spacer

EBI Dbfetch

ID   AUXG01000673; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; HUM; 2290 BP.
XX
AC   AUXG01000673;
XX
PR   Project:PRJNA213624;
XX
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Created)
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Last updated, Version 1)
XX
DE   Homo sapiens scaf01595_reg01_ctg01, whole genome shotgun sequence.
XX
KW   WGS.
XX
OS   Homo sapiens (human)
OC   Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia;
OC   Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae;
OC   Homo.
XX
RN   [1]
RP   1-2290
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   "Sequencing the RPCI-11 Genome";
RL   Unpublished.
XX
RN   [2]
RP   1-2290
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   ;
RL   Submitted (30-JUL-2013) to the INSDC.
RL   Roche, 16 Commercial St, Branford, CT 06405, USA
XX
DR   MD5; 236cb1013a5ec19201dcf7f2752f9450.
DR   ENA; AUXG010000000; SET.
DR   ENA; AUXG000000000; SET.
DR   ENA-CON; GL000184.
DR   ENA-CON; KE557429.
DR   BioSample; SAMN02258483.
XX
CC   This is a subset of the whole genome assembly of RPCI-11 containing
CC   novel regions that do not exist in the GRCh37.p11 reference
CC   assembly, GCA_000001405.12.
CC   ##Genome-Assembly-Data-START##
CC   Assembly Method       :: Newbler v. 06/07/2013
CC   Assembly Name         :: RP11_1.0_unmatched_regions
CC   Long Assembly Name    :: RP11_1.0 regions unmatched to GRCh37p11
CC   Genome Coverage       :: 39.0x
CC   Sequencing Technology :: 454; Illumina MiSeq
CC   ##Genome-Assembly-Data-END##
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..2290
FT                   /organism="Homo sapiens"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /clone_lib="RPCI-11"
FT                   /db_xref="taxon:9606"
XX
SQ   Sequence 2290 BP; 775 A; 139 C; 867 G; 509 T; 0 other;
     tgtgtgactg agggagatca tttaaaaaga aacgaaatga atggaatgga caggaatgga        60
     ttggaattga acggaataga atggaattgg atggaatggc atggaatgga gtggagtgga       120
     gtggtgtgga gtggagtgga atgaaatgga atggaatgga atggagtgaa ttggattgag       180
     tggagtggaa tagaatggaa ttgaatggaa tggaatagaa agttcagttg agtggattgg       240
     agtggagtgg aatggaattg aatggaatgg aatgtgatgt aaggaaatgg aattgagtag       300
     attggagtgg agtggagtgg aatggagtag gacagaatgg gatgtaatgt agtggagttg       360
     aaaggagtgg agtgaagtgg agtggaatgg aaagcaatgg agtggagatg agtggaatgg       420
     agtataatgg aatggaatgg aaaggaattg aatggaatgg aatagaatgg aatggaatgc       480
     aacggaacgg aagggtgaag tgaaatttga ggtgaaattg tgccactaca ctccagcctg       540
     tttgatagag tgagatcctg tcaaaagaaa ggaaacttat ggaaaggagt ggagtggaat       600
     gtaacggaat gaaatagagt ggagtggagt ggagtagagt gaaatggaat ggaatgagat       660
     ggaatattga aatgaaatgt cagctgagat tgtgccactg cactccaccc tgcgtgacag       720
     agtgagatcc tgtcgaaaga aaacaaagaa tggaatggaa tggagtggaa tggaatggat       780
     tgggatttaa tggagtggag tggagtggag ggtgctgtgg tgtggtggaa tggagtggaa       840
     tggagtgaaa tgaaacggtg aaatgaaatg tgagctgata ttgtgccact gcactcctgc       900
     ctgtgtgaca gagtgagata ctgtcgaaat aaaggaatgg aatgcaatgg agtggaatgg       960
     aatctaatgg aatggaatgg aatggagaga aatgggatgg aatggcaggg agtgtagtgt      1020
     agtggagtgt agtggtgtgg aatcaaatgg gatggagtgg aatggaatgg attgggattt      1080
     aatggagtgg agtggggtgg agtggagtgg agtggaatgg agtgcaatgg aatggtgaaa      1140
     tgaagtgtga gctcatatat tcccactgca ctccagcctg tgtgaatgag tgaaatcatt      1200
     tcaaaagaaa agaattcaaa gtaatggact agaattgaat ggaatggaac aaaatagaac      1260
     ggaattggat agaatggcac ggaatggagt ggactggagt ggaatggagt ggaattaaat      1320
     gggatggagt ggaatggaat ggattggagt gcagtggatt ggagtggaat ggaattgaat      1380
     ggaatggaaa agaatgaaat ggaatcgagt ggaatagcgt ggagaggagt ggaatggagt      1440
     agagtggaga ggagtggaat ggagtgaaat gaaacgggat gtaatggaac aaattggatt      1500
     ggagtgtagt ggaatggagt ggaatggact ggaatgtaat ggaatggaat gacatggagt      1560
     ggagtggaga ggagtgcagt gcaatgtatt gggaataaat ggaatgtaat gtaagagaat      1620
     ggagcaaaat ggaatggaaa ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggagaggagt      1680
     ggagtggagt ggactgcaat ggagtggaat agaatatgat ggaatgcaat ggagaggagt      1740
     ggagtggagt ggattggaat tccatggaat ggaaagggat tgagtggaat agagtggatt      1800
     gtactagatt ggagtggagt ggactggagt gtaattgggc agagtggagt ggactggaat      1860
     ggagtggagg gtaatggaat ggaattaaat ggaatggaaa ggaatggtga aacgaaatgt      1920
     gagctgaggt tttgccactg cactccatcc tgggtgacag agtgagatcc tgttgaaaga      1980
     aaggaatggc atggaaggga gtggaatgga atacaatgga gtggagggga gtggagtaga      2040
     ttggcgtgga atggagtgaa atggaatgga atggaatgag gcagagtgga gtggagtgga      2100
     gtggaatgga atggaatgaa atggaatgga gtggaatgca ttgtaatgga atgcaatgga      2160
     atgttgaaat gaaatgcgag ctgagattat gccacgttac tccagccttg gtgataaagt      2220
     gagatcctgt cgaaagaaca gagtggaatg gcaaagagag gaatggagtg taatggaatg      2280
     gaatggattg                                                             2290
//


spacer
spacer