spacer

EBI Dbfetch

ID   AUXG01000405; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; HUM; 5816 BP.
XX
AC   AUXG01000405;
XX
PR   Project:PRJNA213624;
XX
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Created)
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Last updated, Version 1)
XX
DE   Homo sapiens scaf00972_reg01_ctg15, whole genome shotgun sequence.
XX
KW   WGS.
XX
OS   Homo sapiens (human)
OC   Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia;
OC   Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae;
OC   Homo.
XX
RN   [1]
RP   1-5816
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   "Sequencing the RPCI-11 Genome";
RL   Unpublished.
XX
RN   [2]
RP   1-5816
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   ;
RL   Submitted (30-JUL-2013) to the INSDC.
RL   Roche, 16 Commercial St, Branford, CT 06405, USA
XX
DR   MD5; 1b41d283a8651048382821dbc10c9f77.
DR   ENA; AUXG010000000; SET.
DR   ENA; AUXG000000000; SET.
DR   ENA-CON; KE557395.
DR   ENA-CON; KI270730.
DR   BioSample; SAMN02258483.
XX
CC   This is a subset of the whole genome assembly of RPCI-11 containing
CC   novel regions that do not exist in the GRCh37.p11 reference
CC   assembly, GCA_000001405.12.
CC   ##Genome-Assembly-Data-START##
CC   Assembly Method       :: Newbler v. 06/07/2013
CC   Assembly Name         :: RP11_1.0_unmatched_regions
CC   Long Assembly Name    :: RP11_1.0 regions unmatched to GRCh37p11
CC   Genome Coverage       :: 39.0x
CC   Sequencing Technology :: 454; Illumina MiSeq
CC   ##Genome-Assembly-Data-END##
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..5816
FT                   /organism="Homo sapiens"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /clone_lib="RPCI-11"
FT                   /db_xref="taxon:9606"
XX
SQ   Sequence 5816 BP; 1971 A; 271 C; 2319 G; 1255 T; 0 other;
     tggaatggaa tggaatggaa tggagtggaa tggaatggaa tggaatggag tggaatggaa        60
     tggaatggaa ttgaatggaa tggaatgcaa tggaatggaa tggaactgaa tggaatagaa       120
     cggaatcgaa tcgaatcgaa ctgactcaaa tcaaatcgaa ttgaatcaaa tggaacaaaa       180
     tagaattgaa tggaattgaa tagaacaaat ggaatcgaaa tgaatcgaat ggaattgaat       240
     cgaatggaat cgaatggcat ggaattgaat caaatggaat gtggtgaaaa ggagtggagt       300
     ggagtggaaa ggattggaat gaaagggggt ggaatggaat tgaacggagt ggagtgcagt       360
     ggagtggatt tgagtggagt ggaatggaat gggaaggaat ggaattgaat ggagtggagt       420
     ggaatggaat gagtggagtg gaatggaatg gaatggaatg gaaaggaatc aaatggaatg       480
     gaattgaatg gaatcaaatg gaatcgaatg gaatcaaatg gaagcaaatg gttttgaatc       540
     gaatcgaatc aaatggaatc gagtggaatc aaatgggata gaatgaaatc aaatggaaaa       600
     aatggaattg aatggaatca aaaggaatcg attcgaatgg aatcgagtgg catcgaacag       660
     aaccgaatgg aatgcgatga aatgtactgg agtggagtgg aatggagtgg aaaggaatgg       720
     ggtggaatgg aattgaatgg agttgagagg agtagaatat attggaatga aatggaatgg       780
     gaaggaatgg atttgaacgg agtggagtgg agtggagaat ggaatggaat ggaatggaat       840
     ggaatggaat ggaatttaat ggaatggaat ggaatggtga aatgaaaggt gagctgagat       900
     tgtgcactgc actccagcca gggtgacaga gtgagatcat ttcgaaagaa aggaatggaa       960
     tggaatggat ttagaatgga atgtaatgga atgtagtgga gggaattgga gtggctggag      1020
     gtggagtgga gtggagtgaa atggagtgga atgtattgtt atggaatgga atggaatgga      1080
     gtggagtgga gtgggatgaa gtgaagtgga atggagtgga atgtattgtt atggaatgga      1140
     atggtgtgga gtggagtgaa gtggagtggg atgaagtgga gtggaatgga gtgcaatgga      1200
     atgggatgga acagaaagga gtagagtgta gtggtgtgga gtgcaaaggt gtagaatgga      1260
     atggattgga aaggagtgga gtggagttga gtggagtgga atggaatgga atggtgtgga      1320
     gaggagtaga atggagtgga gtggagtgca gtggagtgaa gtgacttgga atggaatgga      1380
     gtgcagtgga atggaatgga gtggagtgga atgcactgga ggggatggaa ttaactggag      1440
     tagaatggaa tggactgtaa tggaatgaaa acgaatggag tggagtggaa tggagtggag      1500
     tggagtctta tggtgtggaa tggaatgcaa tgttgtggag tggaggagag tggagtggag      1560
     tggactggag tgtaggggaa gagagtggaa tggaatggag aggagtggag tggaatggag      1620
     ggggtggaat ggagtggagt ggagtggttt ggattgcaat ggaatggaat ggaatggaat      1680
     gaagtggagt ggaatggaga ggaatggaat ggaatggaat gcaatgcaat gcaatggaat      1740
     ggaagggaat ggagtggaat ggaatggaat ggattggaat cgaacggaat gtaatggaat      1800
     cgaatggaat ggaatcgaat gaaatcaaaa gaatggaata gaattgaatg gaacggaatc      1860
     gaatagcatc gaatggaatc gaatggaatg cggtgaagtg gagtggagtg gaatggagtg      1920
     gaatggaatg gggtggaatg gaattgaatg gagcagagtg gattggggtg gaatggagtg      1980
     gagtggaatg aaatgggaag gaatggaatt gaacggagtg gagtggagtg gaatggaatg      2040
     caatggaatg gaatggaatg gaatgttgaa ttgtgagctg agatggtgta ctgcactaca      2100
     gcctgagtga cagagtgaga tccttttgaa agaaaggaag ggaatggaat ggatttagaa      2160
     tggaatgtaa tggaatggat ttagaatgga atagaatgga atggagtgga gtggattgga      2220
     gttgagtgga gtggaatgga gtggaatgga atggagtgga gtggaatgga atggactgga      2280
     atggagtgca atggagtgga gtggaatgga atggaatgga gtggattgga gtggagtgga      2340
     ttggaatgga gtggaatgga ttgtaatgga atggaatgga atggagtgga atagagtgga      2400
     gtggagtgga atggagtgga gtggaatgga gtggaatgga gtgaagtaga gtggagtgga      2460
     gtggagtgga atgaagtgat gtggaatgaa gtggaaggga atggaacgga atggaatgga      2520
     atggattgga atcaaatgga acggaatgga accgaatgga atggaatcga atgaaatcaa      2580
     acggaatgga atggaatcga atggcatcga atggaattga atggaatgag gtgaagtgga      2640
     gtggagtgga atggagagga atggaatggg gtggaatgga attgaatgga gcagagtgga      2700
     gtggggtgga atggagtgga gtgaaataaa gtgggaagga gtggaattga acagagtgga      2760
     gtggagtgga gtggaatgga atacaatgga atgtaatgca atggaatgga atggaatggt      2820
     gaaatcaaat gtgaggtgag attttgctct gcactccagc ctgagtgaca gagtgagatc      2880
     ctttcgaaag aaaggaaagg aatggcatgg atttagaatg gaatggaatg gaatggaatg      2940
     gtgtggattg gagtggagtg gagttcagcg gagttgaatg gagtggaatg gaatggagtg      3000
     gagtggaatg gaatgggctg caacggagtg gaatggaatg gaatggagtg gagtggagtg      3060
     gaatggaatg gagtggagtg gaatgaaatg aagtggaata taatggaatg gagtggaatg      3120
     gaattgaatg gaatcgagtg agatggagtg gagtggagtg gagtggaatg gagtggagtg      3180
     gaatggactg gaatggagtg gagtcgagtg gaatggagtg gagtggaatg gagtggaatg      3240
     taatggaagg gaatggaatg gaatcgaatc gaatggaaca gaattcaatg gaatggaatg      3300
     gaatggaatg gaatggaatg gaatggaatg gaatcgaatg gaatggaatc aaatggcatc      3360
     aaatggattc gaatgaaatg tggtgaagtg gagtggagtg gagtggaatg gagtcaaaag      3420
     gaatggagtg gaatggaatt gaatgaagta gagtgcagtt gagtggaatg gagtagagtg      3480
     gaatgcactg ggaaggaatg gaattgaacg gagtggagtg gagtggagtg gaatggaatg      3540
     caatggaatg gaatggaatt taatggaatg gaatagaatg gtgaaatgaa atgtgagctc      3600
     acattgtgca ctgaactcca acctgggtga cacagtgaga tgctgttgaa agaaaggaat      3660
     agaatagaat ggatttagaa tggaatgtaa tggaatggag tggagtgggg tggagtggat      3720
     tggtgtggag tggaatggag tggttttgat agttatgcaa tggaatggaa tggagtgcag      3780
     tggagtggcg tggagtggag tggaatcgag tggaatggaa tgggatggaa tggaacagag      3840
     tagagtggag tggagtggag tggaaaggtg tagaaagaaa tggaatggaa tagagaggag      3900
     tggagtggag ggtagttgag tggagtggat tggagtgcag tgaaatggag tgaaatggag      3960
     tggtgtggaa tgcagtggac tggagtggag tggagtggag tcaagtggaa aggtgtagaa      4020
     tggaatggaa tggaaaggag aggaggggag tggagtggat ttgagtggaa tggatggtag      4080
     tgcagtggaa tggagtggag tggaatggag tagagtgtag tggagtagag ttgagttgag      4140
     tggaatggaa tagaacgaaa tggaatggag tggaatggaa tggaatggaa tgccatggaa      4200
     tggaatcgaa aggaatggaa ttgaacggaa ttgaatggat tcaaatgcaa tggaaggaaa      4260
     atgaatggaa tggaatcgaa tggaatgcgg tgaaatggaa tggagtggag ttgaatggag      4320
     tggaatgaaa agggatggaa tggaaatgaa tggagtggag tggaacggag tagaatggag      4380
     tggagtggaa tggaatggga aggaatggaa ttgaacggag gggagtggag tggggtggaa      4440
     tgaaatgcaa tggaacagaa ttgaatagaa tggtgaaatg aaatgtgagc tgagattgca      4500
     cactgcactc cagcctgggt gagacagtga gatcctgttg aaagaaagga agggaatgga      4560
     atggattcag aatggaatat aatggaatgg atttagaatg gaatgtaacg gaatggagtg      4620
     cagtggagtg cagtggaatg gactggagtg gagtggaacg gaatggtatg gattgttatg      4680
     gaatggaatg caatggagtg gaacggagtg ctgtggggta gagtggagtg gaatggaatg      4740
     gagtggaatg gaatggaatg ggatggaaag gaatggagag gagtggagtg gagtggaaat      4800
     gtgtagaatg gaatggaatg gagtggagtg gaatggagtg gagtggagtg gagtagagtg      4860
     gagtttagtg aaatggagtg gaatggagtg gagtggattg gaatgaaagg gaatggagtg      4920
     gagtggagtg gagtggtgtg gaatggagtg gactggaatg gaattgagtg gagtggaatg      4980
     gagtggagtg gagtggaatg gaatgaaatg caatggattg gaatggaaag gaattgaatg      5040
     caatggaatg gaatggcatg gaatggtgaa atgaaatgtg agctgagatt gtgcactgca      5100
     ctccagcctg ggtgagagag tgagatcctg tcgaaagaaa ggaatgctat ggaatggatt      5160
     tagaaagaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaattgagt      5220
     ggaatggagt ggagtggaat ggaatggtgt ggagtggaat ggaatggaat ggaatcgaat      5280
     ggaatcgaat caaatcgaat cgaatcaaat tgaatggaat cgagtcaaat ggaatctaat      5340
     gtaattgaat ggaatcgaat ggaaaaatgg attcgaatgg aatcgaatca aatggaatcg      5400
     aatggcatca aatggaatca aatggcatca aatggaatcg aatggaatgc tgtgaagtgg      5460
     aatggagtgg agtggaatgg agtggaatgg aatggggtag aatggaattc aatggagtgg      5520
     agtggagtgg aatggaatcg aatggaatga aatgggaagg aatggaattg accggagtgg      5580
     agtggagtgg agtggaatgg aatgcaatgg aatggaatgg aatggaatgg tgaaatgaaa      5640
     tgtgagctga gattgtgcac tgcactccag cctgggtgac agagcgagat tccatcgaaa      5700
     gaaaggaatg gaatggaatg gatttacaat ggaatgtatt gtaatggagt ggagtggagt      5760
     ggcgtggagt ggagtggagt ggaattgagt ggtatagatt gttatggaat ggaatg          5816
//


spacer
spacer