Dbfetch
ID CR378662; SV 1; linear; genomic DNA; STD; PLN; 119227 BP. XX AC CR378662; XX DT 24-MAR-2004 (Rel. 79, Created) DT 30-AUG-2005 (Rel. 85, Last updated, Version 3) XX DE M.truncatula DNA sequence from clone MTH2-41N19 on chromosome 3 XX KW HTG. XX OS Medicago truncatula (barrel medic) OC Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta; OC Spermatophyta; Magnoliopsida; eudicotyledons; Gunneridae; Pentapetalae; OC rosids; fabids; Fabales; Fabaceae; Papilionoideae; 50 kb inversion clade; OC NPAAA clade; Hologalegina; IRL clade; Trifolieae; Medicago. XX RN [1] RP 1-119227 RA Smith M.; RT ; RL Submitted (30-AUG-2005) to the INSDC. RL Wellcome Trust Sanger Institute, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 1SA, UK. RL E-mail enquiries: vega@sanger.ac.uk Clone requests: RL clonerequest@sanger.ac.uk XX DR MD5; a6d80bce85133c51ac5e71706b83eaf2. DR EuropePMC; PMC1201151; 16102170. DR EuropePMC; PMC2397509; 18348734. XX CC -------------- Genome Center CC Center: Wellcome Trust Sanger Institute CC Center code: SC CC Web site: http://www.sanger.ac.uk CC Contact: vega@sanger.ac.uk CC -------------- CC CC This sequence was finished as follows unless otherwise noted: all regions CC were either double-stranded or sequenced with an alternate chemistry or CC covered by high quality data (i.e., phred quality >= 30); an attempt was CC made to resolve all sequencing problems, such as compressions and repeats; CC all regions were covered by at least one subclone; and the assembly was CC confirmed by restriction digest, except on the rare occasion of the clone CC being a YAC. CC CC The following abbreviations are used to associate primary accession CC numbers given in the feature table with their source databases: CC Em:, EMBL; Sw:, SWISSPROT; Tr:, TREMBL; Wp:, WORMPEP; CC Information on the WORMPEP database can be found at CC http://www.sanger.ac.uk/Projects/C_elegans/wormpep CC CC MTH2-41N19 is from a MtH2 Medicago truncatula BAC library CC VECTOR: pBeloBAC11 XX FH Key Location/Qualifiers FH FT source 1..119227 FT /organism="Medicago truncatula" FT /chromosome="3" FT /mol_type="genomic DNA" FT /clone_lib="MtH2 Medicago truncatula BACs" FT /clone="MTH2-41N19" FT /db_xref="taxon:3880" XX SQ Sequence 119227 BP; 39136 A; 19192 C; 20089 G; 40810 T; 0 other; aagcttggat gtataggcat tgcaggtgtc aactttatct ttgctgaaat ataagctttt 60 ttcagaagta tggcggtgtc aattagcttt actagggatc aagagcacaa ctcttttagt 120 caccattctt ctaattacag ttaattttca gctcttgata aaaatttcca aggcattttg 180 tatatatatt tcattatttt gttgcttcgt ttaatcttta acatatttca gttttgtgct 240 ttcagttact acttactagt gtgtttaatg aatgattatg ttccatgcgt gcctcaggtg 300 agatttgtct tttttctaac tgactgttgg aggtagtttg tgtttgatta tgatgcttgt 360 ttagccgtaa tcaatttgtc actgcaaaac catcatacaa gtggattatg atacaccaag 420 tttctgacag atttttcaat aatctgaaat aaaaattaat gtatgaacca aattaatgta 480 tttttgtcat gttttgtatc atcaataaac ttgattttgc ttaccctcat tttattttgt 540 tgttgttgac atcttgcagg aataagccta aatcgaaaga accaaattga tatgaagaag 600 attaaatata aatattgcag taagatgtct aatcttttat tgtttttgta gcttgtatcc 660 aatctgtttc tttgtagtag gttgccttct ctgaggatgt ttgcatgaat atttggtttc 720 gtattgctta attctgtttt attcataaca tgtgcctgca caactcaaca cactaaagat 780 gggcatgaat cagaagccaa ttcggacaga gactagatca tcataccaac aagaacttga 840 tgtactaagt actctacatt gggtttgagt ataattctgt gtttttgttg tgtttgttaa 900 cacgtgaggt gttgttgatg cggtaataat aagttttcaa ttcaaactgc taccttgcat 960 ttcagttact gaaatgatta acttattgat tgatttcatt ttccggtccg agtcgaggta 1020 ggatattcaa attttggtag gttttggatg ccccaatgtg gaaaatttta aggaagtctg 1080 tacatctgaa tgaaagggat gtaagtgtaa catgtaacat gcatcattcg gtgctcgaca 1140 caattttggt tgatattttg tttgagataa tggaggcagc atggtttgaa cttatctcta 1200 ctattgtaaa aaggtattta aattagtagt gtttatattt gtggtttgtc aatttcctcg 1260 ccctcattaa catcaaattc ttttacctaa agcgttgtag gtaaaggaat atgatgttaa 1320 tgaaggtgag gaaattgaca ttgtgacagt ggataaagat aatgctttca gtgactctga 1380 tatctttcta gaagagttat gcttctgacc tgcaactcat atttggaatg ttcctgaaaa 1440 acaagaaaat tgtttagaaa gcactttaaa tttgggagac agctataact ctagattctc 1500 gccttcacaa aaggctgagc cagatgaaca tttgatgaat catgcctcta gcccagttaa 1560 aagaaatttc atggttgcac aacatgcttc taaaagtttt tgtattctaa taataaaaac 1620 gatttgttta gataaatgac ataattatga agctcttata tcataagcac gtaacataaa 1680 agtttacatt ccaatcaccc ataactggtt gtgaaaatgt tactatttgc attagtaaca 1740 ttgtaatgaa tgttagatta catttagcag acattctaaa tctgcacttt gtgaaaacat 1800 ttattctgga aacggtccta ttaaattcta catttccatt tagcagacaa gtcaatcttt 1860 ggatttaaaa aaaaaaagta atttgaatat tttaatatat tagtagaatg cgtacaaaat 1920 ccacaattca gatagtaatc caatatgttc tgaaagctag ccagacaaat ccatgcttgc 1980 catggtgcta ccgtgtgaat atttaaccac tcaatacttt atattcagaa gtgcagggtc 2040 tgtgattaaa gccaaatttt aatcattaaa tcttaacaca aaaactgtac ataaggaaaa 2100 gtgaaaaggc ttaaggcctc tttccaaaat gtgatgttta tcagtatttt gattttttgc 2160 aataaagaac tagtcaaata tttatgattt catgatgtta taggctgggt tatgtagatt 2220 ataaactcat ggtagaacat tgtatattcc ccatttgcaa tgcataataa tatgaattca 2280 tctttccctt aacaatcaat aaggaaaatg gtcttctact tttcaagcaa tcagtcttac 2340 cctcacagct acgataagta ttatcagaaa actctcaccg atggttctca taaatcattg 2400 gttttagttt gaaatgagtt ggatattgca tttttcatgg tgccggagga aagaatgaat 2460 tatgctctct cccaccacat tttgctcgcg cccaactgga atacctaaaa tactcctgcg 2520 ctagttaaat agcgcaagtg ttaaaatatg cgcaacttaa ctaacgttgc gtgaattaac 2580 tcacgcaaga tttatttatt ttctatttta tttgttaact ttattctaat ttatttattt 2640 attcaaatta atttatttcc tttattctaa tttatttatt tacataaaat aaatatttat 2700 tcgaatttat tctattcatt aaataaatgc aaatataaat taaaaaatga acaaaattaa 2760 tatttattcg aatttattca ttaaatacaa aatcagaaaa taaaagcaaa tataaataaa 2820 aaaaatgaac aaaattaata catataacaa catctcattt tattaatact ccctccggtc 2880 ctatatataa gaaaattttc aaaaaaattg ttggtcttat ttataagaaa atttcacaac 2940 ttttaaggtg tagttattgt ttaaaagact tttctacccg ttatttaatg tttgtctttt 3000 taatattagt gggtgtattt gtaaaaatat aaaaaaaatt acactaatta atgagtgcat 3060 tggttttgat gtttttttgt ttttcttctt atactataag gaccggaggg agtagaattc 3120 acacaattat aattgataca tttattcgaa ttcactaaat ctactttttt tttttttacc 3180 atcttggggt aaaaagtgat caaccttggg gtaaatagtg agcagccttc ttgggggaaa 3240 agacatcatc aacccttgag ttaaatctaa atctggttct ttttataccc cgaagaagat 3300 tctttttacc aacggtaaaa agtttttggg gtaaaaagaa gcaaatttaa ttttatccca 3360 agtgttgatc acttccccaa gtcggctact cactatatat ctcaaaactg atcactttaa 3420 acctcaaagg ggtaaaaaga gactagagac tattgagaaa aaaaataggg ggtgagagtg 3480 agaggagaga atgtgagata gtgtgaagaa atggggaagt tttgaggggt atagatggga 3540 atggtagtat aggttataac taccataaat gtagtcaaaa aaacgtgtaa agcgtgtaaa 3600 aaaacatgta gattgaatgt tgaaaagctg accaaagtcc aaaaaacatg tgtttttgag 3660 ctctggccaa ccggccacca tgcatgagtt aactagcgca ccggccactg gagcatgact 3720 taagtcacgc aggagtataa ttggtaaatc aactaggtgc gagcaaaatg tgctgggaga 3780 agagcagaat tcagaagaaa aaaaaaaaaa attctcaagg ggtgagtatc ctcaaaatgg 3840 gccaacttca atgtctccac ctcggcccac attttaattt cactacgaga attttttttc 3900 tgtctctacc aacttctcac tcgtgctctg aattgaccat tttatcctcc atcgagattt 3960 cataatccat agcgtgttta tgcgctttca attttacaat cccaattgtg tttaaccggt 4020 tttgatcaaa ttcaaattaa tttattaaaa tgacataatt gtaagtgaca taatttaaaa 4080 tggatggcaa aatttaatag tcgtcacatt ttattaatta aatatgatta taatacatta 4140 acataacact aattattaca aaaaaaaaat aattacacct aaagctaaat atgtagtaga 4200 agaggtggag gtggaaggag gagaaggttt gtcatccatg tcacgcatcc tcgatagtat 4260 tcgggaaaac aagataacat agtaaaagaa tgtgaaaatt tatttaaaca atcttgaaac 4320 cagacaaatc taaaaaacaa gttgaaatgg aatatcccac tctgaccatt cttactaacc 4380 ctagaactac tactacgaag gtctctattg atcttgggta tgaaagaaaa agaaagatac 4440 catgacatgc atggaaccag tcatacttgt tgatcaaacc atcgtccaca ttctggagtg 4500 gttcatatca tagaagccaa aacctgatca gtattggttc agcttataca atctgaaaca 4560 tgccaagact ttgtaaatac ttgtacattg gagggtttgc tacatttcat attatataat 4620 ctgaatcagt caactataga attttcatgt ggtacacgat gcacataaca tttaataaat 4680 cggtgtgttt ggttcaatta caaaccactc tacagaacca tgaacacttt tagtttaggg 4740 tccacattga tgacacattg tttggcttga atgataatgt tgtctcaacc acatagacac 4800 aagatggatg gatagtgttg agtacggtca ttcttcgata gacttagata agtgtgtttg 4860 gttcacctag atgaagctcc ataacgacca tgaggtgaga ctcatgttct ctatatttgt 4920 tcagcacaat tctaaacgac caatcgagtt agacacttat ttggttatat atttttgaga 4980 tatttataaa agtttaattc ggcccataac ctacgaagaa attaggtctt gcatgaatag 5040 acagatgaag aattaagttt ggatgaccca cgttcttgtt tgtttttatt ttgttgtttt 5100 acgtctttta attatgttgt tgaaattatg ttgtttaatg catgttgttg ttgttgtaga 5160 attttatgta atgacttttt ttccaatttt ttgtgttctg gactatgtta agattatata 5220 atctaataaa tcttgtcaaa ccctccaaaa ctcgagtttt aacagagttt gggaaggttt 5280 cttattagat aagttgaacc aatacatgca agagtttaga ttatataatc gaatgtagtt 5340 cgaaatgtgg aggatcttgt tacaagcaat gtttggataa tttgtggtgt gtttattgca 5400 tttttggtgg ttgggtcatt ttaaacgttt cctttgattg tagctacaat ctaggatggt 5460 tttatggcaa taggtagtct ttgattcttc tacacttaca ttgtaaatca cttccttctt 5520 aattactttt catttgggag tgagttatga tactatgatc cacatcttaa tcaaaatgat 5580 ggcgcatcgc ttcacctcct caaatcaaac actaccaatg tcacactcat aaaagcaagc 5640 ttggccatgg tacctctatg aagtaccttt gttagccttt attttaatag catttgatgt 5700 cctcgccttg attttttgtt tctataagat gatagcgttt ctgggtatca atcaatgaag 5760 cggaggttga agaagatcaa aagatttagt gttggtggtg gtggtatttt ttagggaacg 5820 gctgagggtg gtgataagag ggttttgagg gttttttgaa ttgtttgatt cgagaagaga 5880 tttctggaag gattagattg ggagagaaga agaggggtgg tggattctga tgaggaggta 5940 attaaagatt gaccatgtgc tctttctttt gactttccat tttgattttt taattcaata 6000 aataagtgtg tggcaatttt atattttttt taattcatta attacccaca tgacatgcca 6060 ctcgtttaag tgaggtgtca cgtatggggt gactcggtca aaattgaaga aaatgactac 6120 aattgcaaaa gagactagac atagtggact acatttgtca tttttttaat atggggtaaa 6180 aatcgcaaga ttaagaaagt tagggattaa aagtacaaga acctctaatt atgattcatg 6240 atgtccttga acgtactctt ctccgtataa ccaccatctt ttctaagtgg tatatcatta 6300 gttactgaaa gcaaaagcga agtattaaga atacatatgg ttgtgttatg ataaaaaata 6360 aaaaaataaa aaaaacatta attagttcca tgtttcaatg tttctgagtt gtgaccatta 6420 agtctgcaac ggtgatatgt ggccactcca aatgatatac attcagcatt acagagctag 6480 ggatatttcc attaagaaat cctacctcgc gtgtttatac tccattgaaa acatcgacga 6540 atcacatctt tcacactata aatacttcaa aaacataatt gggattatgg tctaaagcat 6600 ctccatggta atcacctcta tgtgtatgtg tgtgaaaatg ctaacaaatg tcctttaggc 6660 attgtttaaa aaatcaataa tagtagtaac ttttacatag aaatatgtgt gattattact 6720 ttttcatatg tttgacttat gtttttaaaa aaatattttt atttatgatt ttcttaaaca 6780 atgtacgtag gacacttgtt tttttttttt tttagggaac gtagaacact tgttagcaag 6840 atccatatat aaaagtatgt atcgcttaaa tactaattaa ttagaaaaaa tattacaatt 6900 ctatgaacca aaataataga atgcatatag agacacggtt tattatactt tttatattct 6960 ttataagcca ttatatattt catataattt agattaagaa actactcgaa gaattaataa 7020 tgatatttaa agggttattc attttgcagt ttgatttgct gcattaaaat acactagaaa 7080 ttaaaccaac agtactatac acctaagaaa ataaggaaat agtgggaatt aaaaacacaa 7140 tagtttaaag agtggtggga tccaaaggaa ggaagttggc aaataaaaaa ctttattcat 7200 atacaagtga acaataaaat aatagggatg gagggagaga aggaaaagtt ggaatttgaa 7260 ataaagaaaa aaatggataa ttgataaaac taagaccaaa tacatttgca agttgatcat 7320 ccacttgcat aaccatgcgt aagcttcttt gtggctttgc aagaaatcaa taaccccaac 7380 aacaaccttg tataaccaac ccaacctcaa tcccattcct atcatctatc tcattacttt 7440 ctcagccctt atctcacgga gctgaaaaag aacaaagaag aaaagaaaaa gaaaaaaaaa 7500 accttaacta caccaaaact atattgcaac ttgtactaca aaaatatttc tcacataaca 7560 cctttgcctc tcttacttca tatatagctt tcttcatttt cttcttcatc attaaatcat 7620 taacacgcat gttctcataa tcatattcat ctcccttaga gagtttcatt tttattgttt 7680 attttttaga tatatatata ttttttttta aaatgccatc aagtttttct cttcagcttg 7740 agagattcaa ccgtacaacc gatgcaacca cctacttagc catagcaaac ggtgcaaact 7800 gccctagaca accacaaaca ccaccaccca cggcggcgcg tcgtttagtt atcccatttc 7860 caccatcttt atcttcttcc aacggaggaa ccctagtcct agacacgtta tctcttcacc 7920 acgcacacat ggttggacca aaccagtgct gctccgtcgt cacacaaaca atctccgccc 7980 ctatctccgc cgtatggcct gtagttcgac gcttcgaaaa tccacaagga tacaaaaact 8040 tcgtcaaaag ctgccaagtc atcaccggag aaaacatcac cgtcggcgcc gtccgtgaag 8100 ttcgtgttgt ttcaggactt ccagctgagt ccagcactga aaggctggag attcttgacg 8160 atgaacgcca cgtcatcagc ttcagtgttg ttggtgggga ccaccgtctg agaaactacc 8220 ggtcggtgac gacgcttcat tctgtcgacg gagataggac acttgtcatt gaatcatacg 8280 ttgttgatgt accgcaaggt aacacgaagg aggaaacgtg tttttttgtt gatactattg 8340 tacgttgtaa tttacagtcg ttgggtcaga tcgctgagaa tactatcaga aactctgagt 8400 ctgagcaata atcatgaatg aactcatttt ttatttttta ttgtttttta ataatttggg 8460 ttgtgttttt gtttcgaata tggggttatg gatcttatga tcattatcgt gacatagatg 8520 ccagcctgta ttgggaattt atggatgggt agattagatc agtagggctt tttttctgat 8580 ggcaaatgta gtttgaatat gatatgatat gtatatattg atgatgtata atggatatgc 8640 atttgatgat atttatgtca ctaaataatg tgtagtgcta gttgttgttt ttcttctgct 8700 tttattaatt tatatatctg cgtttcttat aatagattgc tggtttttcc atttgcacca 8760 aattaaatca gataccatac catagtcata gtgcattgca tcctatagtg aaatttgtat 8820 tctttatata gtatacttca tttcattctt gatcttatat aaggttggga tgaagagctg 8880 tgctaacact agaacatgaa ggacggcatt tttttttaac aagggcaaga gcaatgcctt 8940 ttttttaatt ttgtttttta attagagatg cgcattgtat attaccttgt ttgctagtta 9000 aaaaaaaaag tagatctgca tttatatatg ggtgttcgta cacatttcta tactttgatc 9060 aatgtgtaaa gagataaaac aaatgtagat ttgtgttatt tgaacatcca tagatgtaac 9120 aactaaaatt ttataaagaa aatgaagtag tgatgcaaaa accaaagcaa tagagagaga 9180 aaataaaaag ataatgtggg tatgagagat aaagttgtaa aacatgattg ttcaaatatc 9240 atttctcaac aaataattgg gtatgtaccc acaaaaataa acaaataatt gggtacttta 9300 atcttgcggt atccgatact ttaaaattgt tgaaataccg aaatccgatg catattatgc 9360 atcgatacgt cctgacatgt atcgggagaa tattcgatga ttaaatttta tttaaaaaaa 9420 aaaaaaaaaa acaattgtcc tatatatttt agatacattt gggaaatgcg agagatatga 9480 cgttcaaaac cgatacgcac gggatacatg atttttctat tattttgttt tctgctattt 9540 tctttaaaaa aagaagagga aatatgattt ttttttaatt tctttttttt ccttttaaaa 9600 aaaataataa aaatgaaaaa cattatactc atatatacat taggttaatt atgttctttt 9660 tgggaggatg ttctcttttt gtgatatata taaggcttaa ttgcactttt ggacccctat 9720 cttttcaaaa gttgcggtta tggacctcta actaatttaa atacaaatca gccccctatg 9780 tttatattct ttggcagttt tggaccccga gttcattgtt gactcgatca acgctgacgt 9840 ggcaccctaa gtgaggtgcc acgtgtcatt tttttttttt tttttgcctt gggggtccaa 9900 aactgctaaa gaatcaaaac atagggggct gttttgtatt taaattagtt aggggtccat 9960 aagcgcaact tttggaaaga tagaggtcca aaagtgcaat taagcctata tataattgac 10020 taattatcac tttctttatt agatatttaa ttttaaattt aactttttat taaagtatat 10080 cggccgaacg atattttaaa ttctataatt ttcttgtatc ggtatcgtac catacaggaa 10140 tcatctcaag catctgggct ttatagattc tcatattcat atccttcaaa aagattctca 10200 ttagtcagta tttcatgtaa attaactatg ttttagaaaa atgttattag tttataggtt 10260 aaatttgttt ttagcccctt caattatacc aacttttatt ttttagtctc tctaaatttt 10320 ttcttcaaat tgtggctcct ctagatattc ttctaccaat tttatatcct ttaatttttt 10380 acaaaagttc atgttcaaat gattcttttt atgacatgtt catgttcgaa ggctacaaaa 10440 aagaatttga agaagggttt tcatgtttac aatatccgct ttagggataa attatctgat 10500 tgactcgaag actttctttg agtttgtttt ctttacttac tgtcttttgt tttccttttg 10560 gtttctttgt ttttattttc ttctctttta tgggtttggc tttggcctct tagtttttgt 10620 ttagcttttt tgttgcagag ggttttggtt catgtccccc ctctcttttt gttgttggtt 10680 tttatctata tgtctagggt gttgtagttg gttcatcatt tgcaccccat ttgcttcaaa 10740 aaaaaaggtt aaatatcccc aatttattca aatctattat tttctcatag ttttttttag 10800 caattttctc atagtttgct atacttaaaa aaaaatgtgt ataagttttg ttatttttgg 10860 atttcgaaaa actatttgaa aaagaatttt tcagtcgcca aagatactac tgggttgatc 10920 cacatactat gttgctctct accatataaa aacacaaaaa atatgtcaat tctaatggtt 10980 tctaaaaatt tgacattgag atagttttta ttagtttgtc cctagaaaaa ttttaatttt 11040 gtttctgaaa aaaattaatt aataaaatat aataaaaatt attattacaa ttaagttaaa 11100 tactagttaa aaataagaat gtcatgcaac atttttcaaa ttttctttgt gaataatatc 11160 atgtttttca gacaactcaa tatatttgtc taaagtagcc tttgtaaccc aaaaaaaaaa 11220 aaaatgtcta aaagattaac acaccattga tattgttttt ctcctaaaaa aatgacattg 11280 tctttttagt ggttaaagta aagtatcctt aatatacttc acgtttgtgc ctatatgcaa 11340 ataaacatgc ttcacgtgtt ttttagaagc tgcttgatat atacttcaac gtttgtggta 11400 tccatttgta aacttccatc gcgatggtct ccctgaaaac atggtcaact tatatatata 11460 tatatagggt ttgttaggat acacccatta gtttttatgt cggagtgttt tagcaaagat 11520 ataactaaaa aattgttaaa tacaccttaa ggtgttgcta aaacatacat tctaaaaaat 11580 aagtgggtgt atgttagcaa ctcttatagg catttgctag aatacaccca cttatttttt 11640 agaatgtgtg ttttagcaag ttataactag aaagtagtta aatgcactta aggtgtagct 11700 tgctaaaaca ctcccacata aacactagtg agtgtgttct agctaatata tatattcgtg 11760 actatatttt ttagtgacta cattgaaact gaaactttat ttaactaaaa atctctaaag 11820 atatgtttag tttttattta atacgactag gattagcagc tttagagatt tcatttcatc 11880 tcatcttcta acataaatga gtatggtagc tagatactag agtttttgga gtagctagat 11940 tacttggtga tgctttggct caccttattc atttaaggat tgtaatcttt tgacaactct 12000 atctattcta 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