EBI Dbfetch

ID   ABBA01016545; SV 1; linear; genomic DNA; WGS; HUM; 6568 BP.
AC   ABBA01016545;
PR   Project:PRJNA19621;
DT   05-JUN-2007 (Rel. 92, Created)
DT   23-AUG-2014 (Rel. 121, Last updated, Version 4)
DE   Homo sapiens CTG_1103276990835, whole genome shotgun sequence.
OS   Homo sapiens (human)
OC   Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia;
OC   Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae;
OC   Homo.
RN   [1]
RC   Publication Status: Online-Only
RP   1-6568
RX   PUBMED; 17803354.
RA   Levy S., Sutton G., Ng P.C., Feuk L., Halpern A.L., Walenz B.P.,
RA   Axelrod N., Huang J., Kirkness E.F., Denisov G., Lin Y., Macdonald J.R.,
RA   Pang A.W., Shago M., Stockwell T.B., Tsiamouri A., Bafna V., Bansal V.,
RA   Kravitz S.A., Busam D.A., Beeson K.Y., McIntosh T.C., Remington K.A.,
RA   Abril J.F., Gill J., Borman J., Rogers Y.H., Frazier M.E., Scherer S.W.,
RA   Strausberg R.L., Venter J.C.;
RT   "The Diploid Genome Sequence of an Individual Human";
RL   PLoS Biol. 5(10):E254-E254(2007).
RN   [2]
RP   1-6568
RA   Levy S., Sutton G., Ng P., Feuk L., Halpern A.L., Walenz B., Axelrod N.,
RA   Huang J., Kirkness E.F., Denisov G., Lin Y., MacDonald J.R., Wing A.,
RA   Pang C., Shago M., Stockwell T.B., Tsiamouri A., Bafna V., Bansal V.,
RA   Kravitz S.A., Busam D., Beeson K.Y., McIntosh T.C., Remington K., Gill J.,
RA   Borman J., Johnson J., Resnick A., Rogers Y.-H., Frazier M., Scherer S.W.,
RA   Strausberg R.L., Venter J.C.;
RT   ;
RL   Submitted (18-MAY-2007) to the INSDC.
RL   J Craig Venter Institute, 9704 Medical Center Drive, Rockville, MD 20850,
DR   MD5; e21dce8e72511aac64b5055b41e16167.
DR   ENA; ABBA010000000; SET.
DR   ENA; ABBA000000000; SET.
DR   ENA-CON; KI270438.
DR   ENA-CON; GJ212160.
DR   ENA-CON; GJ211997.
DR   ENA-CON; GJ212123.
DR   ENA-CON; DS486572.
DR   ENA-CON; GJ211960.
DR   BioSample; SAMN02981236.
CC   DNA Donor Name: J. Craig Venter | Date of Birth: October 14, 1946 |
CC   Sex: Male | Ethnicity: Caucasian | Descent: European - England
CC   This WGS project represents a composite haploid version of the
CC   genome where the highest scoring allele contained is represented in
CC   the consensus sequence.  The number of contigs may differ from
CC   those in the PLoS Biol. paper (PloS Biology 2007 5: e254) because
CC   some short sequences were found to be foreign and thus were
CC   suppressed. Scaffolds DS486015-DS490530 represent the 4528
CC   scaffolds that are discussed in the paper.  There are fewer than
CC   listed in the paper because 12 of the original were determined to
CC   be foreign, so were omitted here.  Scaffolds DS490531-DS490620 are
CC   the remaining multi-component scaffolds, not in the set of 4528.
CC   The chromosomes are records CM000462-CM000485, assembled from the
CC   scaffolds.
FH   Key             Location/Qualifiers
FT   source          1..6568
FT                   /organism="Homo sapiens"
FT                   /mol_type="genomic DNA"
FT                   /sex="male"
FT                   /dev_stage="adult"
FT                   /db_xref="taxon:9606"
SQ   Sequence 6568 BP; 2419 A; 431 C; 2328 G; 1390 T; 0 other;
     tgaaaggagt agagtggagt ggagtgtaaa gcagtggaat ggaatggaat aggaaggaat        60
     ggaaatgaac ggaatggagt ggtttggagt ggaatgcaat ggaatgcaat ggaatggaat       120
     gcaatggagt ggaatggact tgaatggaat ggacttgtgt ggaatggact agagtcaatt       180
     ggactagaat ggaatggact cgagtggaat ggactcaggt cgaatggact cggatggaat       240
     ggactcgaat ggaatggaca cgaatgggat ggaatcgaat ggaaatgaat ggaatggaat       300
     gccatggaat ggaatggaat agactcgaat gaaatggact ggaatggaat ggactcgaat       360
     ggaatggaat ctaatagaag ggaatggaat ggaatggaat acaatggaat ggaatgaact       420
     cgaatggaat ggactagaat ggaatggatt cgaatggaat ggactcgaaa agaaaggacc       480
     tgaatcgaat ggaatcaaat gcaatggaac ggaatggaat ggaatggagt gtaatggaat       540
     ggactcaaga gaactggact cgaatggaat ggacttgaat ggaatggact tgagtcaaag       600
     ggacttgcat ggaatggact cgatcggaat ggagtcgaat gaaatggtat tcactggaat       660
     agaatggaat ggaatggaat ggaatggaaa ggaatggaat ggaatggaat ggaatggaat       720
     ggaatggaat ggactcggat ggaatggatt tgaatggaat ggactcgaat ggaacggaat       780
     cgaatggaat ggaatcgaat gaaatggaat ggaatgggtt tgaatggaat ggactcgaat       840
     ggaatggaat cgaatggaat ggaatcgaat gaaatggaat tgaatggaac taaatggaat       900
     ggaatcaaat ggaatggaaa ggtctccttg ggaattgggt cgtatgtact ggacaggaat       960
     ggaatttact ggaatggaat ggactcaaat gtaattaaat catatggaat ggattggaac      1020
     agaatgtact cgaatggaat ggaatagaat ggaatggaaa caaatggaat ggaattgaat      1080
     tgaatggact ccaatgaaat gcaatagaat ggaatggaat cgagtggcaa tgaatggatt      1140
     tgaatggaat gctgtgaagt ggagtttagt ggattgggat ggagtggaat ggaaaggaat      1200
     gggaagaaat ggaactgaac ggaatggagt ggtgtgtagt gaagtggtat ggagtggaat      1260
     gaaatggaat cgaatggaat tgggtgaagt ggaatggaat gcaatggaat gcaactgaga      1320
     ggagtggagt ggaatggaat ggaacggaat ggaatggaat ggagtagggt ggagtggagt      1380
     ggagaggaat ggagtggaat ggagtggact agagtagagt gcagtggaat ggaatggagt      1440
     ggagtggagt ggagcatatt agaagggagt ggaatggagt ggagtggaat ggaacagagt      1500
     ggagtggagt ggaatggaat ggaaaggaat cgaatggaat gaagtggagt ggaatggtat      1560
     ggaatggaat ggaatgaaat agaatggact cgaaaggaat ggactcaaat gcaacagact      1620
     ggaatggaat ggactgcaat ggaatggact ggaatgtaac ggaatggaat ggattggaat      1680
     caaatggaat gtaatcgaat gaaatggaaa ctaatggaat ggcatagaat ggaatcgaat      1740
     ggaatgtgtt gaagtggagt ggagtggact ggaatggagt ggaatggaat ggaatggaat      1800
     ggagtggagt ggagtagaat ggagtcaagt ggagtggagt ggagtggctt ggagtggagt      1860
     tgaatggaat ggaatggaat gggatgcaat ggaatggact gcactgcaat tgaacggact      1920
     cgaatggaat ggacgggaat ggaatcgact ggaatggaag ggacttgaat gcaatggact      1980
     caaacggagt ggaatgaaat taaatgaaat cgaatggcaa ggaatcgaat ggaatggaat      2040
     caagtggaat agaatcaaac agcatcaaat ggaatcaaat ggtatcaaat ggaatgtggt      2100
     gatgtggggt ggagaggagt ggatttgagt ggaatggaat ggggtggaac acaattgaat      2160
     ggagtagatt ggagtgaagt gctattgagt ggaatggaat ggaatgggaa ggaatggaac      2220
     tgaatggagt ggtgtggaat ggagtggagt gcagtggagt ggagaggaat ggaattgaat      2280
     ggagtggtgt ggaatggaat ggagtggagt ggagtggaat ggaatggaat ggaatgaaat      2340
     agagtggagt ggagtggaat ggaatgcaat ggaatagaat gaattaaaat ggaatgggct      2400
     cgaatggaat tggctcaaat ggaatggact tgaagggaat gcatttgaat ggaatgaaat      2460
     cgaatggaat agattggaac ggaatggaat cgattggaat ggaatcaaat ggaatggaat      2520
     cgaatagcat cgaatggaat tgaatggatt tctgtgacgt ggagtctatt ggagtggaat      2580
     ggagtggaat ggaatggggt ggaattgaaa tgaatgcagt gaagtggaga ggagtggaat      2640
     ggaatggaat gtgaaggaat tggattgaac ggaggggaat agaatggagt ggagtggagt      2700
     ggaatgcatt ggaatgtaat ggaattaagt ggagtggagt ggagtgcaat gtaatggaat      2760
     ggaatggaat ggaagggatt ggcatggagt ggatgggaat ggaatggaat ggactggagt      2820
     gcaatagact cgaatgaaat gctatcgaat ggaatggaat ttaatggaat ggtctgtaat      2880
     ggaatggagt cgtatggatt gggttcgaat ggaaaggaat caaatggaat acaatcgaac      2940
     ggaatggaac caaatggaca ggaatcaaac tgaatggaat cgaagggaac agaatcgaaa      3000
     ggaatggaat caaatggaat ggaatcgaat agaatggcaa cgaatggtat cgaatggaat      3060
     gtggtgaagt ggaggggaga ggtgtggtat gaagtgcaat ggaatgggat ggaatggaat      3120
     tcaatggagt tgaatggagt cgaatggaat ggaatgcaat ggaatgcaat gtaatggaaa      3180
     gaaaaagaat agaatggaat gcactcgaat ggaatgtagt tgaacggaat ggactcgaat      3240
     ggaatggagt gcaatggaat gaactggaat ggtatggact tgaaaggaat ggactggaat      3300
     ggaatggact ggaatggaat ggaattgaat agaatggaat cgaatggaat ggaatcgaat      3360
     ggattgtaat tgaatggaat ggaatggaat ggaatggaat ggaatagagc ggaatggagt      3420
     cgaacgggat ggaaatggat ggaatggaat cgaatgcaat ggaatagaat acaattgaat      3480
     agaatggaag ggaaaggaat ggcatcgaat agcatcgaat ggaatgcagt gaagttgagt      3540
     gcaattgagt ggagtggtgt ggaaaggaaa gaggtggaat ttaactgaat ggagtgcaat      3600
     ggaatgaaga agaattgagt tgaatgttat ggaatgagaa ggaatgcaat ggaatggaat      3660
     ggagtgcagt ggtttggagt ggaatggaat cgaatggaat tgtgtgatat agcgtggaat      3720
     ggagtggagt ggagtggaat gtaatggaat agagtcgagt ggagtagagt gcagcggact      3780
     ggaatggagt ggaatggaaa ggaatggagt agaattgtgt ggagtagagt ggagtgctat      3840
     gcgatggaat agaaagaaat ggattggatt ggggtggagt gcagtggaat ggaatggaat      3900
     gtgtagaaac ggaatgcggt ggagtggaga ggaaaggagt ggaatgaaat ggagtttact      3960
     gaaatggaat ggaaaggtat ggagtggagt ggagtgttgt ggagtggagt ggagtggaat      4020
     ggaatggaat gaaatggaaa ggaatggact ggaatgaaat ggaatcgact ggaatgaaat      4080
     ggaatcggat ggaaggcatc gaacggaatg gaatcaaatg gaattgaata aagtggaatg      4140
     gaatcaaatt gaaaggaaac gaaaggaatg gaatcgattg gaaaggaatc aacaacatcg      4200
     aatggaattg aaaggaaagt ggtgaagtgg agtggagagg aatggagagg aaaggaaaag      4260
     ggtggaatgc aattgaatgg agtggagtgg agtggaatgg agtggaatgg gaaggattgt      4320
     tattgaatgg actggagagg agtgcagtgc aatggaatgg aatggaatgg agtggagtgg      4380
     aatggaggag actggaatgc aatggaaagt ataggagtgg agtggaatgg aatggacttt      4440
     aatggaatgg aatggacacg aatggaatgg actcgaatgg aatgggctcc gatggaatga      4500
     gatcacatgg aatgggctcg aatggaatga aatcgaatgg aatgggatcg aatgaaatag      4560
     aatcgaatgg aatggatcaa atggaatgga atagaataca aaggattcga attgaatcga      4620
     atggaatcga aatgaatgcg gagaagcgga gtggactgga gtggaatgga gtggaaagaa      4680
     atgggatgca atggatttga aggtagttta gtgccgtgga gtggaaagga gtggaatgga      4740
     atggactcga atggaatgga ctcgaatgga atggaatcaa atggaatgga atggagtgga      4800
     atgcagtgat aacgaatgta atggaatgga aaaaatggac tcgaatgaaa tggacttgaa      4860
     tggaatggac atgaacgtaa tggcctcgaa tggaatcgat ttgaatggaa aggactcgaa      4920
     tggaatggac tccaatggaa tggacacgaa aggaatggaa tcgaagggaa cggaatcgag      4980
     tggaatggaa tcgaatggaa tgcaatggaa tggaatgcaa tcgaatagaa tggaattgaa      5040
     tggaatagac cggaatggaa tggactcgaa ttcagtggaa ttgagaggaa tcgaaaataa      5100
     tgaaatgtaa tcaaatggaa tggaaaagaa aggaatggaa tcgaatcgaa tgaaatggaa      5160
     ttgaatggaa tgaaatcgaa tggattagaa ttgaatggca tggaaaggaa tggatggaat      5220
     ggaatgcact caaatggatt tgactggaat ggaatggact ggaatggaat ggacacgaat      5280
     ggaatggact ggaattgaat gaatggaatg gaatgcaatg caatggaatg gaatggaatg      5340
     gaatggactc gaatggaatg cactcgaata gaatggacag gaatagaaag gactcgaatg      5400
     gaacggaatc aagtggaatt gactggaatg gaaatgactg gaatgaaatg aactggaatg      5460
     gaatggaatg gaattgaatc gaacagtctg gaatggaatg caattgaatg gaatggaaaa      5520
     gaatggagca taattgcttg gataggaagg taatggaatg gaattgaata cactggaatg      5580
     gaatggaatc gattacaaag gaatgtcatc gaatggtatg gaatggaatt caaatgaatg      5640
     gaatggaatg gaatggaatc gaatgaaatg gactggaatg gaatgaactc gaatggaatg      5700
     caatcgtatg gaatggaatc gaatggaatg gaatcaaatg gaatggaata gaaatgaaag      5760
     gaatcgaact gaatggaatg gtatcgattg gaatagaatc gaatggagtg gaatggaatg      5820
     gaagggaaag caatcgattt aaatggaatg gaatggaata gaatagaatg gaatggaatc      5880
     aaatacaatg gaaacgaatg gactggactg gaatggaatg gacttgaatg gattggactg      5940
     gaagggaatg gactcgaatg cactggaaac gaatggaatg gaatagaatg gaatggattg      6000
     caatggaatg aaatgaaatg gaatggaatg gactggaatg gaatggaatc gaacgtaatg      6060
     gactcgaata gaaaggaatg gataggaatc gaatggactt gaatggaatg ggctcgaata      6120
     gaatggactg gaatagaatg gacatgaatg gaacggaatc gaatggaatg gaatccaatg      6180
     caatggaatc aaatgaaatg gaattcaata gaaaggaatc aaatggaatg gagtggaatg      6240
     caatggattc gaaaggaatg gaatcgaatg gaaaggaatc gaatggcatt gaatagaatc      6300
     aaatggaatg cggagaagtg tagtgaagtg gagtggattg gagtcgaatg gaatggggtg      6360
     gaattgaatt gaatggagtg aagaggagtg gagtgaaatg gaatgggatg gaatggaatt      6420
     gaatggagtg cagctaagtg gagtggaatg tattgaattg gaatggaatg ggaaggaatg      6480
     gaattgaaag gagtagaatg gagtgaagtg gactggaatg gagtggattg cagtggattg      6540
     aagtggaatg gaatgaaata gaatggaa                                         6568