctccac 6960 gtttttcttc cacttctctg cctctaataa gaatgaagca gattcttctt gaactttggt 7020 atcatacatc tctagcatct ctacgttagg tcctcgcata acagattcca gctcactcat 7080 cttatgcctt aggtcatcat gatcatgata tatcaagtaa gaatcctcct cctcaggtga 7140 accattgaca aattcaagtg aatgttgcgg ccttaacgta gaacctggac tattgttagg 7200 tgaaaaactg tgagtagagg gagaattttg gtaaggtaaa ctgttgttgc ttgttgaagc 7260 agattcaagg gtgttgtatg gttctagagt ttgatgagaa ggataaaatg tttggcagct 7320 gttatcagag gaagaataat tgtctagatt ctcaattgag ggtaagcaat acgactcgag 7380 attctgcaca ggctcaacgt agaacctgtc agagccgtaa gaaatttcat ggttctgaga 7440 tgtttgcatt gataagtaaa aatttcttcg atatacttga gcactgtcgg ttgactttct 7500 tgaacaaaca ccctagaagt tctccaatag atcagtaatc attgtctaca cttgaattca 7560 actttccttg ggaattgcag cgtaccgaaa aaaatacgaa ctattctgca tataaggaaa 7620 taagacagtt agacaaatac aatatccaag aggataatga ttagtagaac agtaaagaaa 7680 gaaaacaaat atgcattcta tttataattg ttgcttaaat ctgttatggc tttcggttag 7740 atgttaacgt attggataga aattagcaag caatgagatt ttttttctaa aaaccagaag 7800 agtaatcttc ttgacaacac aattatgagc ctgtttgtta caaatcactt tcttaactaa 7860 aaaaactact tttagtggtt ttaattgtgt ttgtttaagc ttttgaaagt aatcagaatc 7920 taaaaaacat gttttcttga ttaaaatgat aagttaaatt tagtagcttc tttaattgtg 7980 gtagaattat aatatgctat tccaattaag agtacaccaa ccctccaaag ttacaatttt 8040 ctcacttttt ttttctttct ttcataaatc actttacatg atgcctatag ggcgaagtag 8100 cttttcatat accaaacatg catagcttta actcaattaa cataaaaaga tgacaaattt 8160 caaaaccaca ccaaagggat ttcaatttca atgattcaaa agcacttaat caaaatttta 8220 aagccttctt tccacaaccc tacccaaaaa actgaaaacc aaatctagaa aacaaaaaat 8280 cattaaagat aaaccataaa aaggagaaaa atcatttcac aaacttaaac aagcctttac 8340 taatcaattt aaacacaaac ccatttttct aaactcatca aaaccaaacc aaaaatgata 8400 aaaaagtaat ttgtattttt tctaataatt caaacaaata catcatcatc atcatcatca 8460 tcatcataac catcaccaca tgaccagaaa aataaaacac tcataagaaa aacaactttg 8520 ctttaacaac ataatataaa taaggaaagt gaaaacagtt gaaaaacata tgagtctctc 8580 accttaaaaa gattaccaac aaaaaaagaa aatctgatct gaaacagctt atacaaaact 8640 taacaaagtt gaactgaagg agtttaagat aagaaggtta tggttgtttt gtttgaggtt 8700 gtttgttaaa agcttaggag gaagagattt gtaaagggac aaaggttgtt gttgttgaag 8760 tgttttggtt tggtccactt tgaagtgtct ctcaagtgcg tttgtggtat ttgtatatag 8820 ctacggacgc caacaaggaa agtctcctat tctgtgaaat ttctaaaaat atattattaa 8880 ccaaccctat attttaagac agactagaga aaatatatgt acggttcgta caaagtatat 8940 ctagaatttt gaaactctat tttatttaat ttttacagaa atgtactgtt tgcatttatt 9000 ataaataaaa tcttcaatgc aaggaggaaa atattcaaat aaatggtgag ttggtgcctg 9060 acagtagcaa tgtgatattt atatcctaaa atacataact caactaataa tattgatatt 9120 attcgagtaa ccattttcgc tctgtttttt aaggtgattt tagaccaatt tctttatgta 9180 atgttattaa taaaattgtc gcaaaaacta taacgaatgg tctaaaatta attctaccag 9240 atataattga tctatcttaa agtgcttttt tgttgagtca gtgaggagaa gctagggaga 9300 ccgtctacat cgaggctaga acaatcgcac aagtaagaga aacaccacac tcttacccaa 9360 aaccttaagg caatgggttt atgggtcctc ttacttgtga gtccatcaat tcaacgtgtt 9420 cccctaaagc ggaagctttt tacttttgcc tgaatcgccg ttgctgcaca agaagccact 9480 tgctgcttgt accgtcgttg ctgctttctg cgcaactgac cggcggcctc tgtcgcaccc 9540 ttcgtcgaac cggggctctg ataccactgt taggtcactg ggggagcctt gggggacaat 9600 ccacatcgag gctagaacaa ccactcaagc aagagagaca ccacactctt atccaaaacc 9660 ttaaggcaat gggtttatgg gtccgcttac ttataagacc tttactattt tatctgatgt 9720 gggacatata actcacactt gtacacaaca acattctccc tcaagtgtga gtccatcaat 9780 atagaccgac actgcttgca ccgccgttgc tgctttctcc gcaaacgggc cgacactgct 9840 tcgttgaatt gatggactca cacttgaggg ggagtgttgg tttgcaagtg tgagttatat 9900 gtcccacatc ggataaaata gtaaaggttg aacaccttgt gtctctcttg cttgtgcggt 9960 tgttctagcc tcgatgtgga cggtccccct agcttcccct cactgaccca acagtggtat 10020 cagagccccg gttcgacgaa gggtacgacc gaggcagccg gtcgttgcgc agaaagcaag 10080 caacagctgt acaagtagta agtggctcct tgttcaggaa cgacgataca agcaaagtaa 10140 gagcttccgc ttgaaggggg agcatgatga atagatggac tcacacttga gggggagtgt 10200 tggtttgcaa gtgtgagcta tatgtcccac atcggataaa atagtaaagg ttgaatacct 10260 tataagtaag aggacccata aacacattgc cttaaggttt tgggtaagag tgtggtgtct 10320 ctcttgcttg tgcggttgtt ctagtctcga tgtggacagt ccccctagct tcccctcact 10380 gaccgagaaa aaaaggtttt gtagccttgt aaggttgaag ctttatgtcc aaacttatga 10440 taaaattgag tggcatttcc tcacaattgt cttggctagt atgaactttc tacaacacta 10500 gattcacagg cggaaccagg gagggacata gggaggtcat gatcgtccca aaattccaaa 10560 taattcattt ttaatatgta tataggaata gtttagcaaa atatttgttt atatgtatgt 10620 actagactct cgactcaagc tatcgcgcgg gtttgttata ccataatatc attatatttt 10680 acaaccaata ttaaatttat tattatcata tgaaaagtat aatttttgta taattataat 10740 ttatagacca aacttcgtaa actgaaatgc aaaaagaaga tgaatactca agaagagagc 10800 aagcaaaaag aagatgaatt aacacataat ggaataacaa taataataat aacaataata 10860 attattatta tataattcta caaaaatgaa caaaaagctc acaattgtaa cttccagcgt 10920 atctgttttc aacaccatgt gagatgctat ccaaacccta aagtataaac gaaaccaaaa 10980 tcaaaatcgt caaaggaatc atcagtcaaa atcgaattga gatagtataa ccaacaatgg 11040 aatcataagt gaaatcgtca atgaaatctt taattgaaat caaaattaaa aagaacaaat 11100 cgaatataaa attgagaatg aacaaattta atacccatcg acgaataaat ttttgatttg 11160 agttgattat gaaaagccac cactgtaaag atcttctctg tcttcgtctg atgtgaatat 11220 ggggttggag ttatggagag aaatcagagt ggacggttgg aaagatgcaa aaatatcctt 11280 ttagaaaata agaagaatgg aggagttatg tcaagaaaga agaaatggat cgatcatgac 11340 gaacaaagag atgttttaga tgatcttgag tgtggcaagc agaaccctag aaaatctcca 11400 aattattttc ttctatgcat tgggcagcgc gtattgcaac gccctatttt aatatttatt 11460 tattttattg agtttagagt ctatttttat gacttatgtg atttatatga tttttgtgat 11520 gtgttgttga tttattaagt gacttatttt attatttaat agaataagat ttgaaaataa 11580 aataagatta agttgtgggg gctgttttgg aaattagaag agtttagtgg aataagtgga 11640 aatattttgt tatttggtgt agaaatatat atgttatttg ttgtagaaat atatatgtta 11700 tttggtgtgg aaatattatg ttatttggtg tagaaatatt atgttatttg gtgtggaaat 11760 attatgttat ttggtgtaga aatattacgt tatttggtgt ggaaatatta tgttatttgg 11820 tgtagaaata tatatgttat ttggtgtaga aatatatttg ttatctggtg tagaaatata 11880 tttcttattt ggtgtagaaa tatatttgtt atagagatat atttgttata gaaatattat 11940 atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat atatatatat 12000 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