spacer

EBI Dbfetch

ID   ABBA01065750; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; HUM; 4535 BP.
XX
AC   ABBA01065750;
XX
PR   Project:PRJNA19621;
XX
DT   05-JUN-2007 (Rel. 92, Created)
DT   23-AUG-2014 (Rel. 121, Last updated, Version 4)
XX
DE   Homo sapiens CTG_1103276892245, whole genome shotgun sequence.
XX
KW   WGS.
XX
OS   Homo sapiens (human)
OC   Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia;
OC   Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae;
OC   Homo.
XX
RN   [1]
RC   Publication Status: Online-Only
RP   1-4535
RX   PUBMED; 17803354.
RA   Levy S., Sutton G., Ng P.C., Feuk L., Halpern A.L., Walenz B.P.,
RA   Axelrod N., Huang J., Kirkness E.F., Denisov G., Lin Y., Macdonald J.R.,
RA   Pang A.W., Shago M., Stockwell T.B., Tsiamouri A., Bafna V., Bansal V.,
RA   Kravitz S.A., Busam D.A., Beeson K.Y., McIntosh T.C., Remington K.A.,
RA   Abril J.F., Gill J., Borman J., Rogers Y.H., Frazier M.E., Scherer S.W.,
RA   Strausberg R.L., Venter J.C.;
RT   "The Diploid Genome Sequence of an Individual Human";
RL   PLoS Biol. 5(10):E254-E254(2007).
XX
RN   [2]
RP   1-4535
RA   Levy S., Sutton G., Ng P., Feuk L., Halpern A.L., Walenz B., Axelrod N.,
RA   Huang J., Kirkness E.F., Denisov G., Lin Y., MacDonald J.R., Wing A.,
RA   Pang C., Shago M., Stockwell T.B., Tsiamouri A., Bafna V., Bansal V.,
RA   Kravitz S.A., Busam D., Beeson K.Y., McIntosh T.C., Remington K., Gill J.,
RA   Borman J., Johnson J., Resnick A., Rogers Y.-H., Frazier M., Scherer S.W.,
RA   Strausberg R.L., Venter J.C.;
RT   ;
RL   Submitted (18-MAY-2007) to the INSDC.
RL   J Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850,
RL   USA
XX
DR   MD5; c27f442ea3734812df0257576e469eff.
DR   ENA; ABBA010000000; SET.
DR   ENA; ABBA000000000; SET.
DR   ENA-CON; DS486227.
DR   ENA-CON; GL000186.
DR   BioSample; SAMN02981236.
DR   Ensembl-Scaffolds; ABBA01065750.1:1-4535; homo_sapiens.
XX
CC   DNA Donor Name: J. Craig Venter | Date of Birth: October 14, 1946 |
CC   Sex: Male | Ethnicity: Caucasian | Descent: European - England
CC   This WGS project represents a composite haploid version of the
CC   genome where the highest scoring allele contained is represented in
CC   the consensus sequence.  The number of contigs may differ from
CC   those in the PLoS Biol. paper (PloS Biology 2007 5: e254) because
CC   some short sequences were found to be foreign and thus were
CC   suppressed. Scaffolds DS486015-DS490530 represent the 4528
CC   scaffolds that are discussed in the paper.  There are fewer than
CC   listed in the paper because 12 of the original were determined to
CC   be foreign, so were omitted here.  Scaffolds DS490531-DS490620 are
CC   the remaining multi-component scaffolds, not in the set of 4528.
CC   The chromosomes are records CM000462-CM000485, assembled from the
CC   scaffolds.
XX
FH   Key             Location/Qualifiers
FH
FT   source          1..4535
FT                   /organism="Homo sapiens"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /sex="male"
FT                   /dev_stage="adult"
FT                   /db_xref="taxon:9606"
XX
SQ   Sequence 4535 BP; 1855 A; 358 C; 1360 G; 962 T; 0 other;
     aggaatgaag cgaaatgaaa tggaatggaa ttgaaaggaa agaatgcatt ggaatggtgt        60
     gaaatggatt cgaattgaat ggaattgaat ggaatgaaat agaatgcaat cgactggaat       120
     ggaattgaca ctaatggaat gggctggaaa aatttgaatc gaacggtttg gaatagaaca       180
     aaaaggaatg gaatggaatg gaacagtatg gagtagaatg gaatggagtc gaatggaatg       240
     gaaccaaaaa ccatggaatt gaatgcaatc aaaaggatta gaaaaatatg gatgttaatg       300
     gaaagatatc gaatggaaag gaatggaata gaatagaccc agatgcaatg gactggaatg       360
     gaaaggtatc aaatggagtg gactggagtg gaatggacac gaatgaaatg gaaatgaaag       420
     gaattgaatg gaatggaaag caatggaatg gaatggaatg gaataaaata gaaaggaata       480
     gaatggaata gaatcagatg gaacggaatg gaattcaata gagtcgaatg gaatagaatc       540
     gaatgcaatg gcatcaaatg aaatggaatc gaatggaatg gacactaatg gaatagcaac       600
     gaatggaatg gtatcgaatg gaatggaatg gacgcaaatt aatggactcg aatagaatgg       660
     actcaaacag aattgactca aaaggaatgg tttcgaatgg aatttattcg aatagaatgg       720
     aatggaatgg aattcaatag tatggaatgg attcgaatgg aatggaatcg aatggaatgg       780
     gcaggatttg aatggactgg aaaagagcgg acacgaatgt aatggattgc aatgtaattg       840
     attcaaatgg atgcaatcga atggcatgta atcaaatgga atagaatgga atggaacgga       900
     atggaatgga atggaattga aaggactcaa atataatgga cctcaatgga atggactcaa       960
     atagaatgga ctctgaacga atggtctcaa atggaattca ttcaaataga ttcgaattga      1020
     attgaatgaa agagtttgta atggaatcga atggaatgga atctactgga gcagaaagga      1080
     atggactgga atagaatgga ctcgaatgta attgattgta atgtaataga ttcaaatgga      1140
     atggaaacta atgaaacata atcaaatgga aaggaatgga aagcaatgga atggaataga      1200
     atggaatgca atagactgga aaagagtgga atctagagga atggaatcga atggaatgga      1260
     attgactgga actaaatgga aatgaatgga ttggaatgga atggaatgga atggagtgga      1320
     atgaaacata ctcgaataga atggaacata cccgaatgga atggagtcaa atgaagtgga      1380
     atcgaatgga atggaattga atagaatgga aatgaatgaa atagaaagga aaagaatgga      1440
     atggaaggta agggaaagat atcgaatgca atgcaatggc acataatgga ctcaaacgga      1500
     atggactgga atggggcaga ctcgaatgga atccactgga gtggaatgga ctcgaatgga      1560
     atggaaacga atttaatgga atggaatgga agggaaagga atagaatgga gtggattcag      1620
     agagaaagga atggaatgga atgcatgtaa atggaacaga atcgaatgga atggaaagta      1680
     atggaatgga atggactcga atggaatgga ctcgaaagga ataaaatcaa atgaaatggc      1740
     atcgaatgga atagaattta atggaatgga cacaaatgac atggaatcaa atggaaagga      1800
     ctctaataga atggaattga aagaaatggt ctcaaatgaa atttatgtga ttagaatgga      1860
     atcgaatgaa attaaatagt atggaaggga atcgaatgga aaggaattga ctaaaatgga      1920
     ctggaataaa acagagtcga attcaatgaa ttgaaacgtc attgactcga atagaaagga      1980
     atcgaatgga atggaaatga acagaatgga ctggaatgga atggacagga atggaacgga      2040
     ctctaatgga atggattgca atgtaattga ttcgaatgga atggaaatga ttggaatgta      2100
     atccaactga taggaatgga aatcaatgga atggaagaga aggcaatgca atggaatgga      2160
     atggagtcga atcaactgga atggaattga atggaatgga attgaatgga atggaatcga      2220
     atggaatgga ctggaatgga atggaattca acggaatgga ctggaacaaa atggaatgga      2280
     acagattgga atcaaaagga acggaataga atggaataga atggactcga atggaatgca      2340
     gtcaaatgga atggaatcga atggaatgga actgaatgga attgaaagga atggaatgga      2400
     atagagtaca atgtaaagat atcgaatgga agggaatgga atggaatgga ctcgaatgca      2460
     atggactgga atggacagga aaggaatgga ctggattgga aaggatttga agggaatgtg      2520
     ctagagtgga acggactcga atggaatgga aacgaatgga atggaatgaa atggaatgga      2580
     atggaatgga aaggaatagc ctggaatgaa atgggatgga aagcaattga atggaatgga      2640
     atggagtcga atggaataaa atcgaatgga atggcatcga atggaatgga gtggaatgga      2700
     atggactcga atggaatgga cccgaatgga atagaataga atggaatgca atcgaattga      2760
     atggaatgga atggattgga atggacccaa agattatggg cttgaaagga atggactcaa      2820
     atagaatgga ctcaaaaaga atggtctgga atcgaattta ttcgaataga actcaatcga      2880
     atggaatgaa atagtatgga atgtgatcga atggaatgga atcgaaatgt atggaccaga      2940
     atagaatgga atggaataga ttggactcga aattaatgga ttgcaatgtg attgattcga      3000
     atggaatgga atcgaatgga aagtaaacaa atgaaaagga atgcaattca aaggaatgga      3060
     atagaatgga atgcaatgga atggaatgga atggactgga atcgatggga atggagtcaa      3120
     atggaaaggt atcaaatgga atggaatcga atggaattga ctcgaatgga atggacttgg      3180
     aaaaaaagga atcaaatgga ttggaatcga attggaagga aggaaatgga atggaatgga      3240
     atggaactga atggaatgga gtcgaatgga gtgggttcga atggaatgga atcaaatgga      3300
     atgcagttga atggaatgga atggagtata atgggaaaga tatcgaatgg aatggaatgg      3360
     aatggactcg aatggaatgc actggaatgg aatggattag aatggaatgg actgtattgg      3420
     aattgactcg aatgtaatgg actggagtgg aatagactcg aatggattgg aaaccactgg      3480
     aatggaatgc aaggaaatat aatggaatgg aatcagatag aatgaaatgg aatgtaatgg      3540
     agtcgaatta aatagaatct aatggaatgg catcaaatgg aatggaatga aatggaatag      3600
     agtgtaatgg actcgaatgg aatggatttg aatggaatgg aaaagaatgg aatgccatcg      3660
     aatggattgg aatggaatgg acccaaatgt aatggactca aatggaatgg actcaaattg      3720
     aatggacttg aaaggaatgg gctcgaatgg aattcattcg aatagaattg aatcgaaagg      3780
     aatgcagtag tatttaatgg aattgaatag aatggaatcg catggaatgg accacaatgg      3840
     aatggactgg aatagagcag actcgaatat aatggatgga atgtaaagca aaggaatgca      3900
     atcaaatgga atggaatgga aaccaatgga aggcagtaga atgcaatgca atggaatgga      3960
     ggggaatcat gtggaatgga atcgaaaggg atggaattga atggaatgga cttgaatgga      4020
     atgtactcga atggaatgga ctgaaacaaa aaggttttga acggattgga ttcaaacgga      4080
     atggaatgga gtggaatgga ttggaatgga atagagtgga atggtgtcaa atggaatgga      4140
     accgaatgga atgcaatcga tggaatggaa ttgatggaat cgaaaggaat agagtagaat      4200
     ggattgcaaa agaaagttat tgaacagaat ggaattgaat ggaatggact ggaatggact      4260
     caaatggaat gaacgggagt ggaatggact tgaatggaat gggctggagt ggaatgcact      4320
     ctaatgaaat tgaaacgaat ggaaaggaat agactggaat ggaatgggat ggaagggaat      4380
     taatggaatg aaatggaatg taatggaatg gaatggaatg gaatttaacg gaatggaatg      4440
     gagtcgaatg gaagaaaatc aaatggaatg acatcgaatg gaatggaatg gaattgactc      4500
     gaatggaacg gacttgaaac gaatagaaat gaaag                                 4535
//


spacer
spacer