spacer

EBI Dbfetch

ID   AUXG01000284; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; HUM; 10817 BP.
XX
AC   AUXG01000284;
XX
PR   Project:PRJNA213624;
XX
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Created)
DT   01-AUG-2013 (Rel. 117, Last updated, Version 1)
XX
DE   Homo sapiens scaf00753_reg02_ctg03, whole genome shotgun sequence.
XX
KW   WGS.
XX
OS   Homo sapiens (human)
OC   Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia;
OC   Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae;
OC   Homo.
XX
RN   [1]
RP   1-10817
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   "Sequencing the RPCI-11 Genome";
RL   Unpublished.
XX
RN   [2]
RP   1-10817
RA   Knight J., DeJong P., Ratan A., Kim H., Miller W., Sisco D., LaRochelle W.,
RA   Schuster S.;
RT   ;
RL   Submitted (30-JUL-2013) to the INSDC.
RL   Roche, 16 Commercial St, Branford, CT 06405, USA
XX
DR   MD5; 0af624a2e63662c3a1fce176aa6936bb.
DR   ENA; AUXG010000000; SET.
DR   ENA; AUXG000000000; SET.
DR   ENA-CON; KI270738.
DR   ENA-CON; KE557382.
DR   BioSample; SAMN02258483.
XX
CC   This is a subset of the whole genome assembly of RPCI-11 containing
CC   novel regions that do not exist in the GRCh37.p11 reference
CC   assembly, GCA_000001405.12.
CC   ##Genome-Assembly-Data-START##
CC   Assembly Method       :: Newbler v. 06/07/2013
CC   Assembly Name         :: RP11_1.0_unmatched_regions
CC   Long Assembly Name    :: RP11_1.0 regions unmatched to GRCh37p11
CC   Genome Coverage       :: 39.0x
CC   Sequencing Technology :: 454; Illumina MiSeq
CC   ##Genome-Assembly-Data-END##
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..10817
FT                   /organism="Homo sapiens"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /clone_lib="RPCI-11"
FT                   /db_xref="taxon:9606"
XX
SQ   Sequence 10817 BP; 4354 A; 1494 C; 2374 G; 2595 T; 0 other;
     tcacatggaa tcatcaacga atggaatcga atcgaatcat caacgaatgg aatcgagtgg        60
     aatcatcgaa tggaatccca tgtaatcatc atcgaattga acccaatgga atcattacat       120
     ggactcgaaa tgaatcatca aatggactca aatggaatca tcattgaatg gaatagaatg       180
     gaataatcga acggaaacga atggaatcat catggaatga aatcaaatgg aatcatcgta       240
     tggactcgaa tggaatcatc attgaaagga atcgaatgga atcatcgaat ggtctcaaat       300
     ggaatcatca tcgaatggaa tcaaaaggaa tcttcgaatg gacttcaatg gaatgattga       360
     atggactcta atggaatctt catcgaatgg aattcaatgg aatcatcaaa tggacactaa       420
     tggaatcacc atcgaatgga atcgaatgaa atcatcgaat ggaatcaaat agaatcttca       480
     ttgaatagaa tcgaatggaa ccgtcatcga atgggatctg atgatatcat catcgaatgg       540
     aatctaatgg agtcatcatc taatggaatt gaatagaatc agcaaggaag ggaatcgaat       600
     ggagaaatcg aatggaatcc gttggaatca tcatcgaatg gaaccgaatg cagtcatcag       660
     agaatggaat caaatggaat caaagaaggg actcgaatgg aaccatcatt gaatgtaaat       720
     ggttggaatc atcaaatgga ctcggatgga atcatcgaat gggctctaat ggaatcatca       780
     tcaaatggaa tcaaatggaa tcttcgaatg gactctaatg gaatcatcat cgaatggaat       840
     cgaatggaat catcaaatgg actcgaatgg aatcattgaa tgtactcgat tggaatcatc       900
     atcgaatgga atcgagtgga atcctcaaat ggaatcaaat ggaatcatca attggtatcg       960
     aacgcaatca tcatcaaatg gaaacgaatg gaatcatcga atggaattga atgcaatcat      1020
     cttcaaaagg aattgaatgg aatcatcttt gaatagaata aaatggagtc atcaaataga      1080
     atcaaatgga atcatcgtca agtttaatcg agtggaatca tcaaaggaaa tcgagtggaa      1140
     tcattgttga atggaatgga atggaatcaa tgaatagaaa tgaatggaat caccaatgaa      1200
     tggaattgaa tggaatcatc atcatatgga attgaataga atcatcaaat ggactcgaac      1260
     ggaatcatca ttgaatggaa tcacatggaa tcatcatcga atggaatcat acggaaacat      1320
     catcgacggg aactgagtga aatgaaattt ggactcgaat ggaatcatca aatggactcg      1380
     aatggaagtg tcaaatggac ccgaatggaa tcatcatcaa atggaatcga agggaatcat      1440
     cgaatggaat caaaaggaat catcattgaa cgaaaacgaa tttaatcatc taatgcacta      1500
     gaatggaatc atcatcgaat agaattgaat ggaatcatag aatggactcg aatggaatca      1560
     taataaaatg aaattgcatt gaatcttcga atgcacttga atggagtcat catcgaatgg      1620
     aaccaaaagg aatcattgaa tggactcgaa tgcaataatc atcgaaagga atggaaagga      1680
     ataatcaaat gaaatcaatg gaatcatctt caaatggaat cagatggaat catcgaatgg      1740
     acttgaatgg gatcattgaa tggactcgaa tgcaatcctc atcgaatgga attgaatgga      1800
     atcatcgaat ggtctcgaat ggaatcatca tcgaatggaa tcaaatggaa tcattgaatg      1860
     gaattgaatg gaaacatcga atggactcga atggaatcat cttcaaatga aattgcattg      1920
     aatcttcgag tggaatcgaa tggagtcatc attgaatgga atagaatgga atcattgaat      1980
     ggactcgaat ggaataatca acgaatggaa tggaaaggaa tcatcaaaat aaatcaatgg      2040
     aatcatcatc gaatgaaatc aaatggaata gtcaaatggc accgaatgga atcatcatcg      2100
     aaaggaatca aatggaatca tctaacggaa tcgagtggaa taatcattga atgaaatcga      2160
     atggaaacat tgaatggaca taaatggaat catcactgaa tagaatcgaa tggaatcatc      2220
     atcaaatgga attgaataga atcgtcatcg aatggaatcg aatggaatca tcaaacagaa      2280
     tagaatggaa tcatcatcga atggaatcaa ataggatcat tgaatgaaat aaaatggaat      2340
     catcatcgaa tggaattgaa tggcatcatc atcgaatgga atcgaatgga atcatcatcg      2400
     aatgtaattg aatggaatca tcattgaaag gaatcaaatg aattcatcat caaatggaac      2460
     cgaacaaagt catcaccgaa tggaattgaa atgaatcata atcgaatgga atcaaatggc      2520
     atcttcgaat tgactcgaat gcaatcatcc actgggcttc aaaggagtca tcatggaatg      2580
     gaatcaaatg taatcatcga atggactcga atggaatcat catcaaatgg aatcagatgg      2640
     aatcattgaa tggacgtgaa tggaatcatc gaatggacat gaatggaatc atcattgaat      2700
     ggaattgaat ggaatcattg aatggtctcg aatggaatca tcatcgaatg gaatcgaatg      2760
     gaatcattga atggaatcga atggaatcat cgaatggact cgaatggaat catcattgaa      2820
     tggaatcagt gaatggtttt gaatggaatc atcatcgaat ggaattgaat aaaatcggca      2880
     ttgaatagaa tcgaatggaa tcatcaacga atggaatcga atggaatttt catcaaatgg      2940
     aatcgaatgg aatcatcatc gaataaaatc gaatgggatc atcgaatgaa atagaatgga      3000
     atcatcatca aaaagaatca aagtaaaaca aagaatggaa tataacagac tcattgaagg      3060
     gaatcaaatg gaataatcat tgaaaggact caaatatagt tatcatcgaa tggagttgaa      3120
     tggaatcatt taatggactc gactggaatc gttgaatgga ctagaatgga atcatcgaat      3180
     ggaatcaaat gaaatcatgg aatgcacgtg aatggaatca ctgaatggac tcaaatggaa      3240
     tcaacttcga gtggaatcga aaggaaacat cgaatggact cgaatggaat catcatctaa      3300
     tggaatcgaa tggaatcatc agcgaatgga atcgaaagga atcatcatgg aatagaatcg      3360
     aatggaaaca tcgaatggaa tggaatggaa tcatcatgga aaggaatcga agggaatcat      3420
     caaatggaat caacggaatc atcgaatgga attgaaagga atcataatcg aaaggactcg      3480
     aatggaatta tcattgaaag gaatcgaatg gaatcatcaa atggactcga atggaataat      3540
     caaatgaact tcaatggaat catcaaatgg actcgaatgg aatcatcaaa tggactcgaa      3600
     tggaatcatc atcaaatgaa attggatgga ttcgatgaat ggactcgaat ggaatcattg      3660
     aatggactcg aatggaatca tcattgaatt gaatcgaatg gaatcattgg gtggaatcga      3720
     atggaatcat catcgaatgg aatcgaatgg gattatcatc aaatggaatc gaatgggatc      3780
     atcatcaaag gtaatccaat ggaatcaccg aatggtctcg aatgtaatga tcaaatggac      3840
     tcgaatggaa tcaccaaatg gaatcgaatg gaatcatcga aaggactcaa atggaattaa      3900
     tgaatggact tgaagggagt catcaaatga actctaatgg aatcatcatc aaatggaatg      3960
     gaatggaatc atcaaatgga cacgaatgga atcattgaat ggactcgaat gaaatcatcg      4020
     aatggactcg aatggaatca tcatcgaatg gaattgaatg gaatcctcga atagaatcaa      4080
     atgcaatcat caaatggaat cgaacagaat catcatcgaa tggaatcaaa tggaatcatc      4140
     gaatggaatc gaatgcagtc atcgtctagt ggaatcaaat ggagttatca tcaaatagaa      4200
     ttgaatggaa tcatcgaatg gagtcgaatg gaatcatttt tgaatgtcat tgaatggaat      4260
     catcgaatgg aatcatatgg aatcatcgaa tggaattgaa aggatcagca tcgaatgaaa      4320
     tcaaatggaa tcatcaacta atagaatcga atggaatcat tgaatggaaa catcatcaaa      4380
     tggagtcaaa tggaatcatc aaatggtctc gaatggaatc atcatagaat ggaattgaaa      4440
     ggaatcatcg aatggaatcg aatggaatca tcagagaatg gaatttaaag gaatcaccat      4500
     cgaaaggaat tgaatagaat aatcattgaa tggaatcatc atcgattgga atcaaatgga      4560
     atcatcaaca aatggaaaag aatggaatca tcaactaata gaatcaaatg gagaaatcga      4620
     atggaatccg ttggaatcat catcagatgg aaccaaatgc agtcatcatc gaatggaatc      4680
     gaatggaatc atcaaatgga ttagaatgga atcatcatcg aatggaattg aatggaatca      4740
     ttgaatagca tcgaatggaa tcatcgaatg aactcgaatg gaatcattat caaattgaat      4800
     caaatagaat caacatcaaa tggaattgaa cggaatgatc gaattgaatt gaatagagtc      4860
     atcatagaat gaactcacat ggaatcatcg aatggactcg aatagaatca tcatcaaatg      4920
     gaatcgaatg gaatcatcta atagactcga atggaatcat catcgaatgg aatcaaatgg      4980
     aatcaccgaa tgcactcgaa tggaatcatc acagaatgga gtcgaaagga atcatacaac      5040
     agactttaat tgaatcattg aaagtaatcg aatggaatca tattcgaatg gaatcgaatg      5100
     gaatcatcga atggacatga atggaataac catcgaatgg aatcgaatgg aatcatcatt      5160
     gaatggaatc aaatggaatc gtcattgaac agaatcgaat ggaatcatca tcgaatggaa      5220
     tcaaatggaa tggttattga atggaatcga atggaatcat catcgaatgg aaactagtgc      5280
     aatcatcatc taatggaaac gaatggaatc atcaacgaat ggaatcaaat ggaaaaatcg      5340
     aatgggatcc gttggaatca tcatcaaatg gaaccgaatg cagtcatcat aaaatggaat      5400
     caattggaat cctcaaatgg attaacatgg aatctacacc gaatggaatt aaatggaata      5460
     atcgaacaga cttgattgaa gtcatcatca aatggaaacg aatggaatca ttaaatggac      5520
     acgaatggaa tcatcgtgga atggaatcga atggaatcat cgaatggcat tgaatggatt      5580
     catcattgaa tggaatctac tgaaatcata gaatggacac gaatggaatc acccaatgga      5640
     attgagtgga atcatcatcg aatggaatcg aatggaatca tcaaatagac tcgaatgcaa      5700
     tcatcatcga atggaatcaa atgaaatcat aatcgaatgg aatggaaagg aatcatcagc      5760
     taatggagtc gaatggaatc attgttgagt tgaatagaat agaatggagt caccatattg      5820
     aatcaaatgg aaagatcatc gaatggaatc gaagggaatc atcgaatgag attgaacgga      5880
     gtcatcgaat ggaatcgagt ggaatcatcg aatggattcg aatggaatca tcatcgaatg      5940
     gaattgaatg gaatcatcat tgaatggaac cgaatagaat catcatcgaa tggaaccaaa      6000
     aggagtcatc atcgaattga attgcatgga atcatcatca aatggaattg aatggaatca      6060
     tcaaatggaa ttgaatggaa tcatcatcga atgaattgaa tggaatcatg gaatggtctc      6120
     gaatggaatc attatcaaat ggaatcgaat ggaatcaccg aatagaatcg aatggaataa      6180
     tcatcgaatg gactcaaatg gaattatcat caaatggaat tgaatggaat tatcaaatgg      6240
     aattgaatag aatcatcgta tggactcgaa tggaatcatc gaatggaatg gaatggaata      6300
     atcaatgaac tcgaatggaa tcatcattga atggaatcaa atggaatcat tgagtggaat      6360
     tgaatggaat catgatcaaa tggaatcgaa tggaatcatc attgaatgga atcgaaaaga      6420
     atcatcatca attggaattg aatggaattg tcatcaaatg gaatccaaag gaatcatcat      6480
     caaatggaac cgaatggaat catcattgaa tggaaacgaa aggagtcatc atcgaatgga      6540
     atcgcatgga atcatcatcg aatggaatcg aatgaaatca tcatcaaatg gaatctaatg      6600
     gaatcatcga atggaattga atggaatcgc catcaaatga attgaatgga atcatcaaat      6660
     ggtctcgaat ggaatcatct tcaaatggaa tcggatggaa tcatcgcata gaatcgaacg      6720
     taattgtcat tgaatggact caaatggaat caacatcaaa cagaatcaaa cggaattatc      6780
     gaatggaatt gaagagaatc atcgaatgga cttgaatgga atcatcgaat ggaatggaat      6840
     ggaataatcc atggacttga atgcaatcat cattgaatgg aatcgaatgg aatcatcgaa      6900
     tggactcaaa tggaataatc atcgaatgga atagaataga atcatcgaat gaaatcgaat      6960
     ggaatcatca tctaatggaa tcgaatggaa tctccaacga atggaatcca atgtaatcat      7020
     catcgaattg aaaccaatgg attcattaaa tgtactcgaa tggaatcatc aaatggactc      7080
     gaatggactc atcatcaaat gaaatagaat gcaatcatca aatggaatcg aatggaatca      7140
     tcattgaatg aaatcaaagg caatgatcga atggacccaa atggaatcat catcgaatgg      7200
     aatcgaatgg aatcatcgaa tggactcgaa tggaatcatc atcaaatgga atagaaagga      7260
     aacatcgaat ggacttgaat ggaatcattg aatggactcg aatggaatca tcatggaatg      7320
     gaatcgaatg gaatcatcga atgaaatcga gtggaatcat catcgaatgg agtcaaatgg      7380
     aatcatcatt gaatggaatc aaaaggaatc atcattgaat ggaattgaat ggaattatca      7440
     tctaatggaa ttgaagggaa tcatcaacaa attcaatcaa atctagaaat cgaatggaat      7500
     ccgttggaat catcatcaaa ttgaaccaaa tgcagtcatc atcaaatgca atcgaatgga      7560
     atcatcatcg aatggaattg aaaggaatcg tcatcgaatc aaatagaatg gtatcatcga      7620
     atggaataga atggaatcat catcgaaaga aatcaaaggg aatcatcaaa tggaatcgaa      7680
     cggaatcatc taatggaatc aaatgtaata atcattgaat ggaatcgaat ggaatcatcg      7740
     aatagactcg aatggaataa tcgaatggac tcgaatggaa tcatcaaatg gaatcaaatg      7800
     gaataatcga ttggactcga atggaaacat catcaaattg tatcggatgg aatcaatgaa      7860
     gggactagaa ctgaatcatc gaatggacac gaatggaatc atcattgatt ggacaggaat      7920
     ggaatcattg aatggaatcg aaaggaatca tcatggaatg gaatcgaatg gaatcatgac      7980
     cgtatggaat tgaaaggaat catcatggaa tggaatcgaa tggaatcatg atcgtatgga      8040
     attgaaagga atcatcatgg aatggaattg aatggaatca tgaccgtatg gaatcgaatg      8100
     gaatcatcat cgaatggaat tgaatggaat cgaatggaat catcaatgaa tggagtcgaa      8160
     tggagtcatc gaatggagtc ctttggaatc atcatcgaat ggaactgaat gcagtcagca      8220
     tcgaatggaa tcaaatggta tcgtcaaatg gactcgatgg aattatcatc acaaggaatc      8280
     aaatggtatc atctaatcaa ctcgaatgga gtcatctttt agtggaatcg aatggaatca      8340
     tcgaatgcac tagaatggaa tcatcattga atggaaacga aaggaatcat caaaaggact      8400
     tgaatggaat cattgaatgt actcgaatgg aatcaaatgg aatcattgaa tggaccctaa      8460
     tagaatcacc attgaatgga atcgaattga atcatcgaat ggaatcgaat ggaatcatta      8520
     ttgaatggaa ttgaatggaa tcgtcattga atggaattga atggaatcat cattgaatgg      8580
     aatctaatag aatcatcatt taatggaaac gaatggaatc atcaatgaat ggaatcaaat      8640
     ggagaaatcg aatggaatcc gttggaatca tcatcagatg gaattgaatg cagtcatcat      8700
     cgaatggaat tgaaaggaat cataattgta aggaattgaa ttaaatcata gtcgcatgga      8760
     atcaaaagga atcatcatcg aatggagtcg aatggaatca taatttaata gaatcgaatg      8820
     gaatactgaa ttgaatcaaa tggaatgatc atcgaatgga atcgaaggga ttcatcaaat      8880
     aggatcgaat ggagtcatcg aatggaatca cgtcgaatca ttgaatggat tcgaatggaa      8940
     tcatcatcga ttggaatcga atggaaacac catcaaattg aatcaaaggg aatcatcacg      9000
     gaattgaaat gaatagactc atcatcgaat ggattcaaag ggaatcatct attggaattg      9060
     attggaatca tcatcgaatg gaatggaatg gaatcattga atggaatcga atgaaatcat      9120
     cactgaatgg aattgaattg aatcatcgaa tggactctaa tggaatcatc atcgaatgga      9180
     atcagatgga atcatcaaat ggacttgaat ggagtcatca aatggactcg aatagaatca      9240
     ttattgaatg gaaatgaatg gaatcatcga aaggtctcga atggaatcat aatcgaatgg      9300
     aatagaatgg aatcatcgaa tggaatcgaa tggaataatc atcaaaagga atcaaataga      9360
     atcggcatca aatagaatcg aaggcagtca tcatcgaatg gaatcgaatg gaattttcat      9420
     caaatgggat cgaatggaat catcatggat tagaatcaga tgggatcatc gaatgaaaga      9480
     gaaaggatca tcatcaaaaa taatcaaaat aaaacaaaga atagaatcca acggaatcat      9540
     tgaatggaat caaatggaat catcactgaa tggatttgaa tggagtgatt atcgaatgga      9600
     atcgaatgga atcatttaat ggactcaaaa ggaatcattg gactcgaaag ggatcatcga      9660
     atggaatcga atggaatcat catcaaatga aataaaatgg aatgatcgaa tggactcgaa      9720
     tggaatcatc atcaaatgga atcgaatgaa atcatggaat gcactcgaat ggaatcatcg      9780
     aatggactcc aatggaatca atatcgagtg taattgaaag gaaacatcga atggaattga      9840
     atggaatcat tgaatggaat catcgaatgg aataatcatc aaatggaatc gactggaatc      9900
     atcgaatgga cccgaatgga atcaaaagga atcatcaaat ggaatcatca ttgaatgaaa      9960
     tcgaatggaa taatgatgga ataatgatgg aatggagtcg aatggaatca tcatcgaatg     10020
     gaattgaatg gaaacatcat cgaatggaat cgaatggaat catcaatgaa tagaatggaa     10080
     tggaaacatc atcaaatgga atcgaatgga atcatcaatg aaaggaatca attggagtca     10140
     tcgaatggag tctgttggaa tcatcatcga aaggaatcaa atgcagtcat cttcaaatga     10200
     aatcaaatgg aatcatcaaa tggactcgat ggaatcatca tcacatggaa tcgaatggaa     10260
     tcatccaatg gactcgaatg caatcatcaa atggaactga atgcagtcat catcgaatgg     10320
     aatcatcaaa tggattagaa tggaatcatc atcgaatgga attgaatgga atcatcgaat     10380
     ggactcgaat ggaatgacca tcaaatggaa ttgaatatag tcataatcaa atggaatcaa     10440
     atggaatcat catccatagg attctattgg aacaatcatt gaatagaatc gaatggaatc     10500
     accgaattga atcaaatgga aggatcatga aatggaatca aagggaatca tcaaatggga     10560
     tcgaacggag tcatcgaaag gaatcgagtg gaatcatcga aaggattcga atggaatcat     10620
     catcaaatgg aattgaatgg aatcatcgaa tggaaacgaa tgcaatcatc attgaatgga     10680
     ctcgaatgga ttcatcaaat ggagtcgagt gtaatcatca ttgaatagaa ttgaatggaa     10740
     ttatcaaata gcatcgaatg gaatcgtcaa atggagtcga atggaatcat cgaatggact     10800
     cgaatggaat catcatt                                                    10817
//


spacer
spacer