Dbfetch

ID   CR940310; SV 6; linear; genomic DNA; STD; PLN; 121689 BP.
XX
AC   CR940310;
XX
DT   25-MAR-2005 (Rel. 83, Created)
DT   29-OCT-2005 (Rel. 85, Last updated, Version 8)
XX
DE   M.truncatula DNA sequence from clone MTH2-5D8 on chromosome 3
XX
KW   HTG.
XX
OS   Medicago truncatula (barrel medic)
OC   Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
OC   Spermatophyta; Magnoliophyta; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae;
OC   rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; Trifolieae; Medicago.
XX
RN   [1]
RP   1-121689
RA   Lovell J.;
RT   ;
RL   Submitted (29-OCT-2005) to the INSDC.
RL   Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK.
RL   E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests:
RL   clonerequest@sanger.ac.uk
XX
DR   MD5; 365fbbc1bdcfdee0860f4a6af4390f63.
XX
CC   -------------- Genome Center
CC   Center: Wellcome Trust Sanger Institute
CC   Center code: SC
CC   Web site: http://www.sanger.ac.uk
CC   Contact: vega@sanger.ac.uk
CC   --------------
CC   
CC   This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions
CC   were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or
CC   covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was
CC   made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats;
CC   all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was
CC   confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone
CC   being a YAC.
CC   
CC   The following abbreviations are used to associate primary accession
CC   numbers given in the feature table with their source databases:
CC   Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP;
CC   Information on the WORMPEP database can be found at
CC   http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep
CC   
CC   MTH2-5D8 is from a MtH2 Medicago truncatula BAC library
CC   VECTOR: pBeloBAC11
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..121689
FT                   /organism="Medicago truncatula"
FT                   /chromosome="3"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /clone_lib="MtH2 Medicago truncatula BACs"
FT                   /clone="MTH2-5D8"
FT                   /db_xref="taxon:3880"
XX
SQ   Sequence 121689 BP; 41264 A; 19534 C; 20073 G; 40818 T; 0 other;
     aagctttgtc gtcccctgca acatcctacc gagaagcaag agttgctcca cactttggtg        60
     tcgaaccgcc tacagggaca agataagtag taatacaggg aacagaaaaa tacaactttg       120
     tagttgaaac tagattcaat gttttaacac aatagaggta gtaagaaaca acaaaatgcc       180
     ctcttcaagc acttcgatct atgttcgcag ggttaactgt ggtgagtatt aagatattga       240
     atgttaaaaa catgcatgag caattgacca atcatccaga acaccagaaa atattatttg       300
     gtggttactc tgggtaaatt ttaggttact gaaactaaac aatttgccca agaagtcaca       360
     ccaaacaaaa ttagatttac aaggcggtcg tgaattataa ataaatgatg cagtaggaat       420
     atcaaaacaa tacaacaaca gccaagcctt atcccactag tgtggtcggc tacatggatc       480
     aaattacgtc atagtgttct atcataaacc atattttggt ctaacacatt aatctccaag       540
     tctttcctaa tagtttctct tatagttttt ctaggtcttc ctctgcctct cgtggtctga       600
     ctatccttca tttgatctac tctccttata atagaatcta caggtattct ctctctacat       660
     gcccaaacca cctaagctat tttccgccat attttctact ataggtgcta ccccaactct       720
     ctctaatatt ttcatttcta atcctaatcc tatcccatta taggtgctac accaactctc       780
     tttctaattg tttttctata ttttctatat caaaacagta tgcgcactta acatcacagc       840
     caaaataaaa taaacagcaa ttaaaaacag gaccaagaca agaaaatgta agttaacaaa       900
     tacagtgagc aacttctaac ctcaaaacga tcaatgagaa atccaagcca tagtcgatga       960
     gcaattatct gctcaacgag atcaatctga ggctgtgatt caggctcccc gggggacagg      1020
     tgaggcctta gttttgcagc aggcccacag taccttgctt cagatgcaaa aagaccccgc      1080
     ttggtatcaa ttgtccataa ccatgcatca acaagctcag caaggacaag agctccaagc      1140
     tgaggtgcag cagaaaccaa ccatgtccaa atgaaaacac cggtttccat tgcatcatgt      1200
     gtggaaatat atgcaggaca ccagcaaagc agacggagaa gttgtgagaa accctccaca      1260
     ttcgatttag atccagaact cttgtccata agaaaagcat aactcagata aaggtataaa      1320
     tatggattcc ctaagagtta taattactac caactagata caagggagaa atgtgattac      1380
     caaattcgac aaaagcagca cagtagcctg agaacaagtt tcacgaaatt cagacctgac      1440
     cacttcccca cctttctctg ctatgttgac aaactgttga agtaaacgca caaacttatt      1500
     aagcaacatt ccattgaatg aatcatcctc agcttgtggc tgttgaggaa aagctccaga      1560
     tataattctt tgaagtccag ctccaagccc aagacttgta ggtgtagtag tactggattg      1620
     aaatccacca atgctgttat acaatcttct catgccagca atttctccag cgtggttgca      1680
     cttaactgtt gctgcagctt ggttgcactt accagaactg ataacctcta aattaaaaga      1740
     ttccgacact tttaagtttg ctcctgaaga agcagctgcg gcagctaaga ctgaaggaat      1800
     atttcctgtt tgtgttgacc agttgtcatt tttcccagtg ccaattctta tttcagataa      1860
     aagtaaaaca acgtcgattg tctgtgctct ttgccaatta tttgctttac aaagtttatc      1920
     ctgatttaaa atacaaagaa ccagatgtgc caaaagaact gtgaggactt caaaattaaa      1980
     aaaaaaaata taatgtaaca ttttcaatta cagaaaaatc aaatggaata ttataaaata      2040
     tctcacaata ccctttatat tatattcgag tatcttaggt tatttcctag tatcatctta      2100
     gagcatctta tattatctct tcggattaga tttatttttc tcagggacta aattgggtca      2160
     tgcaaatttt ctcagaaact aaaagactaa actttcatat tataaggtta gattttaaaa      2220
     acaaagtgat agatggataa tgaggcaaat cattcgaagt agaaacatag aaaattatgg      2280
     ctcaaatcat tttttatttt tttttgtgta gacaatgatg ctcaccaccc caatggaaaa      2340
     gaacatcatc cagcacttga cattttctta taatagaaat ttgtattttt atattcaagt      2400
     aaaaattata agttttataa gtataggaaa caacatttta gccccttcaa agcaaggaaa      2460
     tactattttt ttttataaat gaaataaatc agttaaacct gaagaaggcc ctggcttgtg      2520
     catggagcat ttgaaagcga tttaattatc cattcccgaa caattctctg atacaacgaa      2580
     cggactgtcg atgtccaagc aggatcgttg atgccggcgg aagaagggtc atcgtgaaat      2640
     gaaaatagca atgagtctaa gcaggaagaa tcccataaaa cctgcaaaga tatagtttta      2700
     atcttaaaca taaatgacaa ttccaagaac agaaaaaatg tagaggagac actaggaaaa      2760
     ctacacatgt agatacacat ttttttaaca cagtttaaag tttacctgtg gaaacttatc      2820
     tctaagttga attagcaagt tctctgcaat atctcgtata tgatcctccc tctgcgacag      2880
     acttttgatt aggtaacagg tatgcattgt aagtattgag tctcggccct cagcttcctg      2940
     gcctatctca gatactcgat cttcctgtag gcagaccaat cagttgtgca tatatagagt      3000
     gacacaaata acatacggat cagcctttaa caaagtcaac ggcatagaca cggtcagaca      3060
     cataaatgaa agcactagta ggtcagataa ctacaaccca ttgcagcacc tgaaagggtg      3120
     tgaatctacg ccatttgttg atgtacataa acattaaaca atattcagtt tgattttatt      3180
     attgtggggg agggatgtcc agttttggtc gaaaagatat gtggttacca tcatacgtat      3240
     gctaattatt tatagaataa acccttaaat tggaactcca aatatttttg tcaccaaatt      3300
     agttcctaaa atatacaaaa tggttactaa attcatcttt ttgtttcatc atttcagttc      3360
     tatataaaga taaatgtact aaaaaactgt catagaccaa tgtggtgaca atgtaagctt      3420
     tggaggatca atttaggagc atactcttaa atggaacaaa aataattgtt taacaaacaa      3480
     ctagtgactt tttgttaaaa aagttctagg tattggattg gaaaaaaaaa ttacaggcat      3540
     acactgaatt atatgcacat taagaaaaac actcacaaaa aagaaaagga aaaaataaag      3600
     aaaatataaa acttaaatta gagtgaagag ggatgctcac tttgaaaaaa gtgtaaagta      3660
     aaacagccaa tataataaaa agcataacag aacaagtaca aatttcaaag gaaaatttac      3720
     atcaatgaaa actattgtac ttttatgaca atttctcgtc aaactttctg cacagattga      3780
     ttaaattgta aaggcttctt agtaaacaat cataaattaa atcaacgatt caggtccctt      3840
     gcctttattc ataataaaca ataaattgtg gatacaacaa aagcaatatt ctcaatatga      3900
     gaaaatagag aacgtataat tgttttgcat atacatagtg ttaagagtcc cacatccgat      3960
     agaagatggc ctgaaaatgt gtttataagt gggggcaatc ctcacctcac aagccggttt      4020
     tatggggttg tgttagaccc aaccacgatt tctaagatgg tatcagagcc tcttcaagat      4080
     ccattgggcc acccaccatt tatgtccagg aatcaagccc aattttgctg gttgtgacgg      4140
     ggtgtattaa gagtccaaca tcggatagaa gatggcctga caatgtattt ataagtggtg      4200
     gcaatcctca cctcacaagc acaatttcta agatgcctca gaagcaacga aaagctcgtt      4260
     ttgtttctta tacctaaaag ggtgtcggaa agtgaactta gcgagtggtg cactgcgacc      4320
     tgggtcgtga atgatttcgg tgactactcc tttaaggtaa ttgtttcgtt caccgaaatc      4380
     gagactgttg gaaattccgc cttaattgcg gtccgcccct agtcgcctaa attgcgacct      4440
     ttggttagcc ttcattgcag cctccaacac cttcattgtg ttggctttga gggggtggat      4500
     ttagtcccac atcggataga taggactctt gagaagagtt tataaagagg aggcactcct      4560
     cactttacaa accggtttcg taaggatgag ttaggcccca tattccaaca cataggtatt      4620
     ttttgctact acatgcagcc ttttagatga atagtaaaca aggctcagtt aaaacatgat      4680
     tcttcagtat caagttgata cctcaaattt atataaaaaa tgctactaaa aaaacatggt      4740
     atcggaagaa aaaaaacttg gtattccttg ttttgaaacc tacggccctt tgttattata      4800
     cataaaggaa gtatcatcaa gttaaacaca gataatttag ttgaacctgt ttcaaatcag      4860
     ctaaagcttt tgcaacaact gaattcagat gaaaacattg tgaaactaaa acctaccatc      4920
     catgacacag ctgtttcaaa agccctgtga acgatcgcag ttaagcactg aaagacagct      4980
     ggcattagat ttggagtctt aagatattca aagacacaag taaaagcact tctagcagta      5040
     tccatagtgg tgccaccatt taggattcca ccattgctgc taaagcggat gatctcgaga      5100
     aaagctacag caagaagata agtagccttc acccctgtaa gcaaataatg agaaagacaa      5160
     tcaccatgcc agacatgata gagtgggggc agtaaaaaat taacaggagt taagaaggag      5220
     caaggcagtg aatttcaacc caaaccgaaa gcatgagaac ataatgtaga aaacaagggg      5280
     tgagtgaaat tttagttgct tgtaaacagc acaaggctat gaacaagttt tcgtgtaacc      5340
     aatattctac taattaaata ataaaaacga tcacatcaac catgaaagtt aacatttgca      5400
     tatacaaacc ggaaaaaatg aagttcacac ttccatagaa tatgacattg atcacaaaac      5460
     acatgccatc atgtcaccta agacataatc atttgtcatg atgcttgtta ttggaacaat      5520
     gctatgaaca agttgaatgg gaaatgtcag tctaagagat tctaagagat tccagcacat      5580
     gtccaaatgt ggtaagtgtt aatacattta aaatatatct tgatttcgca gacaattgtt      5640
     tccagtcaat aatgcatttg acatgggagg aagtgttata caagggatga aactgctatg      5700
     ttcccaaggc gagaggcagc ccctctacaa actaatggta ttgacagttt catagaaata      5760
     taaggaatat ggtaaatgca atccacctga gattgtggtc attgatgcca catcaactct      5820
     ccctcctaaa gcggcagaaa gagcagttct ctgtgcaaga gcggctttct cattgccact      5880
     gccttggcga ctgcctgggt tgtgcagcgc atttagttct aactcgtcct caagccattt      5940
     cactgagcta acaacctgga cagaaacaga gagacataag taaaacttca gttcagaaag      6000
     gtacctagta aacagacaaa ttaaggcagg tgaaagggag ttgctgaatt tgcagcatta      6060
     actttaatca tcggaatggc aacttttctt taggataaag agacttgtga aaaataaaat      6120
     gcaacaaaac tatacagatt aaaaataata tcaaaggctg aaaacaacgt cgctcataat      6180
     tcgctgttaa aatgggaggg gttcctgcag ttgatatgaa gttcatacta ccacaatcat      6240
     atttaacatc ttcccaggat tttaaaagta ataataatat aataagccat ccaacgaatc      6300
     aaggtcccca gcagacatgg tatttggtgg caacttgagg atttaacaga tctttgattt      6360
     taccattggc ctctcatgtt aaatctccta tcagaggcca attttgacga gcaatatcat      6420
     ctgttttgca catgtccaaa ctttttttaa taatttaata actctggagg tctctcaatt      6480
     atatgggtat ttttaaatat aaactaaaaa agtttataat tgggtccata aataaactag      6540
     tcaatgattt gcacttagat cccggaggca aaaaaattaa tctgatccta taacttttaa      6600
     ataatatgca attaggtccc tgaactttca aacaattagt aattagatgc tgaactttta      6660
     aataatttgt aattgggcct ctaaattcaa agacgtaatt acaaaaattg acctgattaa      6720
     aaaaattagt taaggaacct aattacaaat tattgatgag ttaatggacc caattacaaa      6780
     ctttgcaagt tcagagacct atttaaaatc ttcaaatagt ttagaaacta ttttcataat      6840
     aatggatata aatttcacat tatacaacca ctatcatcag tttccataac tgtccctggc      6900
     actctagttt gaaaccttgt agccaccatg ccagaatcaa taaaaatagt gcaactatca      6960
     tgcaagataa atatttgtat tatgtgcatc agtagctaca ttaataaatt taatcataac      7020
     ttcctggtgc aaatcctcag ttgcagaata agtatatcca accttttagt tattattata      7080
     tagaagaaaa atgccaatgc tacttatcta cttgttattt caataattgc attctaaaat      7140
     cacgcatgct tcaaaacaat accttcatta cgtatatagt tcaaatctct atgaagtcca      7200
     cctctattaa agcattcaac aaaaaagaag tccacctcta ctaaaaacga ataagtatgc      7260
     gtgcattgaa ctgaacaaaa gaagtccacc tctactaaag cattcaacaa aaatgagatg      7320
     gaataacatc gtagataaat tttcttagac ggctttgcat agacctgaca cattcaacct      7380
     agtgctcatt tggtaaatga aacagtcatt gcattcacat atctattcca cagaaatcaa      7440
     aattctggtc ggttagaaat taaaaaaaat aatatgaaac gatgatttca ttctggtgtt      7500
     tggttcagga atatttattt ccctcctaga ggtgagaatg gccagtccaa acacgcaggg      7560
     attattaata attgtctttt ttccttgtct tataatgatg actccattct atatcaattc      7620
     ttattaacaa tcatacgaac tccatgtgat tcccttctct tactctaagt cttgaaggga      7680
     aaaaatcaat tatttgtgta tcagtattac aaggaaaaag accatccata agcatgaggc      7740
     cttaaataat acagtttaaa attcaaatca aagtaaaagt aaacgtggtg aagatcccga      7800
     taggtagcta aatggtattg aagtttttcc aagtaatgat gaatcataaa aatactttta      7860
     ggctttgttt gggagtttgg aggggagggc tatggggggt gggaaatata gggaaaaatg      7920
     gagaagtctt tcaaaaaatt tgaaaaagtt tttttttaca gaatgataaa ttaacgctta      7980
     taattaatat atttttaatt ttaggaatat tataacaaca tagactgaat ttgaagaatt      8040
     catataaacc ctctaaaacc ctccaaagtc ctcccccaat ttctccaaat tagggggatt      8100
     ttgtattatg aagaaaacta aaacccccaa aaccctcccc tcccaaaact ctacattctt      8160
     tccgcttgct ccttcctttt tcccaaagcc ttcccctacc ttccccttca aactcacaaa      8220
     caaagcctat gacaaaaaca acccaaaagt caaagcaaca aatgcactaa tgtattctat      8280
     taaaaaaaac atgttgcata taaacaccaa ttgaattctt tccccgataa ctagtatatt      8340
     ttgggatcaa cttactagtg gaggagtccc ttgtgcaatt tgattaacag cagaagacca      8400
     ctccatattc cacatatatg gtccatttac agcttgaagg gcaattgcac ccatgcttcc      8460
     catactgttc agtgtactgg aaactgattt cgtagtcacc tgagtctttt gtacaggagg      8520
     ggcaaggcca aaaagagcaa catagaacca aaggtttcga aacagcttta aaactgatgg      8580
     ctccacattt gaagtaggat caaaatcaga acaagctgcc gcaactgcag ggagcaaagg      8640
     acccagaaaa tctgctccac tcctgtagtg agtcagcatc agatgtgaaa tcttcagaaa      8700
     acatgatcca ccaaggaaat gaagttgaat aaaggcctac caagagtctc aacaaaactt      8760
     gtggttatat atataacatc atgtgctcag cataaaaaaa taggtatacc ttccactttt      8820
     agactcagca gctaaaccaa catctgagca cagggatagt aatcgatggc gataatctga      8880
     acgtagtcta tcagtagtaa gaccagtggc aataagaaga aaccctgcag gtagagtcta      8940
     gaatttaatt gaactagtga gaatccattt gatatttaca ccagactaat caaatttaac      9000
     atgtgttgtt gacattttga gatactacat acttcaactc tctcagttgt agcttcaggt      9060
     gcttctgttt tgctttcagc tgatcccacg ctagagagtt tattcaagta acttcgagtc      9120
     atcaaaacca ctgtctcgcg gtaagatttc tcaaaaccta aactggccat tcgagacact      9180
     gcatctagaa gctgtatggt ttgcaacaaa aacaatataa gattcataaa caactgccaa      9240
     aggattaata gattggagct attcttgcat aagcataatg cctctagaca gtgtgcttgt      9300
     acaagaatta ctctagtcac gataaattta agaatttcac gttaatttta taatatattg      9360
     aatacaaagt tccatactcg gagtctcaat aaactaggag ttgaagcatc gccctcttct      9420
     aagctttcta taaaaagagg taatatcaca tctaccagct cagacttgtt gactgcagca      9480
     cttagttcag caaacaggcg tataacgttt agttgtacaa aaggaactgc aggtttctct      9540
     tggttgtcct gagggaaaca atatttcgaa agtaagtgaa tgtttaacac ataaatagat      9600
     atatgataaa atatcatgtt tagagtaaaa aaaaaaatat gtcaactatt tcggcacaag      9660
     aaacaatgct gaagaaacag gaaaaaccat ataaatagat ttcattgcgg atggaaatga      9720
     tgaaattaag gggaataaac tctcatgtat cagaaagcac atgtgtacta aagtccacaa      9780
     agtatatgga agtgtataaa aaatggcagc ctggtgaact aaagctcccg catatgcagg      9840
     gtccgggaag gggtcccacc attttggtgg attgtacgca gccttaccct attttttaca      9900
     caagaggttg tttccaagac ttgaacctgt gacctttcag tcacgtaata acaaataaaa      9960
     atgtatacat gaatatataa acgtaatata tgttatgtta tatagataga tatgtacgcg     10020
     cacacagaaa gaagaaaaaa agacagtaca atatggacac actcaaatat atttttattt     10080
     attatcagtt tctgcctcat ggatgcacaa aaaattagta cacaaacctg ttccccataa     10140
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     aacttggcta tctttcaacc acccgtcaag gtaaacttgg ttggagtttg gggtcgattt     33180
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     ggattttgct ttctcaactt gggtatcttt tagccatcca tcaaggtaaa cttgattgga     33300
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     agattacaca ttttgagata aaaattttaa ttgatatata ttgatttata aataataatt     56160
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     gattttagat taaaaaaaca tatatttatt tatcaatagt aaaataacaa taataacaag     56580
     tgaatcatgt tcctttcttc tttcatgtcg tcgcccgcaa caaatccaac acctctctct     56640
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     agatccctat ttttgtttta cccatctcta ttcctttcta gtacaaattt tctttctatt     56760
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     aacttgagtt aaaaattaag ctcgttaaat aaatgagttg aacttgaact tagtacggtt     67800
     cgactcgttt ggttcatgaa ccagctcgac atatatacat acacaatttt ttatataata     67860
     taggatttct tacaaacttc ttctaataat tatgcacttt tttcatataa aatatcacta     67920
     attgataatt taataaaaat caacgataat tataatacta taaagaggaa aaaaagttaa     67980
     tgcttttaca aggctttaaa ataaagttgt gcataaaaat tgtctcacat cggggagttt     68040
     tgcaaaagat tagagaggag gagtatatat atatatatat atatatatat atatatatat     68100
     atatatatat atatatatac aagcagtgca ttacaaatac aacatataaa accaatacaa     68160
     gtagtatata taaagtgttg ctacctttct aaaggttttg cattatattt tttgttcctt     68220
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     gaaaaaaggt tttaaaatat gcaatttgag caaatgaggt gaacctaacg agtcgaaccg     68340
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     gtcgaagaaa aaaggaggat gagatagtgg tgttggatgg cggcgataag aggaggagag     72660
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     catcttaaat gccacgcgta cgatttatgt acagtcagca actgccacct atgcaaaaac     72840
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     taaaaaaaat tattgagtgt atgatacatg tagaaaaaac actaaatcga taattaaaaa     75000
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     aagattttac atttttttaa atgtaattta tttctttgct aaaaaagtta tttatttctc    102840
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