Dbfetch
ID CT009488; SV 4; linear; genomic DNA; STD; PLN; 119377 BP. XX AC CT009488; XX DT 24-JUN-2005 (Rel. 84, Created) DT 30-AUG-2005 (Rel. 85, Last updated, Version 7) XX DE M.truncatula DNA sequence from clone MTH2-70J8 on chromosome 3 XX KW HTG. XX OS Medicago truncatula (barrel medic) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; OC rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; 50 kb inversion clade; OC NPAAA clade; Hologalegina; IRL clade; Trifolieae; Medicago. XX RN [1] RP 1-119377 RA Lovell J.; RT ; RL Submitted (30-AUG-2005) to the INSDC. RL Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. RL E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: RL clonerequest@sanger.ac.uk XX DR MD5; 365693f67e2a75d8ccd793c10136ccb7. DR RFAM; RF00075; mir-166. XX CC -------------- Genome Center CC Center: Wellcome Trust Sanger Institute CC Center code: SC CC Web site: http://www.sanger.ac.uk CC Contact: vega@sanger.ac.uk CC -------------- CC CC This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions CC were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or CC covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was CC made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; CC all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was CC confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone CC being a YAC. CC CC The following abbreviations are used to associate primary accession CC numbers given in the feature table with their source databases: CC Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP; CC Information on the WORMPEP database can be found at CC http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep CC CC MTH2-70J8 is from a MtH2 Medicago truncatula BAC library CC VECTOR: pBeloBAC11 XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..119377 FT /organism="Medicago truncatula" FT /chromosome="3" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="MtH2 Medicago truncatula BACs" FT /clone="MTH2-70J8" FT /db_xref="taxon:3880" XX SQ Sequence 119377 BP; 40801 A; 19388 C; 19126 G; 40062 T; 0 other; aagcttgcgt tggccatcaa tgatgagtga gcgaccgtcg taactgacgt tactaccgac 60 accaccatat accaaagtga atgtgaggga agttgaaacc aaacacaaaa taaaacacaa 120 gttcattttg aagtgtgaat gtgatttggg gttttgagtt tgggtttaaa tagcaacaag 180 tgccaagctc aaactggtta gtgttagtgt tactaagtca gcacgtgtta tagatagata 240 gataccgctt ttcttgctat ttttggttcg gtatattgcc agctagtgta caactactac 300 tctctttctt tctttctttc tttttaattt gcatttttct tttatagatg gaccagattt 360 ggagtaatag ttattttggt tggaatagta tatgattctg aatttcatta gttaaactat 420 tttctgaaat taaaataatt cgttaatatt gtatctttaa catatttatt tattatcaaa 480 atgattattt cttaaaaact tctacaaata aatggaggat tccacacgat aagataatga 540 gtttttctat tcacacccta tatatttttg gttacaccca atttttttaa aaagtttttt 600 ataatatcaa aattgtcctt ttatataaaa aaaaattaaa atcttgattt cattcattgt 660 cacactaaaa tttcactctc tttcacccac ctacgatcaa acaatcctga tgttcaatta 720 atctctatgg aagattaaag agtgaatcaa aacatctttc attcatactc gattgcatat 780 aaataagtga attttttctt ctttttcaat aacgctggtt tcaattttgt tcttcttgtt 840 caactgtgct gtatgacagt ttcagtttta cattgttgag gttaacttaa attcagttta 900 agtaggttca tgtaaactta atttacataa cctacttaaa ctgagtttaa gtatgtacac 960 ttaaactcag tttacatgac ctacttaaac taagtttaca tgtacatact taaactgata 1020 ttacatataa tcattgaaca atgttgaact tttagatgta cacttaaact cagtttacat 1080 gacctactta aactgagttt acatgaccta cttaaactga gtttaagtat gtatacttaa 1140 actaagttta catgagctac ttaaattaag tttacatgat ctatttaaac tgagtttaag 1200 tatctacact taaacttagt ttacatgacc tacttaaaat aagtttacat gtacatactt 1260 aaactgagat tacgtagaat cattgaacaa ggttgaactt ttaaatttac acttaaactt 1320 agtttacatg accttcttga aataagttta catgtacata cttaaattga gattacgtag 1380 aatcattgaa caaggttgaa cttttaaatt tacacttaaa ctcggtttac attaactact 1440 taaactaagt ttaagtatgt acacttaaat ttagtttaca tgacctactg aaactaagtt 1500 tacatgatct acttaaactg aagaagaatt ttagggtgta accaagaaaa atggaatatg 1560 ttttttgaaa attaaatttt atggaaggat aattctgtca ttttggggtg caaccaggat 1620 taaacagggt gtaattagaa aaactctaag acaatatgca ttaggtatgg tttgaaattt 1680 ttgtcatgca tcagccgttg aatgacatac tcgttattat taatgaaatg ttataaacat 1740 atttctttaa aaaaaaaaaa aaatgaagaa gttgagtacg aataataatt agatttgtgg 1800 actttatttt ttaaccatat aaattagtag aaaaaccttg ttgactgttt ttaaaaccac 1860 aactttgttt ttttcaataa cgaagactcg gattagtaac tttacacata cgttagaacc 1920 attgtgtgat aaaaaaacta ctgaacgatc ataaacatat ctacatatct ccaaaagata 1980 attaaagatt ttctatactt gtttgttttc gagaatagaa atcgtagaga accttcaatc 2040 gaatctttga cttgtgtctg cagaaaatag tatggggcaa gaccaatgtg tgcataatta 2100 atttatcatg gatccaacat atctctgttc gtcaacaacc tgaccaatgt ttgcgcaact 2160 catactgccg cacgttcata tgtttttatc tctaatggaa tttactaata aatttcattt 2220 atatggatcg tctgggtaaa acattttaca cgtaaaacca attacacctc tatctaggca 2280 tttgtgggga tgcttacata ataaaattgt gccgcggtgt gctttgattt ttcaatacga 2340 acgaggtatc tctgtgcgta attagataga ccgatctctc aagagatttc atcttaataa 2400 atttctttta ctaatcccta gctgtgtagt tggattacag agaataaacc atgtcctttc 2460 tttgaaaaaa tatagagtaa taaatttacc aggattgcat aaatatctct ataatcaaat 2520 taaagacatc tcattaagcc gaaagagatc tcatcaaaat gttattggat ttgggatgtg 2580 ctttgattgg atgcacattt taaaaattaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaag tattacatat 2640 aagaagagaa caagagaggt caaatgagat tctttggccc aataataaac aaccatatct 2700 tgccaggtag gtagatctaa acattatttg gattacaaag aatcaatccg gatctacata 2760 ggtctcaata tatataattt gtattctttt catgtataga agccaaacta aaatgctaag 2820 gaaacatatt atgtatataa tatgatttac ctatgtgtgt tttatattct gtccataata 2880 ttaagtatag gtagggaatg gcaatttaga aaagttatct tgtaaatctg tgactgaaac 2940 agtgttcaag gagatatcaa gagggttccc accaccttca tccagcaata ccaaactgtt 3000 ttcactatct ttaaggaaag accgaggaac atgatacctg tagcaacaag aagataacac 3060 atagcattaa ttaaaagtag tcattgtagt tcaagtgtcc ttgtcataat ttgttactcc 3120 tttttttttc catgttaagt tacaatatga ggtagaaata agtggtaact cacaatgatt 3180 gtgaaggatt gcctttggaa tcaagaaaca aaatccaata gcgaccaatg ctttgtccat 3240 ttacccaagc ttcacctttt gccattgagc taaggtctaa ggcaatgggg tcatctccct 3300 tgggtgtgtc aaatgtagtc taccaattca aattctcatt gtcacacaca cttccatata 3360 ataatataaa aatggtgcta ttaaatcata ctacttcctg ttttatttta ccttgtacca 3420 agtgagagta acttcatcaa tcgtgatatt ccccaattga gtccatttaa tgtctgtgct 3480 attttgttct gtatatactt ttaattgctc tccaagtaat ccaacctata tagtacacaa 3540 gattgatgaa aaagttgaca cacatatcag gggtgataat gtaaaaatta ttaggtaaac 3600 aaaatttgat tattgaggta acctgatatc cccatgtaga attgttcaaa ttaagagact 3660 cttgttcact gcactgaagt tccacattgt ttaaaccagc aaatcttttt tcaagaaatg 3720 cccctgaatc ctataaacca acacaaaata tctcagactt aaatgttaca aagtaaaaaa 3780 aaaaagtatt ataacactag aaatccttaa aaaaaacata ccggaagtcc aaccataccg 3840 ctgagaatag aaatattgtt cgttctttcg tttaatgtaa ttgggagctc taatgtaaat 3900 gacttcacat catgatttcc gtgttcccct cctaatagat ttaatcagaa aaagcaatga 3960 tcaattaacc accaaggtaa cttctttagc ttcaaatttt ggatgtgtgt gtgcaattaa 4020 ttgtgcatat atgtaccaat gtatgtattg ttcacaaaag cataggcaac atgagcagaa 4080 gattgaacat ggagtattgg atcgttgcaa gataaattat tttcaagcct gttcataaga 4140 ttaataaaaa gaaatatagt aagtaatgac atgttacata tatatttgat agatttattg 4200 ttagaactta agacagatca taactaacct aagagtatac caaaggtaat cagatttgtc 4260 tttggttgta ttcatttgct caagtaatga gtctgatctt agtgaagtgt catcaaagtt 4320 tggaatgaca tcttggaatt gtttccaatc atcaactgag ctgaagtttt gtcttgaagt 4380 tatgatcctt ctgttgctcg ttgtatttaa ctgtataatg tatacataaa tttaaattac 4440 atatatttaa aaggactaaa atggaacaga gaatcacaag attaattaat tcggtacaca 4500 tataattaat tctgacaaag ttataactta catgtgcggt attgaaagcc acattttgac 4560 aatctggtaa gatacttata gactttggga gcaacttgta cgaactattg ttgaattgga 4620 ctgtaacagt gttcccttta tcattgttta taagaaatgc agcacatttt ccattttctt 4680 cttcaaaaac ataaccctgc tcaaaatgaa aagaaaaaaa aactatgaat attttgaatt 4740 gcagtaaatg aaaacaaaca tgttggagaa aaaaaattaa gagcactcac ctcttgaagt 4800 tcacctaaag aaaagtttct ttgcactcct tgtaataaag tggtggaaca agacttgatt 4860 gcagcatgca actccttgag atgtccccac ttaggttgcc tgaataaacc taacaatagt 4920 atttgcaaaa ttaaaatttt atatgtaatg aggtaggaaa atgactaaga ttatacactt 4980 atcattaaaa aatgagtaaa ttaaaattga tgttatgtta tacacttacc atattcatca 5040 agtggtgctt gatcataata gcctgttatc atataagcag agcttgttct cccaaagtta 5100 gttccaccat gatactaagt tgcaaacaat gttaagattg attgtgactt aaatgaatga 5160 ataatgcaaa taaaataagc ttaaatgaag aatagtacca tatagtagtt gacaaagctt 5220 ccatttcttg caacaaaaag agtgacatga aatgcaatgt cttcagcaga gcgtatatat 5280 ggcactccac cgtatacttg atagcttgaa acagaagtaa aaaaaaaaaa agaaagtagt 5340 taattatgtt gagatcataa acgttttttt tcctcaaaaa attataaggt tgtaattcat 5400 gaacttaatt acaaagatgt ccaattctct gtccacatgg caggcttatt gggggagttt 5460 ggtccagtaa aagtttctcc acatctcatg ccattgcatg tattgatctg catttcataa 5520 taaatggaag tagtactaaa ataaaatata aaaggaatat gatagaatga cataataaaa 5580 tcattaaatt tataaacaag tgggatggaa ctgaccacag gatcaggagc atcgggttgc 5640 ttgcacataa cccatggtac gcctgtatta agacccactg ccatttttgc agcccattca 5700 acatactgcg atcctgcagt tccaaatgcc ttttggatat ttccatattc attctcaatc 5760 tacatataat tggtcaaatt aaactaataa ctgctttagt ttaaggcatt ataacattaa 5820 caggaatcat atatacctgt gacaatataa ttgggcctcc ttgcgaagca tataaaccct 5880 cttctttcat catgttcacg atttttgttg taaaattttg catgtagaac taaatagaca 5940 tgttagtatt aacgtaacac aacaaataag tgtggccaaa agagtatgct agctaaatgt 6000 accttgaatg gctcattgtc tgttcggtag acaataccag ggacatcatg tagccaaaat 6060 gggaatcccc ttcaatttta gcagttagca ttattatgtg ttagagatga caattttggc 6120 ttagtaattg ggaataaaat tgagtacatt tttatgtaag ttagtgaaac tacccgtaat 6180 tccattcact ctcgatgaaa ggtccaatcc tgagggaaac gtacaatcct tgagcatgga 6240 tttcctttat gaatcccacc aagtcatttc tgccgctgaa atcatactgt gcttgttttg 6300 tggtatgtat gttgtatcag tgtattacta tttataccat aattaatact tcacgtattg 6360 tttttttcta tattatcttt gaagaatggt gggtaacgtt cattggttga gtaaaatact 6420 caccattttt tcaagggtaa cttaggtgtt cttgacatga aaaaattgtg atctaagatg 6480 tgtaaaattg ttttttgcac attacaatat tgacggattt ttgttgagaa acatgtgaca 6540 cacaagttag attatattct tttaatagaa ctttcttcat ccataagagt aagaaatcgt 6600 acatctaact acttgcttca cttgattcat tattagtaat gcgtataatt gtttgaaact 6660 catatttttg aagtatatga tgaaaacaaa acaaggtcgg agtaatctaa gagattgatt 6720 acgtaccttg ccgggttggg gttcatgtag attccaaaac acataagttt gaataacatc 6780 caatcctcct tgttttgctt tcgctatcaa acctggccac atctgcatta cgtttcaaat 6840 ttttaaaaca aaaatccatt aattaatatt attcattttt ttttcatatt cttcatttta 6900 agcaattgat acctatgtgt aaccgtaaag tctgttcgta acaaacttac tgatggctac 6960 ttgcttactg attattttta tatgaaattt atatttataa aacccaaact tttactatta 7020 atattagcat taatagcctc aacatgtata tatcaaaatt ggtatctcgt gagcctttag 7080 ccaaaccaaa aagtttgagg aagacgaaga acattaattc cctatcatat tctctatcat 7140 acaatcattc atacccgtga tgcaatagtg aaatattgca gctgtataca gtagatatgt 7200 ggttcaaaaa gggtttgtat tctagctaca agacaatccg tttaattagt tgaacagaaa 7260 ggaatgaact ttttataact aaattgataa tatgcactac caatatgaac acggacatta 7320 atattaatct atgaagcaca tgtctactgt ttatacttgg aaatactaaa tggatcttat 7380 aaaaagagac aaatttttct ctcaaaagga tgttataata agggacggag gtagtaataa 7440 aattcaaaat ttggaataaa atttaaatac atttaacctt tcactctttt tttttgctgc 7500 taatttactt taaaatttga acatattcta atactaatat ataacagaat ataggtaatt 7560 gtaactagta cattggttgt aataaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaccagtgc 7620 attggtagaa ccttacctac cgagaaacgc agagaaagta tgagcttttg tttcaaaact 7680 ggattttact ctacaattgc tatctatatt ttctgtatag attattgata cattgataaa 7740 tatcataaga aattaaacga cccttgagga aatgtataga tgaaaacatg tgtacttatg 7800 tatagattag ttcaacataa atatgaacca gagactattg agagatgcaa taatatgaat 7860 ataggtatat tgtacgtaga tttgattacc tgaggggtgc tacgggggta atgaatagaa 7920 ccagagaaga gaatatttct ttgtccattg atgataagag atcttccatc atatgttacc 7980 tcttctgcac ctttgactcc aaaacttaat tccaatattg ctaccaacat catcatcaaa 8040 cacacccatt tttccatctc cactaattta atttgtcaca cctctttagt tatcttaata 8100 atactcctat ttgacactgc aaattaagct atatgtatat ataagtaaca aatatatacg 8160 cggcaagagt gaatctttta taacggtgtt aatgtggcct aatagaaaga taaagaaaag 8220 agagctagtt agagagggaa agagatgtga gagtcacaat tgaagtgggt gatgagaata 8280 ttttggggtg ggactagttt ttctttacat tgtgtatgcc accaaattac ggtgtcgtct 8340 tattcaccga ttacactttg ccaacaagaa aacccaacct acacacacgc acacgaggaa 8400 cagttgcaac aaaatcctta taagaaagaa acactagtat catatataga tatatttttt 8460 aagggatata taatattata gtatagtata atagttatga aaaataaaac ataaacagta 8520 gtaataactt taaataaaat aaatacagtc aagcttcttc aaaaaataaa ataaatatag 8580 tcaagcttct tcaaaaaaga tagtcaagag aaacccaata ataactttag aaagtaagtt 8640 aaggtggttt gagtactact tgtactttat ttttatagat ggatatcttt ttgaataaat 8700 gaattgtttt tgctgtttaa aaaaataaat agaaagtagt aataacttta aataaaatga 8760 atatccattt tggtacaaaa cgaatcaaag atgtgtatcc atttacgcaa caattataac 8820 ttctccccct tatattttga agtattatgg tgcacaagag aaagagagag taagtttaaa 8880 aagagtaatg atatttttat aagtatttgt tgacaatttt tagaattatt tttctctatt 8940 tttatttgac aaaattaata aagaaagaga aatgaagaga taaagtaaga acaccatgaa 9000 agtatgagaa agttgttcca aaatatttat acaaatatca tttcttgttt aaaaaataca 9060 aataaaaaaa aaattgttac acaggtattt tcgaaaaact aaatttctct atattattgt 9120 ttttcagaaa ttataaataa agtgttccag tttgtcgcgt cagtttgcta tagactcact 9180 attttatttc acgactgaac ttttaatttt caaaataaag ggaaaaaagt tctatattac 9240 cacaatttga aagatttatg gttcggggtt agttatattt agggaaggtg ttagcatcct 9300 aaatattcgt agtactctac gagaatctct tgattttatt tatttttcgt gttatagctt 9360 gcttgctttt gaaaatggaa ctaaagtgat aaaaagtaaa taaacatttt ttatgatttg 9420 gaaggactag gctctttgcc tacgtacccg tgagggatca aaacctcgta ccgtttgttt 9480 tgtaattttt tattaatttt gaaaaaaaaa agttttaaaa taaaaaagcc aagtggcaag 9540 aaagaaagga gaaaaaggga atcacttgat ttacaatcaa ggtttattat gaaaatgatt 9600 ttttttatga tttttttgtt atttgaaatg tttttgttct ttttgaatat taattaaaac 9660 ataaaactaa aactaacgtg acaagaaaat aaaagcgcga ggaattttcg taatgacgtt 9720 ggatcaccac aaaaaccatt aatctaacct aattttattt gcattttttg aatatataaa 9780 agcggaaaaa taaataaaaa taaagacata tgcataattt ttttcattta tatttacatt 9840 ttccctaaat acattctaat tgcgaataaa taaatgacaa aaattaataa aaaaactaga 9900 aacaaaatga aatgcaaaaa agccaaaagg aaataaaatg caagaaaata aaagaaaggg 9960 gaaatcgaag ggacaaaaat taccgaaggg acaaaatttc gaaaggactt attccgaagg 10020 gacagaaaaa agagggagaa gaaaataata gctcgtcaac acaagctaaa tgagggagaa 10080 gagagaaaag ttatttgaaa ctcaatagaa cttttggtgt gtgttgaaga gtggaatgag 10140 agctatattt ataggtgagg aggttgatga aaatggaaaa ctagtttaat agattttgat 10200 ggggattgaa tggtgtttaa tggtgaattt cgaaagagga atgtgaaagt tgatacttga 10260 cttgaatttt ttttttaacc ttggacattt tatttttgga cctattccaa gtaacaaata 10320 aaaagaaaat aacctaaaaa aacaaattaa attaaaataa aagatggaaa taaaaatata 10380 aaaaaaaact actaaaaata aaagtaaaat aaataaaatt gactaataat taaataaaaa 10440 agcgggatcg aaaacgatac aaaaatgagg tattttaaaa tacctctatg ctgaattttt 10500 ctctaaaaat tcatattcag ggtcaaaaga agtatgaatg taggatctta agtcaaaaat 10560 tagggtatga cacaaatcat gtttataatt cacatttttt aatgaacttt tatcgaaata 10620 tttataatat tataataatc tcttctacaa aaaaaaaatt ataacaaggt atgaattcaa 10680 tatgaacttt taagccctaa aaagttaaaa attcatattt aattcatcac ttgttaaaaa 10740 aacattaaac ttttgcaaga gaaatttcta caacgtacta aacacgacta caaaaaaata 10800 atacaaaaat ttgaaggata cacatgattt tacttagatg caaggaccaa aagttgtgat 10860 ggaaaatttt tagggataaa aaaatgataa attttttaat agggactaaa acatgaaatt 10920 tccaaatttt tagggacaaa aaacatatat aatccaaaaa aacaattcaa cttcgttgtt 10980 tactaagaac tttaaatgaa aatttctttt taataaacca aattttcaaa aaagttgata 11040 caaacattac aaaaatacaa atagtttatc cccgtgagtt taactcagtt ggtagggata 11100 ttgcatatta tatgcagagg tctgagttcg aaccccggat acccactttt tcacatttaa 11160 aatgtgtgaa ctttaaccac tagaatactt aacaaaaaag aatacaaata gtttgcactc 11220 tctgccattt ttcggaaaac ttaaaaaaat atataatcct gaaaacttaa tataattttt 11280 tcgaatattt tattcaaacc agaaaggtgc aattgaagtt tttcaaaaag ttttcaaact 11340 gaaaaacttt ttatacatca gaaaattata tggggtgaac tcatgttgga aagattgaga 11400 gtgagagtaa aaaacaaatg tttaaaatat taccatatat atggaaaaag aggtaaaatt 11460 gatattttag tggtttgtga aggtgaaggt aaaggtgtag agagtaaatt tttctttatg 11520 atgattataa attcaaggtc atcgagccca tgttaaattt gggttatggg ccactttgga 11580 catgtttgat ccgccacaca ggatgaaaat tgctgttcac atatagtata tggctaaaaa 11640 acacaggatg aaatacccgt taactacagt ggaactttat gggttaattc aatttcattt 11700 atatatgtta tttttgagaa ctttagacct taagtaagtg tattatcgcg aattcaatta 11760 tactattgtt atttattatg cgatttgcta catgaacaag atttcagatc caaattcacg 11820 aataagtata ttttccttaa tagatgagaa ttcatgtcgg aataacttga tctttatttc 11880 agattaattc tactgttatt tcactagtaa gttaatctct ttttttaatc acttttgcat 11940 ttttgccatt tttgcttgtg atattcttta ctcgtactgc atttaattta atttaatcaa 12000 ttgtgtcgtt 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