spacer

EBI Dbfetch

ID   AUXG01000674; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; HUM; 9131 BP.
XX
AC   AUXG01000674;
XX
PR   Project:PRJNA213624;
XX
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Created)
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Last updated, Version 1)
XX
DE   Homo sapiens scaf01595_reg01_ctg02, whole genome shotgun sequence.
XX
KW   WGS.
XX
OS   Homo sapiens (human)
OC   Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia;
OC   Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae;
OC   Homo.
XX
RN   [1]
RP   1-9131
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   "Sequencing the RPCI-11 Genome";
RL   Unpublished.
XX
RN   [2]
RP   1-9131
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   ;
RL   Submitted (30-JUL-2013) to the INSDC.
RL   Roche, 16 Commercial St, Branford, CT 06405, USA
XX
DR   MD5; 01980e360aaaccc5359a3c1870bfdb0d.
DR   ENA; AUXG010000000; SET.
DR   ENA; AUXG000000000; SET.
DR   ENA-CON; GL000184.
DR   ENA-CON; KE557429.
DR   BioSample; SAMN02258483.
XX
CC   This is a subset of the whole genome assembly of RPCI-11 containing
CC   novel regions that do not exist in the GRCh37.p11 reference
CC   assembly, GCA_000001405.12.
CC   ##Genome-Assembly-Data-START##
CC   Assembly Method       :: Newbler v. 06/07/2013
CC   Assembly Name         :: RP11_1.0_unmatched_regions
CC   Long Assembly Name    :: RP11_1.0 regions unmatched to GRCh37p11
CC   Genome Coverage       :: 39.0x
CC   Sequencing Technology :: 454; Illumina MiSeq
CC   ##Genome-Assembly-Data-END##
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..9131
FT                   /organism="Homo sapiens"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /clone_lib="RPCI-11"
FT                   /db_xref="taxon:9606"
XX
SQ   Sequence 9131 BP; 3119 A; 500 C; 3584 G; 1928 T; 0 other;
     gcagtggaaa ggaatggaaa tgagtgaagt gaacgtgagt ggagtggagt ggaataaagt        60
     ggaaaggaat gtaatggtga aatgaaatgt aagctgagat tgtgcaactg caatccagcc       120
     tgtgtgacag agtgagatcc tgtccaagga aagaattgaa tggaatggag tggaatggaa       180
     tggaatggaa tggaatggaa tggaatggaa tggaatggaa tggaatggag tagagtggag       240
     tggaacagag tgggatggaa tgggatcaaa tggaaaggaa tggaatggag tggattggag       300
     tggagtgttg tggaatggat tggagtggag tggagtcgtg tggaaaagag ttgaatggaa       360
     tgggatggag tggaatggaa tggaatggaa tggagtggaa tggaatggaa tggactggaa       420
     tgttgtggaa tggaatgaat ggaatggaat ggaatggaat ggaagggagt ggagtggagt       480
     ggaattcagt gcagttgagt ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat       540
     ggaatggaag ggagtggaga ggagttgact ggagtggagt ggagtggagg ggaatggaat       600
     ggtagggagt gaaatggaat ggagtagagt ggagtgcagt gaagtggagt ggaatgcagt       660
     ggaatgcaat ggcatagaat ggagtggagt ggagtggagt ggagtggaat ggaatagaaa       720
     ggaaaggtga aatgaaatgt gagctgaaag tgcaacactg cactacagcc agtgtgacag       780
     agtgagattt tctcgacaga aagtaatgga atggaatgga atggaatgca atggaatgga       840
     atggaatgga atggagtgga gtagagtgga gtggagtagt gtggatttga gtggaatggc       900
     ttggaatggg atgagaggga atgcaataga gtggagtgga gtggaattga atgggatgga       960
     atgggatgga gtgtagagta gtggagtaga gtgaagtgga atggaatgga atgaaatgca      1020
     gcagattgga atggaatggt atggaatagt atggaattga atggaatgca atgtaaggga      1080
     atgatgaaat taaatgtgag ctgatattgt gccactgctc tataggctgg gtgacagaat      1140
     gagatcctgt cgaaagaaag gaatggaatg gataggagtg ggatgaaatg gaatgtaact      1200
     gaatggagtg gactggagtg aagtggaatg gagtggaatg gaagggaatt gagtggagtg      1260
     gagtggaatg gaatggaatg gtgaaatgaa atatgaactt aagttttgcc actgcacttt      1320
     aacctgtgtg agagagtgag atcctgtcga aagaaaggaa cggaatggaa tggagtggag      1380
     cggattggaa tggaaatgaa cggagtgcag tggagtggag tggaatggag cagagtggaa      1440
     tggaatggaa tgaagtggaa tggaatggaa tagaatggaa aggtgaaatg aaatgcgatc      1500
     tgagattgtt ccactgcact gcaagcaggg tgagagaatg agatcctggt gaaagaaagg      1560
     aatggaattc aatggagtgt aatggaatgg agtggagtga agtcaagtgg acagaagtgg      1620
     agtagagtgg agtggagggg aatgaagtgg aatacaatgg gatggagggg attggaatgg      1680
     agtggagagt agtggagtgc agcggagtca agtggagtgc agcggagtgg acaagagtgg      1740
     aaaggaatag gaaggaatgg aatggaatgg aatggaatgg aatggaatgg aatggagtgg      1800
     aatgtattgg agttgaatgg aatgtagtgg aatggaattg aatgaaatgg aatggaatgc      1860
     aatacaatta atggaatgca acggaatgta atggaataga actgtgaaat gaaatgtgag      1920
     atgagattgt gccactgcac tccagcatgg gtgagggagt gagattctgt cgaaagaaag      1980
     gaatggaatg taagggagtg gaatggaatg gattggagtg gagtggagag gagtgtaatg      2040
     gagtggagtt gaatggaatg gaatggaatg gaaaagagtg gaaaggaatg gaatgaaatg      2100
     gaatggaatg aaatgcaatg gaatacaatg gaatggtata gaatgtaatg gaatgcaacg      2160
     gaatgcaatg gaacggaata ccatggaatg gagtgcaatg gaatgcaatg gaatagcatg      2220
     gtgaaatgta atctgagctc agattgtgcc actacactcc agcctgggtg agagaaagag      2280
     atcctttcaa aagaaaggaa tcaaatggaa ggtgtggaat ggaatggaag tgagtggaat      2340
     ggaatggaat ggaatgggat agaatggagc agagtggagt tgactggagt ggaatggatt      2400
     ggaatggaat gggatggagt ggaatggagt ggactggagt ggagtggagt ggagtggaat      2460
     ggagtggagt ggcatggaat tggatggaat ggaatggagt agattggagt ggattggagt      2520
     ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggagtggaat      2580
     ggtgaaacga aatacgagct gatattggtc actgcagtgc agtctttgtg acagagtgag      2640
     atcctctcga aagaaaggaa tggaatggag tggaatgtaa tgtaatggaa ttaaatggag      2700
     tggaatggag tgaaatggaa tggaatggac tggagtggag tgaagtggag tgcagtagag      2760
     tagaatggaa tggaatggaa aggaatggaa tggaatgcaa tggtaaaatg aaatgtgagc      2820
     agagattgtg tcattacact ccagcctggt tgagtgtgag atgctgttga aaggaacaga      2880
     tggaatgtaa taaaatggaa tggaaggaaa tggaaaggaa tggattggag aggagtacag      2940
     tggagtttag tggagcagag tggagaggag tggaatggag tgaaatggga cggcatggaa      3000
     tggaatgaag tggagtagag tttagtggaa tggagtggaa tggaatgaaa tggagtggag      3060
     tggaatggaa tggaatggcg tggagtggat tgcaattaaa tggaaggcaa tgaaaggaaa      3120
     tgcaatggaa tagtgaaatg aaatgtgagt tgaaattgtg ccactgcact ccagcctgag      3180
     ggacagagtg agatactttt gaaaaaaagg aatggaatgt aatagagtgg aatggattgt      3240
     aatgaagtgg agatgagttg actggagtgg agtgcattgg aggggaatgg aatggtaggg      3300
     agtggaatgg aatggagtgg agtggactgc agtgaagtgg agtggaatgg agtggaatgc      3360
     aatgggatgg aatggagtgg agtggagtgg agtggaaagg agtggaaaga aatgctgaaa      3420
     tgaaatgtga gctgaaagtg caacactgca ctacagccag tgtgagagtg agattttctg      3480
     gacagaaagt aatggaatgg aatggaaagg aatggaatgg aatggagtgg agtggaatgg      3540
     aatggagtgg agtggaatag aatggaatgg aatgaaatgg aatggaattg agtggagttg      3600
     tgtggagtgg agtgctgtgc atttcagtcg aatggcgtgg aatgggatgg gagggaacgc      3660
     agttgagtat actggagtgg agtggattgg aattgaatgg gatggaatgg gatggagtat      3720
     agaatagtgg agtagagtgg agtgtaatag agtggaatgg aatggaatgt aacggaatgt      3780
     agtggaaagg aggggaatgg agtgaagtgg agaggaatgg agtgtaatga agtggaatgt      3840
     aatgaagtag agtggaatgg actgcaacgc aacggaatgg aacggaatgg aaatatctag      3900
     agcagagtgg agtatagtgg agttcagaag agtggatcgg agtgcagtgg aatggaatga      3960
     aatggaatgg aatggaatgg aatggaatgg aatggaatgg aatggaatgg aaagaaatgc      4020
     tatggttaat gaaatgtgag ctaagattgg gacacgacac tgcagtctgt gtgagagagt      4080
     gagattccgt ccaaataaag gaatgaaatg gaatggagta gaatggaatg gagtgaagag      4140
     gagtggaatg gttaatgaaa tgtgagctaa gattgggcca ctgcattccg ttctcgttgt      4200
     cagagtgaga tcccatcaaa ataaaggaat ggaatggaat gtagtagaat ggaatggaat      4260
     ggagtggagt gctatggaat gaagtggaat ggagtggagt ggagtggcat ggagtgcagt      4320
     ggaatggagt gcagtggaat ggagtagaat ggagcagaat ggaaaggcat ggaatgcagt      4380
     ggaatggaat ggaatggagt gaaatggagt ggagtggaat tgagtggact ggaatggaat      4440
     gcaactgaac gaaacggaac agaatggcat agaatggagc gaagtggagt ggaggagagt      4500
     ggactggagt ttagtggagt gcatcagagt gcagtggaat gcaatgcaaa ggaaaggaaa      4560
     cgaatggaat ggagtggagt agaatggcgt ggaatggaat ggaaggaaat ggagtggagt      4620
     ggagtggaat ggaatggagt ggcgtggaat ggaatggaaa ggaatggaaa ataatttaat      4680
     ggaaaggaac ggaatggaat ggaatagaat ggattcgaat gcataggaat ggaatcgaat      4740
     ggtgaaaaga aatgtgagct acgactgtgc cactgcactc cagtctgggt gacagaaaga      4800
     tatccaatca aaataacgga atgaaacgga aaggagtgga atggaatgga atggagtgga      4860
     gtggaatgga atggagtaca atggagtgga aaggagtgga atggagtgga aaggagtgga      4920
     atggagtaga atggagtgga atggaatgga atggaatgga gtggaatgga atggagtgga      4980
     atgaagtgga ttggagtgga atggagatga gtggaatgga gtggagtgca atggagtgga      5040
     atggagtgga gtggaacgga gtggaatggc gtggaaagaa tggaatggaa tgtaacggaa      5100
     tggaatggaa gggattggaa tggaattgag acaagtggag tggattgaag tggataggaa      5160
     tggacagaaa tggagtgcag tggaatggag gggggtggaa tggaattgag tggaatagaa      5220
     tggaagagaa cagaatggaa tggaatggaa cggaatggag tcgagtggag tggagttgag      5280
     acgaaatgat cggagtgcag tggaatggaa ttgaatggaa tatggtggag tggattggag      5340
     tagagtggag aggaatggaa aggaaaggaa tgcaatggag tggactggag tggtgtgaag      5400
     tggagttgag tgcaatggag tggagtggag tggaatagag tggaatggaa tggattggat      5460
     tgcaatagaa tggagtggaa tgcaatggaa gggaatggaa cagaatggaa ttgaatggat      5520
     caaacgttgt ggagtggagt gcagtggggt gggtttgagt tgaggggatc cgagagcatt      5580
     ggaatggaat ggagtcgaat ggagtggaat gcaatgcaat ggtatggaat ggaatggatt      5640
     ggaatgcaaa aattggaatc gaacggtgaa aagaaacgtg agctatgatt gtgccactgt      5700
     actccattct gggtgacaga gtgagatcca ggcaaaataa tggaatggaa tggaatggaa      5760
     tggaatggaa tggaatggaa tggaatggag ttgaatggaa tggaatggaa tggaatggag      5820
     tgcactggaa tggagtggag ttcaacggaa tggagaggat tggaaaggag tgtagtggca      5880
     tggagtggcg tggaatgaag ttgaatgaag tgtaatggaa tgcaatggaa tggagtttaa      5940
     ttcaaaggaa ttgagtggag gggagtggag tggaatacag tggaatgcag tggagtggaa      6000
     tggagtggag tggaatggag tggaacggaa tggaatggaa ttgagtggaa tggaaatgaa      6060
     tggagtgtaa tagaatggag tggagtggag tggatggtag tggagtggat tggaatggat      6120
     tgaagtggaa tggagtgaaa tggaatgaag tggaatggag tggcgtgtaa tagaatggag      6180
     tggaatggaa tggaaaggat cggaacagaa aggaaaggaa tggaaaggtg tagagtagtg      6240
     tggagaggag tagattagag tggatcatag tgcagtggaa tagaatggaa tagaattgaa      6300
     tggaatggag tggagtggag gggagtttag tgcacttgag tggaatggac tgaggtggaa      6360
     tggagtggtg tagggtggaa tggagtggaa tggaatcgag tggaatggaa tgaagtggaa      6420
     tagagaggaa tggaattcag tggaatggag tggaatcgat ttgaaaggaa tttaatgaaa      6480
     tggagtggaa tggaatggaa tggagtgcaa tgaagtggag tgaaatggaa aagaatggaa      6540
     cgaaacggaa cggaatacaa tggagtggag aggagtggag tggagtggat ttgagtggag      6600
     tggattggag ttcagtggta tggaacggaa tggaatggaa tggaatggag tggagtggac      6660
     tggagtggaa tggagtcgag tgcattggaa taaaatgaag aggagtgaat tggaatggaa      6720
     tggagtggaa tggagtggag gggaagggag tggagtggcg tggaatggaa tgcaatggag      6780
     tggagttgaa tggagaggaa tggcctggaa tggaatgaaa tggaatggaa tggatctgaa      6840
     cagaacaaag tggagtggag tggagtggaa tggagttgag tggagatgat cagagtgcag      6900
     tggaatggaa tggaagggaa cggaattgat ggaagggaat ggaatggaat gcattggaat      6960
     ggaatggaat gcaacggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggact      7020
     agtgaaatga aatgtcggct aagaatgtgc ctctgcattc cagtccaagt gataaagtga      7080
     gatccagtcg aaataaagga atggaatgat ttgtagtaga attgaatgga atggagtata      7140
     gtggaataaa atggagtgca gtggagtgga atggaaggag tgtaatgaag tggattggaa      7200
     tggagtggaa tggacgggaa tggcatggaa tgcagtgtaa atgaatggat tggaatagag      7260
     gggaggaagc gaatttagtg gagtggaatg gagtggagtg gaatgcagtg gaacagagtg      7320
     gaatggaatg gaatggaata gagtggaatg gaatggaatg gaatggagtg gaatgaaatg      7380
     gagtggaatg gaatggaaca gaatggaaag gaatgaaacg gaatggaatg gaatcgaatg      7440
     gagtggaatg gaatgggata aaatggaata gagtgaagag gatttgagtg gagtggggtt      7500
     gtgtggaatg gagtggaatg gaatggaatg caacagaatg gaatggaatg gaatggaatg      7560
     gaatggaata gggaaatgaa atgtcgacta agaatgtccc tctgcattcc agtccaagcg      7620
     ataaagtgag atccagtcga aataaaggaa tggaatgatt tgtagtagaa ttgaatggaa      7680
     tgaagtatag tggaataaaa tggagtgcag tggagtggaa tggagggagt gtaatgaagt      7740
     ggattgcaat ggagtggaat cgaggggaat ggcatggaat gcagtttata tgaatggatt      7800
     ggagtagagg ggaggaagcg aattgagtgg agtggaatgg agtggagttg aatgcagtgg      7860
     aacagaatgg aatggaatag agtggaatgg aatggaatgg agtggaatga aatggagtgg      7920
     aatggaatgg aacagaatgg aaaggaatgg aatggaatgg aatggaatca aatggagtgg      7980
     aatggaatgg gatgaaatgg aacagagtga agaggatttg agtggagtgc agttgtgtgg      8040
     aatggagtgg aatggaatgg aatggaacag agtgaagtcg agcggagtgg actggagtgg      8100
     agtggaatgg agtgcagtgc agttgattgg aacggaatgg aacggaacaa aagggaatgg      8160
     aatggaatgc aatggttaaa tgaaatgtga gctgagattg tgccactgta ttccagcctg      8220
     gttgatagag tgagatcctg tcgaaagaaa tgaaagtaat gtaatggtgt gtattggaat      8280
     tgaatggaat ggaatggagt ggagtggagt ggagtggagt ggagtggagt ggagtggagt      8340
     ggagtggaat gtgatggaat ggaaaggcac agaatggaga gaagtggagt gaagtgtgtt      8400
     ggaaaggagg ggaatggaat tggatggaat ggagaagaga ggagtggagt ggagggcagt      8460
     ggaatggaat ggaatggagt ggagtggact tgagtagagt gtagtggaat tgagtggaat      8520
     cgaatggaat ggaatggtga aatgaaatgt gagctaagat tgggccactg cactccagcc      8580
     tgtgacagag taagatcttg ttgaaagaaa gaatggaaag gaatggagag aaatgctatg      8640
     gaatggaatt gaatcgagtg gactgaagtg gaatgtaacg gagtggaatg gaattggttg      8700
     gaatggaatg caatgaagtg gagtggagtg gtgtggaatg aaatggagtg gagtggagtg      8760
     gtttggaata gagtggaatg gaatgggatg cagtggaatg gaatggaatg gaatggaatg      8820
     gaatagaatg tagtggagtg cagtgcagtt gagtggaatg gaatggaatg gaatggaatg      8880
     gaagggaatg gaatggcgaa atgaaacctg agctgagatt gtgccactgc actccagtct      8940
     gcatgacaga gtgagatgtt gtcgaaagga aggaatggaa tggaatggag tggaatggaa      9000
     tggaatggag tggagtggaa tggaatggaa tggaatggaa tggaatggaa tggaatggaa      9060
     tggaatggaa tggaatggag tggaatggaa tggagtggag tggataggag tgtagttcag      9120
     tactgtagag t                                                           9131
//


spacer
spacer