spacer

EBI Dbfetch

ID   AUXG01000676; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; HUM; 3326 BP.
XX
AC   AUXG01000676;
XX
PR   Project:PRJNA213624;
XX
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Created)
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Last updated, Version 1)
XX
DE   Homo sapiens scaf01595_reg01_ctg04, whole genome shotgun sequence.
XX
KW   WGS.
XX
OS   Homo sapiens (human)
OC   Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia;
OC   Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae;
OC   Homo.
XX
RN   [1]
RP   1-3326
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   "Sequencing the RPCI-11 Genome";
RL   Unpublished.
XX
RN   [2]
RP   1-3326
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   ;
RL   Submitted (30-JUL-2013) to the INSDC.
RL   Roche, 16 Commercial St, Branford, CT 06405, USA
XX
DR   MD5; 24fd082fddd7fa70ec5e96bac700036d.
DR   ENA; AUXG010000000; SET.
DR   ENA; AUXG000000000; SET.
DR   ENA-CON; GL000184.
DR   ENA-CON; KE557429.
DR   BioSample; SAMN02258483.
XX
CC   This is a subset of the whole genome assembly of RPCI-11 containing
CC   novel regions that do not exist in the GRCh37.p11 reference
CC   assembly, GCA_000001405.12.
CC   ##Genome-Assembly-Data-START##
CC   Assembly Method       :: Newbler v. 06/07/2013
CC   Assembly Name         :: RP11_1.0_unmatched_regions
CC   Long Assembly Name    :: RP11_1.0 regions unmatched to GRCh37p11
CC   Genome Coverage       :: 39.0x
CC   Sequencing Technology :: 454; Illumina MiSeq
CC   ##Genome-Assembly-Data-END##
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..3326
FT                   /organism="Homo sapiens"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /clone_lib="RPCI-11"
FT                   /db_xref="taxon:9606"
XX
SQ   Sequence 3326 BP; 1103 A; 209 C; 1291 G; 723 T; 0 other;
     ggtgagctga gatagtgcta ctgcattcct gcccggggga caaagtgaga tattgtcgaa        60
     agaaaagtat gtgatgtaat ggagtgcaat ggaatggaat ggaatggaat ggggtgcaat       120
     ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggagt       180
     ggaatggaat ggaatggaat ggagtggaat ggtgtggagt ggagtggaat ggagtggaaa       240
     ggagtggaat ggaaggggat ggaatgcagg gtagaggagt ggattggagt gcagtggaat       300
     ggaatggaaa tgagtgaagt ggacttgagt ggagtggagt tgaataaagt ggaatagaat       360
     ggtgaaatga aaggtaagct gagattgtgc cactgcactc cagcctgtgt gacagagtga       420
     gatcctttca aaagaaagaa tggaatgtaa tggagtggaa ttgaatcgaa tggaatggaa       480
     tggagtggag aggagtggag tggaatagag tggaatggaa tggattcaaa tgaaatggaa       540
     tggaatggaa tcgagtggat tgcagtggag tggagtgttg tggaatggag tggagtggag       600
     gggagtcgtg tggaaaggag ttgaatggaa tgggatggag tggaatggaa tggaatggaa       660
     cggaatggaa tggaagggtg aagtgaaatt tgaggtgaga ttatgcctct acactccagc       720
     ctgtttgata gagtgagatc ctgtcaaaag aaaggaaagg aaaggagtgg aatggaatgg       780
     aacaaaatga aatagagggg agtggagtgg agtggactga agtggagtgg agtagagtgg       840
     aatggaatgg aaggagatgg aatattgaaa tgaaatgtga gctgaaattg tgccactgca       900
     ctccaccctg cgtgacagag tgagatcctg tcgaaagaaa gcaaaggaat ggaatggaat       960
     ggagtggaat ggaatggatt gggatttcat ggagtggagt ggagtgtggt gtagtggagt      1020
     ggagtggtat ggagtgaaat gaaatggtga aatgaaatgt gagctgagat tgtaccactg      1080
     cattcctgcc tgtgtgacag agtgaaatac tgtcgaaata aaggaatgta atgcaatgga      1140
     gtggaaggga atcaaatgga atggagtgaa atggcatgga atggcagtga gtggggtgta      1200
     gtggagtgtt gtggtgtgga atgaaatggg atggagtgga atggaatgga gtggagtgga      1260
     atggaatgga ttgggatgga atggtatgga acggagtgga gtggggtgga gtggagtgaa      1320
     gtggaatgga gtgcaatgga atggtaaaat gaagtgtgag ctcagatatt cccactgcac      1380
     tccagcctgt gtgaatgagt gaaatcattt caaaagaaaa gaattcaaag taatggactg      1440
     gaattgaatg gaatggaaca aaatagaacg gaattggatg gaatggcacg gaatggagtg      1500
     gactggagtg gattggagtg gaattaaatg ggatggagcg gagtagattg gagtggaatg      1560
     gaatggaatg gaatggaaaa gaatggaatg gaatcgagtg gaatagagtg gagaggagtg      1620
     gaatggaata gaggggagag gagtggaatg gagtgaaatg aaacgggatg taatggaaca      1680
     aattggattg gagtgttttg gaatggagtg gaatggactg gaatgacatg gagtggagtg      1740
     gagagcagtg cagtgcaatg gattggaaat aaatggaatg gaatgtaaga gaatggagca      1800
     aaatggaatg gaaaggaaag gaatggaatg gaatggagtg gagtggagag gagtggagtg      1860
     gagtggactg caatggagtg gaatagaata tgatggaatg caatggagag gagtggagtg      1920
     gagtggattg gaattccatg gaatggaaag ggattgagtg gaatagagtg gattgtgcta      1980
     gattggagtg gagtggactg gagtggaatg gagcagagtg gagtggactg gagtggagtg      2040
     gagggtaatg gaatggaatt aaatggaacg gaaaggaatg gtgaaacgaa atgtgagctg      2100
     aggttttgcc actgcactcc atcctgagtg acagagtgag atcctgttga aagaaaggaa      2160
     tggaatggaa gggagtgcag tggaatacaa tggagtggag gggagtggag tagattggcg      2220
     tggaatggag tgaaatggaa tggaatgcaa tgaggccgag tggagtggag tggagtggaa      2280
     tggaatggaa tgaagtggaa tggagtggaa tgcattgtaa tggaatgcaa tggaatgttg      2340
     aaatgaaatg cgagctgagt ttatgccacg ttactccagc cttggtgata aagtgagatc      2400
     ctgtcgaaag aacagagtgg aatggcagag agaggaatgg agtgtaatgg aatggaatgg      2460
     attgtagtgg agtggagtgg agtggagtgg actggaagag agtggaatgg aatgggattg      2520
     ggaggaatgg agtggagtgg agtggaaggg gatggaatgg aatggagtgg tgtggagtgt      2580
     agttgagtgg aatggaatgc aacggagtgg agtggagtga aatggaattt aatagaatga      2640
     aatggaatgg aattaaatgt aaaggaatgg aatgaactgg aatagaatgg aaagcaatag      2700
     aatggaatgg aacagtttaa tgaaaagtga gttgagattg gggctcggca ttccagcccg      2760
     agtgacagag tgagatccag ttgaaacaaa ggaatggaat gaaatggagt ggaatgatat      2820
     ggagtggaat ggcgtggact gatgtggagt ggagtggact ggagtgaagt ggagtggaat      2880
     gcagtggaat ggtatggtga aatgaaatgt gaggtaagat tgtgctactg aaatcaagcc      2940
     tgtgtcaaag agtgagattc tgtcgaaagt aggcaatgga atagaaagga gtttaatgga      3000
     atggaatgga atggaatgga atggaatgga atggaatgga atggaatgga atggaatgga      3060
     gtggaaaaga atggaatgga gtggaaagga aaggaatgga gtggaaagga atggtgtgga      3120
     gtggagtggt ttggaatgga gtgaaatggg atggaatgga atggaatgaa gttgattgga      3180
     gtggactgga gtggagtgga gtggaatgga gtggcgtgga acagaactga acggaatgtt      3240
     acctaatgga atacaatgtt atgcactgaa atgtaatgga atggaatgga atggttaaat      3300
     gtaaggtgag ctgagattgt gccact                                           3326
//


spacer
spacer